More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4133 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_5295  sodium/hydrogen exchanger  73.52 
 
 
661 aa  939    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4109  sodium/hydrogen exchanger  71.82 
 
 
661 aa  864    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.324646  normal  0.0690123 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3810  sodium/hydrogen exchanger family protein  66.82 
 
 
680 aa  815    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.162531 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1520  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  58.25 
 
 
669 aa  679    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418182  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0414  putative glutathione-regulated potassium-efflux system K+/H+ antiporter transmembrane protein  57.29 
 
 
659 aa  672    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0507155 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0530  sodium/hydrogen exchanger  57.1 
 
 
678 aa  699    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.191923  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3101  potassium efflux system protein  58.25 
 
 
669 aa  679    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0296  sodium/hydrogen exchanger  57.45 
 
 
659 aa  676    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0603  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  58.25 
 
 
669 aa  679    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3491  potassium efflux system protein  99.7 
 
 
661 aa  1296    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3417  potassium efflux system protein  52.32 
 
 
652 aa  635    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00166015  normal  0.19535 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0360  TrkA-N:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  59.3 
 
 
659 aa  735    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0771  potassium efflux system protein  57.88 
 
 
663 aa  683    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6115  Sodium/hydrogen exchanger  56.84 
 
 
668 aa  695    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1906  potassium efflux system protein  54.65 
 
 
660 aa  669    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0070  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  58.25 
 
 
669 aa  679    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0492  potassium efflux system protein  57.93 
 
 
663 aa  684    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491444  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4133  potassium efflux system protein  100 
 
 
661 aa  1299    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.477795 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0155  sodium/hydrogen exchanger  78.67 
 
 
661 aa  971    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0602  sodium/hydrogen exchanger  56.21 
 
 
667 aa  676    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616152  normal  0.0415752 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4238  sodium/hydrogen exchanger  70.73 
 
 
656 aa  922    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0181  sodium/hydrogen exchanger  66.98 
 
 
665 aa  799    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0587  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  58.25 
 
 
669 aa  686    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4900  potassium efflux system protein  70.85 
 
 
664 aa  883    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4116  putative glutathione-regulated potassium efflux system protein  56.36 
 
 
666 aa  675    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1611  sodium/hydrogen exchanger  54.15 
 
 
660 aa  667    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0308  sodium/hydrogen exchanger  59.21 
 
 
674 aa  727    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512225  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2171  sodium/hydrogen exchanger  56.14 
 
 
668 aa  694    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2948  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  58.25 
 
 
669 aa  679    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.248455  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2796  sodium/hydrogen exchanger  56.14 
 
 
668 aa  694    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0879164 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2703  sodium/hydrogen exchanger  56.95 
 
 
670 aa  687    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4786  potassium efflux system protein  82.9 
 
 
661 aa  968    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2845  sodium/hydrogen exchanger  57.25 
 
 
670 aa  689    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0613147  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2785  sodium/hydrogen exchanger  56.14 
 
 
668 aa  694    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0657605  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0269  sodium/hydrogen exchanger  56.69 
 
 
659 aa  656    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0332  sodium/hydrogen exchanger  55.91 
 
 
667 aa  680    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0880  sodium/hydrogen exchanger  54.6 
 
 
655 aa  605  9.999999999999999e-173  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.19448  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1968  potassium-efflux system protein  48.99 
 
 
661 aa  532  1e-150  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0539  antiporter-2, CPA2 family monovalent cation/proton antiporter  50.55 
 
 
658 aa  533  1e-150  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1636  sodium/hydrogen exchanger  48.99 
 
 
661 aa  532  1e-150  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000235169 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  38.28 
 
 
662 aa  476  1e-133  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1976  sodium/hydrogen exchanger  41.42 
 
 
666 aa  456  1e-127  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0132674  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  41.03 
 
 
650 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2956  sodium/hydrogen exchanger  38.5 
 
 
654 aa  442  1e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356807  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01391  Kef-type K+ transport system, membrane component  39.25 
 
 
720 aa  426  1e-118  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1270  sodium/hydrogen exchanger  39.27 
 
