More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1203 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1203  glutamine amidotransferase class-I  100 
 
 
188 aa  385  1e-106  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.858252  hitchhiker  0.00205906 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1364  GMP synthase subunit A  48.92 
 
 
189 aa  186  2e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0254  GMP synthase, small subunit  49.19 
 
 
188 aa  179  2e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0690  GMP synthase subunit A  39.36 
 
 
189 aa  142  2e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.635266  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0133  GMP synthase subunit A  39.89 
 
 
189 aa  140  8e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.361551  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1228  GMP synthase subunit A  38.83 
 
 
189 aa  138  4.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1723  GMP synthase  42.78 
 
 
505 aa  134  8e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.734167 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0756  GMP synthase subunit A  38.83 
 
 
189 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0869  GMP synthase subunit A  40.43 
 
 
188 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.143243  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0606  GMP synthase, small subunit  41.4 
 
 
196 aa  132  3e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1516  GMP synthase  40.96 
 
 
505 aa  129  3e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0919  GMP synthase subunit A  42.25 
 
 
189 aa  127  7.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.956828 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0702  GMP synthase  37.7 
 
 
520 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0600  GMP synthase  40.64 
 
 
505 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0760838  hitchhiker  0.0000221926 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2444  GMP synthase, small subunit  39.06 
 
 
184 aa  124  7e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.433142  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0029  GMP synthase subunit A  38.54 
 
 
183 aa  124  8.000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.138973  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  41.4 
 
 
516 aa  124  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1772  GMP synthase  40.86 
 
 
505 aa  122  2e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.564322  hitchhiker  0.00463456 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1489  GMP synthase, small subunit  39.06 
 
 
184 aa  123  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2002  GMP synthase subunit A  37.43 
 
 
189 aa  122  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.3362  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0704  GMP synthase subunit A  39.25 
 
 
184 aa  121  5e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.2759 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1573  GMP synthase  35.11 
 
 
507 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4247  GMP synthase, large subunit  39.01 
 
 
527 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  37.16 
 
 
509 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0189  GMP synthase, large subunit  39.13 
 
 
529 aa  118  6e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0433911 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  36.61 
 
 
509 aa  117  7.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0371  GMP synthase  37.84 
 
 
522 aa  117  7.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0626  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing), C-terminal domain protein  35.08 
 
 
520 aa  117  9.999999999999999e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0629  GMP synthase large subunit  36.11 
 
 
517 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.522683 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1438  GMP synthase  37.02 
 
 
510 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000788209  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2424  GMP synthase subunit A  36.46 
 
 
182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176542  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0571  GMP synthase subunit A  37.04 
 
 
184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1547  GMP synthase subunit A  38.38 
 
 
185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0166  GMP synthase subunit A  37.84 
 
 
181 aa  114  6e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0718  GMP synthase  36.7 
 
 
513 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1875  GMP synthase, large subunit  39.04 
 
 
533 aa  112  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.124967  decreased coverage  0.00513433 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1667  GMP synthase  35.45 
 
 
513 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0736  GMP synthase subunit A  36.96 
 
 
184 aa  111  5e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.683361  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1739  GMP synthase  37.84 
 
 
512 aa  110  9e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5989  GMP synthase  37.7 
 
 
534 aa  110  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.319605  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1264  GMP synthase  35.11 
 
 
510 aa  110  1.0000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0638  GMP synthase  35.87 
 
 
511 aa  109  2.0000000000000002e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0501  GMP synthase  35.29 
 
 
511 aa  109  2.0000000000000002e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0392  GMP synthase, large subunit  34.78 
 
 
509 aa  108  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.932564  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2589  GMP synthase  35 
 
 
528 aa  109  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1588  GMP synthase subunit A  36.41 
 
 
188 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2375  GMP synthase  34.43 
 
 
513 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0414714  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1133  GMP synthase  37.5 
 
 
508 aa  107  8.000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  36.02 
 
 
511 aa  106  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0046  GMP synthase  33.85 
 
