More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2002 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_2002  GMP synthase subunit A  100 
 
 		 189 aa  388  1e-107  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.3362  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0919  GMP synthase subunit A  73.54 
 
 		 189 aa  294  5e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.956828 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0166  GMP synthase subunit A  57.07 
 
 		 181 aa  231  6e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1489  GMP synthase, small subunit  54.35 
 
 		 184 aa  210  9e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2444  GMP synthase, small subunit  54.89 
 
 		 184 aa  205  4e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.433142  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2424  GMP synthase subunit A  51.63 
 
 		 182 aa  194  5.000000000000001e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176542  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1588  GMP synthase subunit A  51.37 
 
 		 188 aa  194  8.000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0029  GMP synthase subunit A  52.72 
 
 		 183 aa  190  8e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.138973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0704  GMP synthase subunit A  50.81 
 
 		 184 aa  189  1e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.2759 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1547  GMP synthase subunit A  48.11 
 
 		 185 aa  185  3e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0869  GMP synthase subunit A  47.8 
 
 		 188 aa  185  3e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.143243  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1228  GMP synthase subunit A  46.7 
 
 		 189 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0571  GMP synthase subunit A  53.8 
 
 		 184 aa  182  2.0000000000000003e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0133  GMP synthase subunit A  46.15 
 
 		 189 aa  182  3e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.361551  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0690  GMP synthase subunit A  46.15 
 
 		 189 aa  180  9.000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.635266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0736  GMP synthase subunit A  44.32 
 
 		 184 aa  177  7e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.683361  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0756  GMP synthase subunit A  43.96 
 
 		 189 aa  169  2e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0606  GMP synthase, small subunit  41.05 
 
 		 196 aa  155  3e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0163  GMP synthase, large subunit  36.96 
 
 		 525 aa  140  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4247  GMP synthase, large subunit  38.67 
 
 		 527 aa  134  8e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0254  GMP synthase, small subunit  37.37 
 
 		 188 aa  133  9.999999999999999e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  39.25 
 
 		 511 aa  132  3e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  35.26 
 
 		 509 aa  131  5e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1723  GMP synthase  43.72 
 
 		 505 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.734167 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  34.74 
 
 		 509 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1784  GMP synthase  36.32 
 
 		 510 aa  130  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0148865  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  34.55 
 
 		 512 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2375  GMP synthase  36.76 
 
 		 513 aa  128  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0414714  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10270  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  37.97 
 
 		 530 aa  128  4.0000000000000003e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.38684 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1516  GMP synthase  42.08 
 
 		 505 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  38.38 
 
 		 512 aa  125  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  37.84 
 
 		 512 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0291  GMP synthase  37.84 
 
 		 512 aa  124  6e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000390147  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0749  GMP synthase  36.22 
 
 		 547 aa  124  7e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0319  GMP synthase  37.84 
 
 		 515 aa  124  7e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000015999  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02020  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  38.22 
 
 		 510 aa  124  8.000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02399  bifunctional GMP synthase/glutamine amidotransferase protein  33.33 
 
 		 525 aa  124  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.119389  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1161  GMP synthase, large subunit  33.33 
 
 		 525 aa  124  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0469795  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00361  GMP synthase  33.51 
 
 		 528 aa  123  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0240  GMP synthase  37.84 
 
 		 515 aa  123  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000319798  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02361  hypothetical protein  33.33 
 
 		 525 aa  124  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1002  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  37.84 
 
 		 512 aa  123  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0738  GMP synthase  36.7 
 
 		 517 aa  124  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0816  GMP synthase  38.38 
 
 		 506 aa  124  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  37.84 
 
 		 512 aa  123  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1264  GMP synthase  33.86 
 
 		 510 aa  123  1e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0294  GMP synthase  37.84 
 
 		 512 aa  123  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2791  GMP synthase  32.82 
 
 		 525 aa  123  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000385155  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1314  GMP synthase  34.34 
 
 		 525 aa  122  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.867472  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2658  GMP synthase  32.82 
 
 		 525 aa  123  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000100783  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0254  GMP synthase  37.84 
 
