More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3967 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3967  Sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 570 aa  1119    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1270  sodium/hydrogen exchanger  43.23 
 
 		 657 aa  452  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  43.18 
 
 		 650 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01391  Kef-type K+ transport system, membrane component  42.16 
 
 		 720 aa  429  1e-119  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1611  sodium/hydrogen exchanger  43.08 
 
 		 660 aa  429  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2867  sodium/hydrogen exchanger  43.96 
 
 		 649 aa  427  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1760  sodium/hydrogen exchanger family protein  44.12 
 
 		 654 aa  428  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303253  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  41.37 
 
 		 662 aa  427  1e-118  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2614  potassium efflux system protein  43.6 
 
 		 649 aa  426  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1906  potassium efflux system protein  43.32 
 
 		 660 aa  428  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0530  sodium/hydrogen exchanger  44.03 
 
 		 678 aa  419  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.191923  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1593  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  43.74 
 
 		 655 aa  418  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0308  sodium/hydrogen exchanger  42.91 
 
 		 674 aa  416  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6115  Sodium/hydrogen exchanger  43.32 
 
 		 668 aa  414  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2703  sodium/hydrogen exchanger  44.11 
 
 		 670 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0296  sodium/hydrogen exchanger  45.39 
 
 		 659 aa  414  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2796  sodium/hydrogen exchanger  43.04 
 
 		 668 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0879164 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2171  sodium/hydrogen exchanger  43.04 
 
 		 668 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  41.98 
 
 		 649 aa  415  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2785  sodium/hydrogen exchanger  43.04 
 
 		 668 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0657605  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0360  TrkA-N:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  42.54 
 
 		 659 aa  409  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0332  sodium/hydrogen exchanger  43.82 
 
 		 667 aa  409  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0414  putative glutathione-regulated potassium-efflux system K+/H+ antiporter transmembrane protein  44.7 
 
 		 659 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0507155 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2956  sodium/hydrogen exchanger  40.39 
 
 		 654 aa  406  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356807  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0587  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  44.11 
 
 		 669 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1976  sodium/hydrogen exchanger  41.43 
 
 		 666 aa  406  1.0000000000000001e-112  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0132674  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2845  sodium/hydrogen exchanger  43.75 
 
 		 670 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0613147  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  42.96 
 
 		 648 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1647  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  42.25 
 
 		 648 aa  402  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3143  potassium efflux system protein  42.51 
 
 		 649 aa  404  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  42.15 
 
 		 648 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0771  potassium efflux system protein  44.07 
 
 		 663 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1468  potassium efflux system protein  42.15 
 
 		 648 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0492  potassium efflux system protein  43.54 
 
 		 663 aa  405  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491444  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  42.15 
 
 		 648 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0269  sodium/hydrogen exchanger  45.22 
 
 		 659 aa  403  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3101  potassium efflux system protein  44.11 
 
 		 669 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3417  potassium efflux system protein  41.29 
 
 		 652 aa  401  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00166015  normal  0.19535 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0539  antiporter-2, CPA2 family monovalent cation/proton antiporter  45.72 
 
 		 658 aa  401  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2948  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  44.11 
 
 		 669 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.248455  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0603  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  44.11 
 
 		 669 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4116  putative glutathione-regulated potassium efflux system protein  43.64 
 
 		 666 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0070  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  44.11 
 
 		 669 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0602  sodium/hydrogen exchanger  43.29 
 
 		 667 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616152  normal  0.0415752 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1520  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  44.11 
 
 		 669 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418182  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1499  potassium efflux system protein  42.33 
 
 		 648 aa  399  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2623  potassium efflux system protein  42.5 
 
 		 648 aa  396  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00669117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2690  potassium efflux system protein  42.5 
 
 		 648 aa  396  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000490638 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1159  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  43.76 
 
 		 648 aa  394  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1636  sodium/hydrogen exchanger  42.96 
 
 		 661 aa  392  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000235169 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1968  potassium-efflux system protein  42.96 
 
 		 661 aa  392  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3810  sodium/hydrogen exchanger family protein  42.66 
 
