More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1547 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1547  GMP synthase subunit A  100 
 
 		 185 aa  381  1e-105  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0704  GMP synthase subunit A  65.22 
 
 		 184 aa  261  3e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.2759 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0736  GMP synthase subunit A  62.43 
 
 		 184 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.683361  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1588  GMP synthase subunit A  63.48 
 
 		 188 aa  243  9.999999999999999e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2002  GMP synthase subunit A  48.11 
 
 		 189 aa  185  3e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.3362  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0166  GMP synthase subunit A  47.51 
 
 		 181 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2424  GMP synthase subunit A  48.6 
 
 		 182 aa  180  1e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176542  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2444  GMP synthase, small subunit  46.99 
 
 		 184 aa  178  4.999999999999999e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.433142  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0029  GMP synthase subunit A  47.78 
 
 		 183 aa  176  1e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.138973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0919  GMP synthase subunit A  50 
 
 		 189 aa  174  9e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.956828 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1489  GMP synthase, small subunit  46.45 
 
 		 184 aa  171  3.9999999999999995e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0133  GMP synthase subunit A  44.38 
 
 		 189 aa  160  1e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.361551  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1228  GMP synthase subunit A  43.26 
 
 		 189 aa  154  8e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0690  GMP synthase subunit A  42.7 
 
 		 189 aa  150  8.999999999999999e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.635266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0571  GMP synthase subunit A  46.93 
 
 		 184 aa  149  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0606  GMP synthase, small subunit  39.01 
 
 		 196 aa  147  7e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0869  GMP synthase subunit A  40.33 
 
 		 188 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.143243  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0756  GMP synthase subunit A  38.67 
 
 		 189 aa  143  1e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1784  GMP synthase  36.11 
 
 		 510 aa  133  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0148865  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  35.75 
 
 		 511 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1573  GMP synthase  35.2 
 
 		 507 aa  122  3e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00351  GMP synthase  38.92 
 
 		 528 aa  122  4e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  33.52 
 
 		 514 aa  122  4e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1363  GMP synthase  38.92 
 
 		 528 aa  122  4e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00451  GMP synthase  37.7 
 
 		 528 aa  120  8e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2551  GMP synthase, large subunit  37.57 
 
 		 533 aa  120  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00361  GMP synthase  34.97 
 
 		 528 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.859384  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0989  GMP synthase  35.36 
 
 		 515 aa  119  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000791006  hitchhiker  0.000562363 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1133  GMP synthase  33.33 
 
 		 508 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  36.07 
 
 		 513 aa  118  3.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0294  GMP synthase  34.62 
 
 		 537 aa  118  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.223502  normal  0.0574353 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1054  GMP synthase  34.81 
 
 		 540 aa  118  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  hitchhiker  0.000561419 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1556  GMP synthase large subunit  35.36 
 
 		 540 aa  118  4.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.185236  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  34.25 
 
 		 510 aa  117  7e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0254  GMP synthase, small subunit  36.57 
 
 		 188 aa  117  9.999999999999999e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0042  GMP synthase  36.07 
 
 		 528 aa  117  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0392  GMP synthase, large subunit  35.56 
 
 		 509 aa  117  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.932564  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  34.08 
 
 		 512 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0254  GMP synthase  34.64 
 
 		 515 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0140882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0240  GMP synthase  34.64 
 
 		 515 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000319798  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0243  GMP synthase  34.64 
 
 		 515 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151075  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0294  GMP synthase  34.64 
 
 		 512 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  34.64 
 
 		 512 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  33.33 
 
 		 516 aa  116  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2880  GMP synthase  34.25 
 
 		 542 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B17  GMP synthase  34.25 
 
 		 511 aa  115  3.9999999999999997e-25  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08800  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.81 
 
 		 533 aa  115  3.9999999999999997e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  33.89 
 
 		 512 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0816  GMP synthase  35.56 
 