 
507 aa  106  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.214128  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  34.38 
 
 
512 aa  106  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0816  GMP synthase  35.45 
 
 
506 aa  106  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08800  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.81 
 
 
533 aa  106  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0220  GMP synthase  35.87 
 
 
522 aa  105  3e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1385  GMP synthase  34.95 
 
 
511 aa  105  4e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  36.84 
 
 
512 aa  105  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1672  GMP synthase  34.38 
 
 
521 aa  105  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.605377  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10270  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.14 
 
 
530 aa  105  5e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.38684 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0749  GMP synthase  36.22 
 
 
547 aa  105  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0375  GMP synthase  36.76 
 
 
511 aa  105  5e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216851  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0942  GMP synthase, large subunit  35.83 
 
 
535 aa  105  5e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00705801  normal  0.0196156 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  37.04 
 
 
510 aa  104  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  35.64 
 
 
513 aa  104  9e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1784  GMP synthase  32.98 
 
 
510 aa  104  9e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0148865  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1001  GMP synthase  34.07 
 
 
501 aa  103  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0989  GMP synthase  37.16 
 
 
515 aa  103  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000791006  hitchhiker  0.000562363 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1588  GMP synthase  34.38 
 
 
522 aa  103  1e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0598  GMP synthase  35.08 
 
 
505 aa  103  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.57475 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1105  GMP synthase  34.07 
 
 
501 aa  103  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  34.62 
 
 
514 aa  103  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1264  GMP synthase  34.41 
 
 
511 aa  103  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1250  GMP synthase, large subunit  34.25 
 
 
523 aa  103  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.026459  normal  0.348745 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1183  GMP synthase C terminal domain protein  33.89 
 
 
523 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.804519  normal  0.853141 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  34.74 
 
 
522 aa  103  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2551  GMP synthase, large subunit  36.46 
 
 
533 aa  102  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19190  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  37.16 
 
 
536 aa  102  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0538351 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0231  GMP synthase  35.52 
 
 
517 aa  103  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.233055  hitchhiker  2.8816700000000002e-18 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  33.88 
 
 
510 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2931  GMP synthase  33.51 
 
 
521 aa  102  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.114397 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3113  GMP synthase  34.05 
 
 
521 aa  102  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0645  GMP synthase  36.61 
 
 
556 aa  102  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.559088  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0731  GMP synthase  34.54 
 
 
525 aa  102  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2132  GMP synthase  36.56 
 
 
512 aa  102  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3156  GMP synthase  33.51 
 
 
521 aa  102  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0345833  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01077  GMP synthase  32.24 
 
 
517 aa  102  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3631  GMP synthase  35.36 
 
 
527 aa  102  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0294  GMP synthase  32.79 
 
 
537 aa  101  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.223502  normal  0.0574353 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0738  GMP synthase  32.24 
 
 
517 aa  101  5e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0769  GMP synthase, large subunit  33.51 
 
 
510 aa  101  6e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.655453  hitchhiker  0.000357154 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0705  GMP synthase, large subunit  34.43 
 
 
524 aa  101  6e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4445  GMP synthase, large subunit  32.79 
 
 
520 aa  101  7e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.637839  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1543  GMP synthase, large subunit  35.05 
 
 
507 aa  101  8e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1531  GMP synthase  33.85 
 
 
522 aa  100  8e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00361  GMP synthase  34.21 
 
 
528 aa  101  8e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.859384  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004340  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.24 
 
 
517 aa  100  9e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1294  GMP synthase  34.95 
 
 
518 aa  100  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141337  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0645  GMP synthase, large subunit  34.05 
 
 
507 aa  100  1e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000665212  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2862  GMP synthase, large subunit  32.45 
 
 
510 aa  100  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.339374  normal  0.56979 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1138  GMP synthase  33.16 
 
 
525 aa  100  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.045866  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1617  GMP synthase  35.05 
 
 
517 aa  100  1e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.322127  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>