More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1228 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1228  GMP synthase subunit A  100 
 
 
189 aa  387  1e-107  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0133  GMP synthase subunit A  94.18 
 
 
189 aa  370  1e-102  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.361551  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0690  GMP synthase subunit A  94.71 
 
 
189 aa  368  1e-101  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.635266  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0756  GMP synthase subunit A  80.42 
 
 
189 aa  317  9e-86  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0869  GMP synthase subunit A  74.05 
 
 
188 aa  285  2.9999999999999996e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.143243  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2002  GMP synthase subunit A  46.7 
 
 
189 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.3362  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0919  GMP synthase subunit A  48.35 
 
 
189 aa  177  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.956828 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0166  GMP synthase subunit A  44.51 
 
 
181 aa  169  2e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2444  GMP synthase, small subunit  43.72 
 
 
184 aa  159  2e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.433142  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0704  GMP synthase subunit A  45.05 
 
 
184 aa  157  1e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.2759 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1547  GMP synthase subunit A  43.26 
 
 
185 aa  154  8e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0606  GMP synthase, small subunit  42.39 
 
 
196 aa  152  2e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1489  GMP synthase, small subunit  40.98 
 
 
184 aa  152  4e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1588  GMP synthase subunit A  41.53 
 
 
188 aa  151  7e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0029  GMP synthase subunit A  40.32 
 
 
183 aa  146  2.0000000000000003e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.138973  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2424  GMP synthase subunit A  40.44 
 
 
182 aa  145  2.0000000000000003e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176542  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0736  GMP synthase subunit A  38.46 
 
 
184 aa  145  3e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.683361  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0501  GMP synthase  42.62 
 
 
511 aa  144  5e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1573  GMP synthase  42.25 
 
 
507 aa  142  2e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1385  GMP synthase  42.08 
 
 
511 aa  140  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0070  GMP synthase  42.47 
 
 
513 aa  139  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.851751  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1364  GMP synthase subunit A  40.88 
 
 
189 aa  140  1.9999999999999998e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1264  GMP synthase  40.43 
 
 
510 aa  139  1.9999999999999998e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1203  glutamine amidotransferase class-I  38.83 
 
 
188 aa  138  4.999999999999999e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.858252  hitchhiker  0.00205906 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1264  GMP synthase  42.08 
 
 
511 aa  138  4.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  39.38 
 
 
522 aa  137  6e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0816  GMP synthase  39.89 
 
 
506 aa  137  7.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  35.26 
 
 
509 aa  137  8.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B17  GMP synthase  41.08 
 
 
511 aa  137  1e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  35.79 
 
 
509 aa  137  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1555  GMP synthase  41.8 
 
 
510 aa  136  2e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0438  GMP synthase  41.4 
 
 
513 aa  136  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0449  GMP synthase  41.4 
 
 
513 aa  136  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  40.11 
 
 
512 aa  135  4e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0477  GMP synthase  42.08 
 
 
511 aa  135  5e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  40.66 
 
 
511 aa  134  6.0000000000000005e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  38.46 
 
 
512 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0046  GMP synthase  38.1 
 
 
507 aa  134  9e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.214128  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  41.21 
 
 
511 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4247  GMP synthase, large subunit  37.57 
 
 
527 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  37.91 
 
 
512 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1784  GMP synthase  37.04 
 
 
510 aa  133  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0148865  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2589  GMP synthase  35.91 
 
 
528 aa  132  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0163  GMP synthase, large subunit  36.02 
 
 
525 aa  132  3e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0254  GMP synthase  37.36 
 
 
515 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0140882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0240  GMP synthase  37.36 
 
 
515 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000319798  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0243  GMP synthase  37.36 
 
 
515 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151075  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  37.36 
 
 
512 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0294  GMP synthase  37.36 
 
 
512 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  37.43 
 
 
518 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0189  GMP synthase  39.01 
 