 
657 aa  426  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  39.58 
 
 
649 aa  429  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  39.25 
 
 
648 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3263  sodium/hydrogen exchanger  40.12 
 
 
653 aa  423  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.538739 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  39.07 
 
 
648 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1647  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  40.09 
 
 
648 aa  422  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1468  potassium efflux system protein  39.1 
 
 
648 aa  421  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2623  potassium efflux system protein  40.4 
 
 
648 aa  419  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2690  potassium efflux system protein  40.4 
 
 
648 aa  419  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  0.0000490638 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1159  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  41.25 
 
 
648 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2867  sodium/hydrogen exchanger  39.06 
 
 
649 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  40.03 
 
 
648 aa  419  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1760  sodium/hydrogen exchanger family protein  40.8 
 
 
654 aa  412  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303253  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1499  potassium efflux system protein  39.1 
 
 
648 aa  411  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1593  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  38.7 
 
 
655 aa  407  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2614  potassium efflux system protein  39.26 
 
 
649 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3143  potassium efflux system protein  38.92 
 
 
649 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3967  Sodium/hydrogen exchanger  43.13 
 
 
570 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  36.28 
 
 
666 aa  352  8.999999999999999e-96  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1249  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  35.34 
 
 
572 aa  347  6e-94  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  35.11 
 
 
697 aa  344  2.9999999999999997e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  34.86 
 
 
666 aa  340  5e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000714201 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  34.88 
 
 
674 aa  340  7e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  34.53 
 
 
658 aa  338  2.9999999999999997e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000381991  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0784  sodium/hydrogen exchanger  37.04 
 
 
665 aa  334  2e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1519  sodium/hydrogen exchanger family protein  37.3 
 
 
579 aa  334  4e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.49267  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3734  sodium/hydrogen exchanger  37.96 
 
 
591 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.319534 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2194  potassium efflux system protein  40.11 
 
 
574 aa  330  6e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2236  sodium/hydrogen exchanger  34.52 
 
 
666 aa  329  1.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  34.19 
 
 
672 aa  326  8.000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1457  K+ efflux antiporter, putative (KEA1)  35.9 
 
 
583 aa  325  1e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  31.49 
 
 
682 aa  320  7e-86  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0275042 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  34.78 
 
 
670 aa  319  1e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000025266  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2280  sodium/hydrogen exchanger  40.7 
 
 
590 aa  319  1e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4668  sodium/hydrogen exchanger  39.48 
 
 
594 aa  314  2.9999999999999996e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0852287  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4016  sodium/hydrogen exchanger  33.23 
 
 
775 aa  313  5.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00920037  hitchhiker  0.000000797462 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1631  sodium/hydrogen exchanger  33.23 
 
 
665 aa  311  2e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  32.38 
 
 
636 aa  310  5e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0767  sodium/hydrogen exchanger family protein  35.16 
 
 
539 aa  310  5.9999999999999995e-83  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000529307  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4634  sodium/hydrogen exchanger  37.78 
 
 
630 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0136405 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2090  sodium/hydrogen exchanger  37.43 
 
 
666 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.236107  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1735  sodium/hydrogen exchanger  36.43 
 
 
593 aa  307  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5097  sodium/hydrogen exchanger  37.04 
 
 
630 aa  306  7e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 
741 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  29.29 
 
 
671 aa  303  5.000000000000001e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  35.8 
 
 
668 aa  303  6.000000000000001e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  32.13 
 
 
656 aa  302  1e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0885  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  33.63 
 
 
578 aa  302  1e-80  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2079  Sodium/hydrogen exchanger  34.26 
 
 
539 aa  301  3e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0805  sodium/hydrogen exchanger  32.33 
 
 
664 aa  301  4e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.686788  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2967  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 
762 aa  301  4e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619834 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3376  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  36.27 
 
 
604 aa  299  9e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1366  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.18 
 
 
541 aa  299  1e-79  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.504538  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  34.48 
 
 
664 aa  298  1e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1245  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.18 
 
 
541 aa  299  1e-79  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00591583  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>