More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0029 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0029  GMP synthase subunit A  100 
 
 		 183 aa  372  1e-102  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.138973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2424  GMP synthase subunit A  81.87 
 
 		 182 aa  300  8.000000000000001e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176542  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2444  GMP synthase, small subunit  74.73 
 
 		 184 aa  286  1e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.433142  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1489  GMP synthase, small subunit  73.51 
 
 		 184 aa  284  5e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0571  GMP synthase subunit A  74.86 
 
 		 184 aa  255  2e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2002  GMP synthase subunit A  52.72 
 
 		 189 aa  190  8e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.3362  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0919  GMP synthase subunit A  51.91 
 
 		 189 aa  180  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.956828 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0736  GMP synthase subunit A  46.2 
 
 		 184 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.683361  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1547  GMP synthase subunit A  47.78 
 
 		 185 aa  176  1e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0704  GMP synthase subunit A  48.39 
 
 		 184 aa  176  1e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.2759 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0166  GMP synthase subunit A  47.51 
 
 		 181 aa  176  2e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1588  GMP synthase subunit A  46.52 
 
 		 188 aa  174  9e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0756  GMP synthase subunit A  42.62 
 
 		 189 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0869  GMP synthase subunit A  40.98 
 
 		 188 aa  148  3e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.143243  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0133  GMP synthase subunit A  39.78 
 
 		 189 aa  147  6e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.361551  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0690  GMP synthase subunit A  40.32 
 
 		 189 aa  147  6e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.635266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1228  GMP synthase subunit A  40.32 
 
 		 189 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0606  GMP synthase, small subunit  42.25 
 
 		 196 aa  141  6e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0254  GMP synthase, small subunit  39.78 
 
 		 188 aa  132  3e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1298  GMP synthase  41.21 
 
 		 525 aa  132  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1364  GMP synthase subunit A  38.1 
 
 		 189 aa  129  3e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1269  GMP synthase  41.12 
 
 		 525 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0189098  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3003  GMP synthase  41.12 
 
 		 525 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.417306  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1270  GMP synthase  39.29 
 
 		 525 aa  127  6e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0196123  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0887  GMP synthase, large subunit  41.18 
 
 		 510 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000175854  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1560  GMP synthase  39.09 
 
 		 525 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3123  GMP synthase  39.2 
 
 		 525 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0738  GMP synthase  38.95 
 
 		 517 aa  126  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1314  GMP synthase  39.29 
 
 		 525 aa  125  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.867472  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0297  GMP synthase  40.1 
 
 		 517 aa  125  3e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1138  GMP synthase  38.78 
 
 		 525 aa  124  5e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.045866  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01077  GMP synthase  42.19 
 
 		 517 aa  124  6e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2645  GMP synthase  38.27 
 
 		 525 aa  124  7e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1203  glutamine amidotransferase class-I  38.54 
 
 		 188 aa  124  7e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.858252  hitchhiker  0.00205906 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004340  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  41.67 
 
 		 517 aa  122  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2358  GMP synthase  40.31 
 
 		 525 aa  123  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1133  GMP synthase  37.57 
 
 		 508 aa  123  2e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1128  GMP synthase, large subunit  39.09 
 
 		 525 aa  122  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340292  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2375  GMP synthase  38.46 
 
 		 513 aa  122  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0414714  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2728  GMP synthase, large subunit  39.09 
 
 		 525 aa  121  5e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.211488  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl342  GMP synthase  33.16 
 
 		 513 aa  121  6e-27  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.013965  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1380  GMP synthase  38.27 
 
 		 525 aa  120  9e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.197214  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0070  GMP synthase  39.57 
 
 		 513 aa  120  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.851751  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  35.29 
 
 		 511 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3595  GMP synthase  39.59 
 
 		 525 aa  120  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0154182  normal  0.634347 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  38.46 
 
 		 509 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3141  GMP synthase  38.27 
 
 		 525 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.273688 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2998  GMP synthase  38.27 
 
