More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0704 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0704  GMP synthase subunit A  100 
 
 		 184 aa  373  1e-103  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.2759 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1547  GMP synthase subunit A  65.22 
 
 		 185 aa  261  3e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1588  GMP synthase subunit A  66.67 
 
 		 188 aa  249  2e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0736  GMP synthase subunit A  63.04 
 
 		 184 aa  244  4.9999999999999997e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.683361  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0919  GMP synthase subunit A  58.38 
 
 		 189 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.956828 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0166  GMP synthase subunit A  53.85 
 
 		 181 aa  192  3e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2002  GMP synthase subunit A  50.81 
 
 		 189 aa  189  1e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.3362  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2444  GMP synthase, small subunit  50 
 
 		 184 aa  185  4e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.433142  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1489  GMP synthase, small subunit  50.54 
 
 		 184 aa  183  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0029  GMP synthase subunit A  48.39 
 
 		 183 aa  176  1e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.138973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2424  GMP synthase subunit A  49.73 
 
 		 182 aa  176  2e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176542  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0869  GMP synthase subunit A  45.6 
 
 		 188 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.143243  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0133  GMP synthase subunit A  45.6 
 
 		 189 aa  162  3e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.361551  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0571  GMP synthase subunit A  49.73 
 
 		 184 aa  158  3e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1228  GMP synthase subunit A  45.05 
 
 		 189 aa  157  1e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0690  GMP synthase subunit A  44.51 
 
 		 189 aa  156  2e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.635266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0756  GMP synthase subunit A  42.31 
 
 		 189 aa  150  7e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1784  GMP synthase  39.44 
 
 		 510 aa  142  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0148865  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0606  GMP synthase, small subunit  38.5 
 
 		 196 aa  139  1.9999999999999998e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  36.81 
 
 		 511 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0887  GMP synthase, large subunit  37.78 
 
 		 510 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000175854  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0254  GMP synthase, small subunit  37.78 
 
 		 188 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2576  GMP synthase  39.56 
 
 		 529 aa  124  6e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000141885 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1264  GMP synthase  39.13 
 
 		 510 aa  124  1e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0626  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing), C-terminal domain protein  36.02 
 
 		 520 aa  123  1e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2869  GMP synthase  39.01 
 
 		 529 aa  122  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.256862  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2551  GMP synthase, large subunit  38.12 
 
 		 533 aa  122  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0912  GMP synthase  39.04 
 
 		 520 aa  122  4e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00396953  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1203  glutamine amidotransferase class-I  39.25 
 
 		 188 aa  121  5e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.858252  hitchhiker  0.00205906 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0342  GMP synthase  38.86 
 
 		 514 aa  121  6e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1460  GMP synthase  35.64 
 
 		 542 aa  121  6e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.195625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0816  GMP synthase  39.44 
 
 		 506 aa  121  6e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2429  GMP synthase  36.36 
 
 		 527 aa  121  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  35.56 
 
 		 516 aa  120  8e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0315  GMP synthase  36.73 
 
 		 518 aa  120  8e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.185414 
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B17  GMP synthase  36.46 
 
 		 511 aa  120  9.999999999999999e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1708  GMP synthase  36.36 
 
 		 527 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0989  GMP synthase  37.91 
 
 		 515 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000791006  hitchhiker  0.000562363 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0392  GMP synthase, large subunit  34.44 
 
 		 509 aa  119  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.932564  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  36.67 
 
 		 513 aa  118  3.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1312  GMP synthase  36.32 
 
 		 527 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08800  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  37.63 
 
 		 533 aa  118  3.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0501  GMP synthase  36.11 
 
 		 511 aa  118  4.9999999999999996e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  38.59 
 
 		 518 aa  118  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1615  GMP synthase  35.64 
 
 		 526 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.25634  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  35.56 
 
 		 510 aa  118  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0694  GMP synthase  35.91 
 
 		 542 aa  118  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28370  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  37.02 
 