 		 506 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0231  GMP synthase  35.56 
 
 		 517 aa  115  3.9999999999999997e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.233055  hitchhiker  2.8816700000000002e-18 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1203  glutamine amidotransferase class-I  38.38 
 
 		 188 aa  115  3.9999999999999997e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.858252  hitchhiker  0.00205906 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  34.44 
 
 		 518 aa  115  5e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1364  GMP synthase subunit A  35.59 
 
 		 189 aa  115  5e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0375  GMP synthase  32.78 
 
 		 511 aa  115  5e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216851  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0291  GMP synthase  34.08 
 
 		 512 aa  114  6e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000390147  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  34.08 
 
 		 512 aa  114  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0319  GMP synthase  34.08 
 
 		 515 aa  114  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000015999  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00371  GMP synthase  36.07 
 
 		 548 aa  114  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.280363  normal  0.275334 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07680  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.81 
 
 		 527 aa  114  8.999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.130273  normal  0.713681 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0015  GMP synthase  31.72 
 
 		 532 aa  113  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235317 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0501  GMP synthase  31.89 
 
 		 511 aa  113  1.0000000000000001e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0046  GMP synthase  34.97 
 
 		 528 aa  113  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0694  GMP synthase  33.7 
 
 		 542 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0722  GMP synthase  33.7 
 
 		 542 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0373308  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1264  GMP synthase  34.24 
 
 		 510 aa  113  2.0000000000000002e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1264  GMP synthase  32.43 
 
 		 511 aa  112  3e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0037  GMP synthase  31.69 
 
 		 528 aa  112  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.344786  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1739  GMP synthase  37.64 
 
 		 512 aa  112  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2869  GMP synthase  36.26 
 
 		 529 aa  112  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.256862  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0702  GMP synthase  34.81 
 
 		 520 aa  112  3e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  33.52 
 
 		 512 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1460  GMP synthase  30.32 
 
 		 542 aa  112  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.195625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1793  GMP synthase  36.67 
 
 		 515 aa  112  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  33.16 
 
 		 522 aa  111  5e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28370  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.25 
 
 		 526 aa  111  6e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1617  GMP synthase  35.03 
 
 		 517 aa  111  6e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.322127  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0595  GMP synthase, large subunit  30.98 
 
 		 511 aa  111  6e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2375  GMP synthase  33.15 
 
 		 513 aa  111  6e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0414714  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0638  GMP synthase  34.55 
 
 		 511 aa  111  6e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0342  GMP synthase  35.38 
 
 		 514 aa  110  8.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1521  GMP synthase  33.89 
 
 		 518 aa  110  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02020  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.52 
 
 		 510 aa  110  8.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0907  GMP synthase  33.7 
 
 		 575 aa  110  8.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70121  GMP synthase  33.89 
 
 		 528 aa  110  8.000000000000001e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0970266  normal  0.0696406 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  31.49 
 
 		 512 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1583  GMP synthase  31.67 
 
 		 513 aa  110  9e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1385  GMP synthase  31.35 
 
 		 511 aa  110  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2429  GMP synthase  30.85 
 
 		 527 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1946  GMP synthase  34.38 
 
 		 513 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10270  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.2 
 
 		 530 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.38684 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0189  GMP synthase  33.15 
 
 		 575 aa  110  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2348  GMP synthase  35 
 
 		 518 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598137  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1312  GMP synthase  31.91 
 
 		 527 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2576  GMP synthase  35.16 
 
 		 529 aa  110  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000141885 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1616  GMP synthase  33.89 
 
 		 518 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0247  GMP synthase  32.96 
 
 		 512 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000963805  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0626  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing), C-terminal domain protein  33.15 
 
 		 520 aa  109  2.0000000000000002e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  30.56 
 
 		 516 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0009  GMP synthase  32.79 
 
 		 536 aa  109  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000958446 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1615  GMP synthase  31.91 
 
 		 526 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.25634  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>