 		 680 aa  389  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.162531 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5295  sodium/hydrogen exchanger  42.33 
 
 		 661 aa  389  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4238  sodium/hydrogen exchanger  42.71 
 
 		 656 aa  391  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3263  sodium/hydrogen exchanger  41.68 
 
 		 653 aa  391  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.538739 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1519  sodium/hydrogen exchanger family protein  42.35 
 
 		 579 aa  383  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.49267  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4900  potassium efflux system protein  43.69 
 
 		 664 aa  382  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0155  sodium/hydrogen exchanger  43.13 
 
 		 661 aa  384  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4133  potassium efflux system protein  43.24 
 
 		 661 aa  376  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.477795 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4786  potassium efflux system protein  43.69 
 
 		 661 aa  372  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4109  sodium/hydrogen exchanger  42.43 
 
 		 661 aa  374  1e-102  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.324646  normal  0.0690123 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0181  sodium/hydrogen exchanger  43.03 
 
 		 665 aa  366  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3491  potassium efflux system protein  43.59 
 
 		 661 aa  365  1e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0880  sodium/hydrogen exchanger  43.14 
 
 		 655 aa  365  1e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.19448  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2952  Sodium/hydrogen exchanger, TrkA-N  40.03 
 
 		 568 aa  338  9.999999999999999e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2194  potassium efflux system protein  39.68 
 
 		 574 aa  336  7.999999999999999e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  35 
 
 		 666 aa  331  2e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000714201 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0784  sodium/hydrogen exchanger  36.01 
 
 		 665 aa  330  6e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.82 
 
 		 697 aa  323  7e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0554  potassium efflux system protein  36.38 
 
 		 624 aa  320  3.9999999999999996e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00935447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1729  glutathione-regulated K+ efflux antiporter  36.25 
 
 		 628 aa  319  7.999999999999999e-86  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.282335  normal  0.367731 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2011  potassium efflux system protein  36.07 
 
 		 628 aa  318  1e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.425988  normal  0.0999325 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  34.5 
 
 		 682 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0275042 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  35.06 
 
 		 672 aa  313  5.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1761  potassium efflux system protein  36.23 
 
 		 616 aa  312  9e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00639423 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1668  potassium efflux system protein  37.61 
 
 		 610 aa  311  1e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.228254 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  34.23 
 
 		 674 aa  309  9e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  33.1 
 
 		 658 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000381991  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2945  potassium efflux system protein  35.87 
 
 		 589 aa  307  3e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1481  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  35.4 
 
 		 589 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1249  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  33.75 
 
 		 572 aa  305  2.0000000000000002e-81  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2847  potassium efflux system protein  35.4 
 
 		 589 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.128131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1631  sodium/hydrogen exchanger  32.62 
 
 		 665 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2236  sodium/hydrogen exchanger  34.5 
 
 		 666 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2769  potassium efflux system protein  35.4 
 
 		 589 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000462118  normal  0.230816 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0716  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  36.59 
 
 		 617 aa  302  1e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.32849 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1314  potassium efflux system protein  34.98 
 
 		 589 aa  299  9e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.208859  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3407  potassium efflux system protein  34.46 
 
 		 624 aa  298  2e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.229701  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  33.63 
 
 		 664 aa  297  3e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  30.15 
 
 		 671 aa  296  9e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  34.09 
 
 		 741 aa  294  2e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1092  sodium/hydrogen exchanger  37.32 
 
 		 642 aa  293  5e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.163516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2429  glutathione-regulated potassium-efflux system protein, kefB  37.32 
 
 		 642 aa  293  5e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.760759  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1853  sodium/hydrogen exchanger  33.27 
 
 		 688 aa  293  8e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000204486  normal  0.40293 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  33.28 
 
 		 666 aa  292  1e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  31.75 
 
 		 636 aa  291  2e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0669  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  34.09 
 
 		 663 aa  290  4e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.842993 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4634  sodium/hydrogen exchanger  33.57 
 
 		 630 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0136405 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1943  sodium/hydrogen exchanger  33.74 
 
 		 629 aa  288  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409828  normal  0.0242024 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4163  potassium efflux system protein  35.34 
 
 		 597 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>