More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2424 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2424  GMP synthase subunit A  100 
 
 		 182 aa  368  1e-101  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176542  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0029  GMP synthase subunit A  81.87 
 
 		 183 aa  300  7.000000000000001e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.138973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2444  GMP synthase, small subunit  78.02 
 
 		 184 aa  298  2e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.433142  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1489  GMP synthase, small subunit  76.37 
 
 		 184 aa  291  4e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0571  GMP synthase subunit A  78.02 
 
 		 184 aa  264  4e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0736  GMP synthase subunit A  51.37 
 
 		 184 aa  197  9e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.683361  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2002  GMP synthase subunit A  51.63 
 
 		 189 aa  194  5.000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.3362  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0166  GMP synthase subunit A  51.38 
 
 		 181 aa  186  1e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1588  GMP synthase subunit A  50.54 
 
 		 188 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1547  GMP synthase subunit A  48.6 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0919  GMP synthase subunit A  52.72 
 
 		 189 aa  179  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.956828 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0704  GMP synthase subunit A  49.73 
 
 		 184 aa  176  2e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.2759 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0869  GMP synthase subunit A  39.34 
 
 		 188 aa  149  2e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.143243  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0690  GMP synthase subunit A  40.44 
 
 		 189 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.635266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1228  GMP synthase subunit A  40.44 
 
 		 189 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0133  GMP synthase subunit A  39.34 
 
 		 189 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.361551  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0756  GMP synthase subunit A  38.25 
 
 		 189 aa  144  6e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0606  GMP synthase, small subunit  41.71 
 
 		 196 aa  141  6e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1617  GMP synthase  37.97 
 
 		 517 aa  134  5e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.322127  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0254  GMP synthase, small subunit  36.9 
 
 		 188 aa  134  7.000000000000001e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00906  GMP synthase  40.1 
 
 		 521 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00923984  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1269  GMP synthase  40.31 
 
 		 525 aa  129  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0189098  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3003  GMP synthase  40.31 
 
 		 525 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.417306  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1364  GMP synthase subunit A  35.29 
 
 		 189 aa  128  5.0000000000000004e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0887  GMP synthase, large subunit  41.3 
 
 		 510 aa  127  7.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000175854  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10270  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  42.02 
 
 		 530 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.38684 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0702  GMP synthase  40.44 
 
 		 520 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08800  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  42.22 
 
 		 533 aa  124  5e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1128  GMP synthase, large subunit  38.78 
 
 		 525 aa  124  8.000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340292  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1672  GMP synthase  37.77 
 
 		 521 aa  124  9e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.605377  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0501  GMP synthase  37.57 
 
 		 511 aa  123  1e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19190  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  38.83 
 
 		 536 aa  123  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0538351 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0598  GMP synthase  39.78 
 
 		 505 aa  123  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.57475 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2728  GMP synthase, large subunit  38.78 
 
 		 525 aa  124  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.211488  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  40.76 
 
 		 518 aa  122  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3123  GMP synthase  37.56 
 
 		 525 aa  122  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1298  GMP synthase  37.56 
 
 		 525 aa  122  4e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  36.96 
 
 		 509 aa  121  5e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0294  GMP synthase  35.83 
 
 		 537 aa  121  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.223502  normal  0.0574353 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1438  GMP synthase  38.04 
 
 		 510 aa  121  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000788209  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1270  GMP synthase  37.56 
 
 		 525 aa  121  6e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0196123  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  35.68 
 
 		 512 aa  121  6e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1557  GMP synthase, large subunit  31.94 
 
 		 512 aa  121  7e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000239894  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2589  GMP synthase  40.56 
 
 		 528 aa  121  7e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  39.67 
 
 		 516 aa  121  7e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  37.5 
 
 		 509 aa  120  7e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1314  GMP synthase  37.88 
 
 		 525 aa  120  7e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.867472  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3485  GMP synthase  38.61 
 
 		 525 aa  120  8e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  34.78 
 
 		 511 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1054  GMP synthase  37.97 
 
 		 540 aa  120  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  hitchhiker  0.000561419 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0738  GMP synthase  37.89 
 
 		 517 aa  120  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0749  GMP synthase  40.44 
 
 		 547 aa  120  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  39.01 
 
 		 518 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0297  GMP synthase  38.1 
 
 		 517 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1133  GMP synthase  34.59 
 
 		 508 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  38.59 
 
 		 510 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2375  GMP synthase  36.9 
 
 		 513 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0414714  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01077  GMP synthase  38.95 
 
 		 517 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0189  GMP synthase, large subunit  38.74 
 
 		 529 aa  119  1.9999999999999998e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0433911 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16470  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  38.92 
 
 		 539 aa  119  1.9999999999999998e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.68109  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  38.17 
 
 		 510 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1727  GMP synthase  40 
 
 		 525 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.865891  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0009  GMP synthase  37.17 
 
 		 536 aa  119  3e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000958446 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0392  GMP synthase, large subunit  37.97 
 
 		 509 aa  119  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.932564  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3595  GMP synthase  37.24 
 
 		 525 aa  119  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0154182  normal  0.634347 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0610  GMP synthase  38.73 
 
 		 528 aa  119  3e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.558276  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1588  GMP synthase  38.54 
 
 		 522 aa  119  3e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0989  GMP synthase  38.17 
 
 		 515 aa  119  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000791006  hitchhiker  0.000562363 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4445  GMP synthase, large subunit  42.62 
 
 		 520 aa  119  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.637839  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  38.86 
 
 		 522 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0254  GMP synthase  35.48 
 
 		 515 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0140882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0240  GMP synthase  35.48 
 
 		 515 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000319798  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl342  GMP synthase  32.97 
 
 		 513 aa  118  3.9999999999999996e-26  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.013965  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0243  GMP synthase  35.48 
 
 		 515 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151075  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  35.48 
 
 		 512 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0294  GMP synthase  35.48 
 
 		 512 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1560  GMP synthase  36.04 
 
 		 525 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0816  GMP synthase  40.11 
 
 		 506 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  35.83 
 
 		 512 aa  117  6e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  35.48 
 
 		 512 aa  118  6e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0070  GMP synthase  38.17 
 
 		 513 aa  117  7e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.851751  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0966  GMP synthase  38.5 
 
 		 509 aa  117  7e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.527198  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004340  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  38.42 
 
 		 517 aa  117  7e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0231  GMP synthase  32.98 
 
 		 517 aa  117  7e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.233055  hitchhiker  2.8816700000000002e-18 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1138  GMP synthase  36.68 
 
 		 525 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.045866  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0291  GMP synthase  34.95 
 
 		 512 aa  117  9e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000390147  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2645  GMP synthase  36.22 
 
 		 525 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0319  GMP synthase  34.95 
 
 		 515 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000015999  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2358  GMP synthase  38.07 
 
 		 525 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1161  GMP synthase, large subunit  34.87 
 
 		 525 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0469795  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2766  GMP synthase  35.38 
 
 		 525 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2791  GMP synthase  34.87 
 
 		 525 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000385155  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1036  GMP synthase  38.58 
 
 		 523 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.86774  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1708  GMP synthase  37 
 
 		 527 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0016  GMP synthase  37.17 
 
 		 531 aa  116  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0584814  normal  0.856164 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2659  GMP synthase  35.38 
 
 		 525 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00262883  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2875  GMP synthase  35.38 
 
 		 525 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2703  GMP synthase  35.38 
 
 		 525 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.668496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02361  hypothetical protein  34.87 
 
 		 525 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1002  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2882  GMP synthase  34.87 
 
 		 525 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0113861  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>