 		 515 aa  123  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0140882  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0243  GMP synthase  37.84 
 
 		 515 aa  123  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151075  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1054  GMP synthase  35.26 
 
 		 540 aa  123  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  hitchhiker  0.000561419 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2656  GMP synthase  32.82 
 
 		 525 aa  123  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0518373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1364  GMP synthase subunit A  35.45 
 
 		 189 aa  123  2e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1170  GMP synthase  32.82 
 
 		 525 aa  123  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00961955  normal  0.0544013 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3731  GMP synthase  32.82 
 
 		 525 aa  123  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00256427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  35.14 
 
 		 513 aa  122  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0189  GMP synthase, large subunit  35.14 
 
 		 529 aa  122  2e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0433911 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2882  GMP synthase  32.82 
 
 		 525 aa  123  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0113861  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0375  GMP synthase  32.97 
 
 		 511 aa  123  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216851  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1438  GMP synthase  36.32 
 
 		 510 aa  122  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000788209  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1573  GMP synthase  34.76 
 
 		 507 aa  122  3e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1203  glutamine amidotransferase class-I  37.43 
 
 		 188 aa  122  3e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.858252  hitchhiker  0.00205906 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2551  GMP synthase, large subunit  38.92 
 
 		 533 aa  122  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  34.9 
 
 		 522 aa  122  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  36.76 
 
 		 516 aa  122  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1543  GMP synthase, large subunit  34.05 
 
 		 507 aa  122  4e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0501  GMP synthase  34.22 
 
 		 511 aa  121  5e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0247  GMP synthase  37.84 
 
 		 512 aa  121  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000963805  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0887  GMP synthase, large subunit  36.76 
 
 		 510 aa  121  5e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000175854  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0626  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing), C-terminal domain protein  33.86 
 
 		 520 aa  121  5e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2703  GMP synthase  32.31 
 
 		 525 aa  121  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.668496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00451  GMP synthase  34.03 
 
 		 528 aa  121  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2766  GMP synthase  32.31 
 
 		 525 aa  121  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0046  GMP synthase  35.6 
 
 		 528 aa  121  7e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0037  GMP synthase  33.51 
 
 		 528 aa  121  7e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.344786  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2875  GMP synthase  32.31 
 
 		 525 aa  121  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2659  GMP synthase  32.31 
 
 		 525 aa  121  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00262883  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28370  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.87 
 
 		 526 aa  121  7e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3003  GMP synthase  36.41 
 
 		 525 aa  121  8e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.417306  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2744  GMP synthase  32.31 
 
 		 525 aa  120  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.903073  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1138  GMP synthase  34.55 
 
 		 525 aa  120  8e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.045866  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2589  GMP synthase  36.46 
 
 		 528 aa  120  9e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1270  GMP synthase  35.23 
 
 		 525 aa  120  9e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0196123  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  32.62 
 
 		 514 aa  120  9e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3141  GMP synthase  33.16 
 
 		 525 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.273688 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0629  GMP synthase large subunit  34.76 
 
 		 517 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.522683 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0722  GMP synthase  33.51 
 
 		 542 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0373308  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1183  GMP synthase C terminal domain protein  33.7 
 
 		 523 aa  120  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.804519  normal  0.853141 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0718  GMP synthase  37.7 
 
 		 513 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0942  GMP synthase, large subunit  37.97 
 
 		 535 aa  120  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00705801  normal  0.0196156 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0694  GMP synthase  33.51 
 
 		 542 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1380  GMP synthase  33.16 
 
 		 525 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.197214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2869  GMP synthase  36.96 
 
 		 529 aa  120  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.256862  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2998  GMP synthase  33.16 
 
 		 525 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0989  GMP synthase  36.13 
 
 		 515 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000791006  hitchhiker  0.000562363 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2983  GMP synthase  33.16 
 
 		 525 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.925294  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3595  GMP synthase  33.33 
 
 		 525 aa  120  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0154182  normal  0.634347 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3119  GMP synthase  33.33 
 
 		 525 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>