 		 526 aa  118  6e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0722  GMP synthase  35.91 
 
 		 542 aa  118  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0373308  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0589  GMP synthase  38.1 
 
 		 511 aa  117  6e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0163  GMP synthase, large subunit  37.5 
 
 		 525 aa  118  6e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1516  GMP synthase  41.3 
 
 		 505 aa  118  6e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  35.56 
 
 		 514 aa  117  7.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0294  GMP synthase  35.16 
 
 		 537 aa  117  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.223502  normal  0.0574353 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0749  GMP synthase  37.16 
 
 		 547 aa  117  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0438  GMP synthase  37.22 
 
 		 513 aa  117  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1133  GMP synthase  37.7 
 
 		 508 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0449  GMP synthase  37.22 
 
 		 513 aa  117  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0702  GMP synthase  35.91 
 
 		 520 aa  117  9.999999999999999e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1573  GMP synthase  34.97 
 
 		 507 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0070  GMP synthase  37.22 
 
 		 513 aa  116  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.851751  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  35.56 
 
 		 512 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0967  GMP synthase  37.91 
 
 		 520 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0246397  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0254  GMP synthase  35.56 
 
 		 515 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0140882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0240  GMP synthase  35.56 
 
 		 515 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000319798  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0243  GMP synthase  35.56 
 
 		 515 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151075  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  35.56 
 
 		 512 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0231  GMP synthase  35.91 
 
 		 517 aa  116  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.233055  hitchhiker  2.8816700000000002e-18 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0294  GMP synthase  35.56 
 
 		 512 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0291  GMP synthase  35.56 
 
 		 512 aa  115  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000390147  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0319  GMP synthase  35.56 
 
 		 515 aa  115  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000015999  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1364  GMP synthase subunit A  35.96 
 
 		 189 aa  115  3e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  35 
 
 		 512 aa  115  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0731  GMP synthase  34.9 
 
 		 525 aa  115  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  37.22 
 
 		 511 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  36.11 
 
 		 510 aa  115  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13431  GMP synthase  37.5 
 
 		 525 aa  115  5e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.774143 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07680  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.15 
 
 		 527 aa  115  5e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.130273  normal  0.713681 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0375  GMP synthase  35 
 
 		 511 aa  114  6e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216851  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16470  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.68 
 
 		 539 aa  114  7.999999999999999e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.68109  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4247  GMP synthase, large subunit  36.11 
 
 		 527 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1946  GMP synthase  37.76 
 
 		 513 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0718  GMP synthase  37.7 
 
 		 513 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1875  GMP synthase, large subunit  37.3 
 
 		 533 aa  114  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.124967  decreased coverage  0.00513433 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  35 
 
 		 509 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0966  GMP synthase  35 
 
 		 509 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.527198  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1583  GMP synthase  35.52 
 
 		 513 aa  113  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  35 
 
 		 512 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  35 
 
 		 512 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3038  GMP synthase, large subunit  36.67 
 
 		 515 aa  113  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.60036  hitchhiker  0.00129396 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1723  GMP synthase  40.44 
 
 		 505 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.734167 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1772  GMP synthase  41.85 
 
 		 505 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.564322  hitchhiker  0.00463456 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  34.44 
 
 		 509 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19190  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.56 
 
 		 536 aa  113  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0538351 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0189  GMP synthase, large subunit  35 
 
 		 529 aa  112  2.0000000000000002e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0433911 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0942  GMP synthase, large subunit  38.71 
 
 		 535 aa  113  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00705801  normal  0.0196156 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1751  GMP synthase  34.74 
 
 		 520 aa  112  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.485294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1054  GMP synthase  34.81 
 
 		 540 aa  112  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  hitchhiker  0.000561419 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10270  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.41 
 
 		 530 aa  112  3e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.38684 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1096  GMP synthase large subunit  33.7 
 
 		 516 aa  112  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602354  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>