 		 525 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2983  GMP synthase  38.27 
 
 		 525 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.925294  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1423  GMP synthase, large subunit  32.8 
 
 		 512 aa  120  9.999999999999999e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1438  GMP synthase  38.74 
 
 		 510 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000788209  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1672  GMP synthase  39.69 
 
 		 521 aa  119  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.605377  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1235  GMP synthase  38.27 
 
 		 525 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.329718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1306  GMP synthase  38.27 
 
 		 525 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.439445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1573  GMP synthase  34.9 
 
 		 507 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1236  GMP synthase  38.27 
 
 		 525 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00906  GMP synthase  39.69 
 
 		 521 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00923984  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0189  GMP synthase  36.51 
 
 		 575 aa  119  3e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  37.91 
 
 		 509 aa  118  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0231  GMP synthase  35.26 
 
 		 517 aa  118  4.9999999999999996e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.233055  hitchhiker  2.8816700000000002e-18 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1617  GMP synthase  35.79 
 
 		 517 aa  117  6e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.322127  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1588  GMP synthase  40.1 
 
 		 522 aa  117  7e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1312  GMP synthase  37.56 
 
 		 527 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19190  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  38.71 
 
 		 536 aa  117  9.999999999999999e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0538351 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  35.83 
 
 		 512 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  38.71 
 
 		 516 aa  117  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0189  GMP synthase, large subunit  38.74 
 
 		 529 aa  117  9.999999999999999e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0433911 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0421  GMP synthase  37 
 
 		 523 aa  117  9.999999999999999e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0294  GMP synthase  34.92 
 
 		 537 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.223502  normal  0.0574353 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3292  GMP synthase  37.76 
 
 		 525 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1557  GMP synthase, large subunit  31.41 
 
 		 512 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000239894  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0501  GMP synthase  35.45 
 
 		 511 aa  116  1.9999999999999998e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3485  GMP synthase  38.5 
 
 		 525 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1772  GMP synthase  40.84 
 
 		 505 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.564322  hitchhiker  0.00463456 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10270  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  38.95 
 
 		 530 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.38684 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0702  GMP synthase  38.38 
 
 		 520 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4241  GMP synthase  37.56 
 
 		 525 aa  115  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1054  GMP synthase  36.51 
 
 		 540 aa  115  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  hitchhiker  0.000561419 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1784  GMP synthase  36.26 
 
 		 510 aa  115  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0148865  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1036  GMP synthase  37.56 
 
 		 523 aa  115  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.86774  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1727  GMP synthase  36.92 
 
 		 525 aa  115  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.865891  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0731  GMP synthase  35.82 
 
 		 525 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2880  GMP synthase  35.45 
 
 		 542 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  37.36 
 
 		 510 aa  115  5e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1708  GMP synthase  37 
 
 		 527 aa  114  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0989  GMP synthase  38.38 
 
 		 515 aa  115  5e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000791006  hitchhiker  0.000562363 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1531  GMP synthase  39.58 
 
 		 522 aa  114  6e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0046  GMP synthase  36.32 
 
 		 507 aa  114  6e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.214128  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0816  GMP synthase  39.56 
 
 		 506 aa  114  6e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0438  GMP synthase  37.97 
 
 		 513 aa  114  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0449  GMP synthase  37.97 
 
 		 513 aa  114  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0015  GMP synthase  36.27 
 
 		 532 aa  114  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235317 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2766  GMP synthase  38.07 
 
 		 525 aa  114  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2875  GMP synthase  38.07 
 
 		 525 aa  114  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2703  GMP synthase  38.07 
 
 		 525 aa  114  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.668496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2659  GMP synthase  38.07 
 
 		 525 aa  114  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00262883  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2744  GMP synthase  38.07 
 
 		 525 aa  114  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.903073  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0243  GMP synthase  37.1 
 
 		 515 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151075  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  37.1 
 
 		 512 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0718  GMP synthase  33.33 
 
 		 513 aa  114  8.999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>