 
575 aa  131  5e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0392  GMP synthase, large subunit  34.97 
 
 
509 aa  131  5e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.932564  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2202  GMP synthase  40.11 
 
 
511 aa  131  6e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0291  GMP synthase  36.81 
 
 
512 aa  130  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000390147  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  37.36 
 
 
512 aa  130  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  38.83 
 
 
510 aa  130  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0319  GMP synthase  36.81 
 
 
515 aa  130  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000015999  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1183  GMP synthase C terminal domain protein  36.56 
 
 
523 aa  130  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.804519  normal  0.853141 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0254  GMP synthase, small subunit  40.33 
 
 
188 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0907  GMP synthase  38.8 
 
 
575 aa  130  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1723  GMP synthase  41.3 
 
 
505 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.734167 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0598  GMP synthase  38.83 
 
 
505 aa  129  3e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.57475 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0722  GMP synthase  36.07 
 
 
542 aa  128  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0373308  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0694  GMP synthase  36.07 
 
 
542 aa  128  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0247  GMP synthase  36.81 
 
 
512 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000963805  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0940  GMP synthase  40.21 
 
 
510 aa  128  5.0000000000000004e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  37.16 
 
 
512 aa  128  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1096  GMP synthase large subunit  34.07 
 
 
516 aa  128  6e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602354  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0220  GMP synthase  36.56 
 
 
522 aa  127  8.000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  36.17 
 
 
516 aa  127  9.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1521  GMP synthase  37.91 
 
 
518 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0571  GMP synthase subunit A  42.08 
 
 
184 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0629  GMP synthase large subunit  35.48 
 
 
517 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.522683 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1054  GMP synthase  36.07 
 
 
540 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  hitchhiker  0.000561419 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1616  GMP synthase  37.91 
 
 
518 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2348  GMP synthase  38.46 
 
 
518 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598137  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0375  GMP synthase  38.83 
 
 
511 aa  126  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216851  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0337  GMP synthase, large subunit  37.36 
 
 
510 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0264  GMP synthase  37.91 
 
 
507 aa  125  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0942  GMP synthase, large subunit  36.46 
 
 
535 aa  125  3e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00705801  normal  0.0196156 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28370  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.46 
 
 
526 aa  125  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3631  GMP synthase  34.43 
 
 
527 aa  125  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1875  GMP synthase, large subunit  39.04 
 
 
533 aa  125  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.124967  decreased coverage  0.00513433 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  36.51 
 
 
516 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0294  GMP synthase  37.16 
 
 
537 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.223502  normal  0.0574353 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1556  GMP synthase large subunit  37.16 
 
 
540 aa  125  5e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.185236  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0718  GMP synthase  36.56 
 
 
513 aa  125  5e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4006  GMP synthase, large subunit  34.81 
 
 
526 aa  125  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.371451 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1228  GMP synthase, large subunit  37.77 
 
 
513 aa  125  5e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1617  GMP synthase  39.89 
 
 
517 aa  124  6e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.322127  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1250  GMP synthase, large subunit  33.33 
 
 
523 aa  124  6e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.026459  normal  0.348745 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  39.36 
 
 
510 aa  124  6e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  36.46 
 
 
516 aa  124  7e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00361  GMP synthase  40.44 
 
 
528 aa  124  7e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.859384  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2576  GMP synthase  35.68 
 
 
529 aa  124  9e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000141885 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0887  GMP synthase, large subunit  37.1 
 
 
510 aa  124  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000175854  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1133  GMP synthase  38.12 
 
 
508 aa  123  1e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0231  GMP synthase  38.8 
 
 
517 aa  124  1e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.233055  hitchhiker  2.8816700000000002e-18 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1772  GMP synthase  38.71 
 
 
505 aa  123  2e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.564322  hitchhiker  0.00463456 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0037  GMP synthase  39.01 
 
 
528 aa  123  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.344786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>