More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1364 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1364  GMP synthase subunit A  100 
 
 
189 aa  387  1e-107  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0254  GMP synthase, small subunit  67.91 
 
 
188 aa  280  7.000000000000001e-75  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1203  glutamine amidotransferase class-I  48.92 
 
 
188 aa  186  2e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.858252  hitchhiker  0.00205906 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0606  GMP synthase, small subunit  41.71 
 
 
196 aa  167  6e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0133  GMP synthase subunit A  43.65 
 
 
189 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.361551  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0690  GMP synthase subunit A  41.44 
 
 
189 aa  144  8.000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.635266  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  42.16 
 
 
516 aa  144  9e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1228  GMP synthase subunit A  40.88 
 
 
189 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  43.26 
 
 
511 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0816  GMP synthase  40.64 
 
 
506 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4247  GMP synthase, large subunit  39.78 
 
 
527 aa  139  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  38.04 
 
 
509 aa  137  6e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0264  GMP synthase  40.98 
 
 
507 aa  137  7e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0869  GMP synthase subunit A  39.78 
 
 
188 aa  137  7e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.143243  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5989  GMP synthase  38.17 
 
 
534 aa  137  7e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.319605  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0756  GMP synthase subunit A  40.88 
 
 
189 aa  137  7.999999999999999e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0166  GMP synthase subunit A  39.68 
 
 
181 aa  137  8.999999999999999e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1573  GMP synthase  37.17 
 
 
507 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  37.5 
 
 
509 aa  134  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  40.33 
 
 
510 aa  134  8e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0231  GMP synthase  38.54 
 
 
517 aa  134  9e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.233055  hitchhiker  2.8816700000000002e-18 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0626  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing), C-terminal domain protein  39.25 
 
 
520 aa  133  1.9999999999999998e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  39.47 
 
 
510 aa  132  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0371  GMP synthase  39.78 
 
 
522 aa  132  3e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0220  GMP synthase  40.78 
 
 
522 aa  132  3.9999999999999996e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  35.98 
 
 
514 aa  131  3.9999999999999996e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  38.83 
 
 
512 aa  131  5e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0629  GMP synthase large subunit  37.97 
 
 
517 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.522683 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2444  GMP synthase, small subunit  38.83 
 
 
184 aa  130  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.433142  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1133  GMP synthase  40.66 
 
 
508 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0645  GMP synthase  36.56 
 
 
556 aa  129  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.559088  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0702  GMP synthase  37.63 
 
 
520 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1617  GMP synthase  37.5 
 
 
517 aa  130  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.322127  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1489  GMP synthase, small subunit  38.62 
 
 
184 aa  129  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0029  GMP synthase subunit A  38.1 
 
 
183 aa  129  3e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.138973  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  37.3 
 
 
513 aa  129  3e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2424  GMP synthase subunit A  35.29 
 
 
182 aa  128  6e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176542  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0046  GMP synthase  38.74 
 
 
507 aa  127  7.000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.214128  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1772  GMP synthase  39.15 
 
 
505 aa  127  7.000000000000001e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.564322  hitchhiker  0.00463456 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1723  GMP synthase  42.47 
 
 
505 aa  127  7.000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.734167 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2375  GMP synthase  37.97 
 
 
513 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0414714  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2202  GMP synthase  40.32 
 
 
511 aa  127  8.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0070  GMP synthase  39.01 
 
 
513 aa  127  9.000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.851751  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0919  GMP synthase subunit A  40.74 
 
 
189 aa  127  9.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.956828 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0966  GMP synthase  33.68 
 
 
509 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.527198  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0452  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  37.64 
 
 
510 aa  126  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000512044  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0438  GMP synthase  37.97 
 
 
513 aa  126  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  38.3 
 
 
518 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1228  GMP synthase, large subunit  39.79 
 
 
513 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0449  GMP synthase  37.97 
 
 
513 aa  126  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2589  GMP synthase  36.02 
 
 
528 aa  125  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0718  GMP synthase  38.2 
 
 
513 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  37.62 
 
 
522 aa  125  5e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1516  GMP synthase  40.98 
 
 
505 aa  124  7e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0291  GMP synthase  38.76 
 
 
512 aa  123  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000390147  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1139  GMP synthase  35.71 
 
 
526 aa  123  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.137379 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0319  GMP synthase  38.76 
 
 
515 aa  123  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000015999  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  38.76 
 
 
512 aa  123  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0254  GMP synthase  38.2 
 
 
515 aa  122  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0140882  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0243  GMP synthase  38.2 
 
 
515 aa  122  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151075  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  38.2 
 
 
512 aa  122  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1588  GMP synthase subunit A  38.12 
 
 
188 aa  122  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0392  GMP synthase, large subunit  35.79 
 
 
509 aa  123  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.932564  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2002  GMP synthase subunit A  35.45 
 
 
189 aa  123  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.3362  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  38.76 
 
 
512 aa  123  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0294  GMP synthase  38.2 
 
 
512 aa  122  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1183  GMP synthase C terminal domain protein  35.83 
 
 
523 aa  123  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.804519  normal  0.853141 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0247  GMP synthase  38.76 
 
 
512 aa  122  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000963805  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0240  GMP synthase  38.2 
 
 
515 aa  122  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000319798  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0705  GMP synthase, large subunit  38.67 
 
 
524 aa  122  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  35.71 
 
 
512 aa  122  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  38.76 
 
 
512 aa  122  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0342  GMP synthase  39.57 
 
 
514 aa  122  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1718  GMP synthase  36.6 
 
 
523 aa  121  6e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0887175  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0887  GMP synthase, large subunit  39.46 
 
 
510 aa  121  7e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000175854  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0600  GMP synthase  41.88 
 
 
505 aa  120  8e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0760838  hitchhiker  0.0000221926 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4445  GMP synthase, large subunit  35.36 
 
 
520 aa  120  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.637839  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0598  GMP synthase  35.08 
 
 
505 aa  120  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.57475 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28370  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  36.56 
 
 
526 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1784  GMP synthase  35.11 
 
 
510 aa  119  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0148865  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0749  GMP synthase  37.16 
 
 
547 aa  119  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02972  GMP synthase  34.52 
 
 
525 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1557  GMP synthase, large subunit  36.92 
 
 
512 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000239894  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2576  GMP synthase  35.71 
 
 
529 aa  119  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000141885 
 
 
-
 
NC_002978  WD0195  GMP synthase  37.95 
 
 
520 aa  119  3e-26  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.284915  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4006  GMP synthase, large subunit  36.46 
 
 
526 aa  119  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.371451 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02020  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  37.17 
 
 
510 aa  119  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08800  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  37.36 
 
 
533 aa  119  3e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2869  GMP synthase  36.26 
 
 
529 aa  119  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.256862  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0375  GMP synthase  36.26 
 
 
511 aa  119  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216851  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1937  GMP synthase large subunit  36.65 
 
 
508 aa  119  3.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000487266 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1739  GMP synthase  36.65 
 
 
512 aa  118  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004340  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.11 
 
 
517 aa  119  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  35.94 
 
 
518 aa  118  4.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0290  GMP synthase  33.82 
 
 
524 aa  118  6e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1250  GMP synthase, large subunit  36.26 
 
 
523 aa  117  7e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.026459  normal  0.348745 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1583  GMP synthase  32.46 
 
 
513 aa  117  7e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1423  GMP synthase, large subunit  36.5 
 
 
512 aa  118  7e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1667  GMP synthase  34.21 
 
 
513 aa  117  7e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0989  GMP synthase  35.98 
 
 
515 aa  117  7.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000791006  hitchhiker  0.000562363 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>