More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0571 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0571  GMP synthase subunit A  100 
 
 		 184 aa  367  1e-101  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2424  GMP synthase subunit A  78.02 
 
 		 182 aa  293  1e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176542  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1489  GMP synthase, small subunit  74.32 
 
 		 184 aa  285  2.9999999999999996e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0029  GMP synthase subunit A  75.69 
 
 		 183 aa  283  1.0000000000000001e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.138973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2444  GMP synthase, small subunit  73.22 
 
 		 184 aa  281  5.000000000000001e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.433142  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2002  GMP synthase subunit A  53.8 
 
 		 189 aa  204  6e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.3362  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0736  GMP synthase subunit A  51.63 
 
 		 184 aa  193  1e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.683361  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0919  GMP synthase subunit A  53.51 
 
 		 189 aa  190  8e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.956828 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0166  GMP synthase subunit A  49.72 
 
 		 181 aa  181  6e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0704  GMP synthase subunit A  49.73 
 
 		 184 aa  176  2e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.2759 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1588  GMP synthase subunit A  48.37 
 
 		 188 aa  174  6e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1547  GMP synthase subunit A  46.93 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0869  GMP synthase subunit A  42.08 
 
 		 188 aa  155  3e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.143243  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0690  GMP synthase subunit A  42.08 
 
 		 189 aa  144  1e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.635266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0756  GMP synthase subunit A  40.44 
 
 		 189 aa  142  2e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1228  GMP synthase subunit A  42.08 
 
 		 189 aa  141  6e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0133  GMP synthase subunit A  40.44 
 
 		 189 aa  141  6e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.361551  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0254  GMP synthase, small subunit  41.67 
 
 		 188 aa  140  8e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1269  GMP synthase  41.03 
 
 		 525 aa  140  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0189098  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01077  GMP synthase  43.92 
 
 		 517 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3003  GMP synthase  41.54 
 
 		 525 aa  140  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.417306  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0606  GMP synthase, small subunit  41.18 
 
 		 196 aa  139  1.9999999999999998e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1128  GMP synthase, large subunit  41.03 
 
 		 525 aa  138  3.9999999999999997e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340292  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2728  GMP synthase, large subunit  41.03 
 
 		 525 aa  138  4.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.211488  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004340  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  42.86 
 
 		 517 aa  138  6e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0297  GMP synthase  42.86 
 
 		 517 aa  137  6e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1617  GMP synthase  38.46 
 
 		 517 aa  137  7.999999999999999e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.322127  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00906  GMP synthase  41.15 
 
 		 521 aa  136  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00923984  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1298  GMP synthase  40.61 
 
 		 525 aa  137  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3123  GMP synthase  39.09 
 
 		 525 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0738  GMP synthase  42.7 
 
 		 517 aa  135  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3595  GMP synthase  40 
 
 		 525 aa  135  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0154182  normal  0.634347 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1672  GMP synthase  40.43 
 
 		 521 aa  134  8e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.605377  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1560  GMP synthase  39.09 
 
 		 525 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1138  GMP synthase  38.78 
 
 		 525 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.045866  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1270  GMP synthase  40.31 
 
 		 525 aa  131  5e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0196123  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2744  GMP synthase  38.46 
 
 		 525 aa  131  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.903073  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2659  GMP synthase  38.46 
 
 		 525 aa  131  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00262883  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2656  GMP synthase  38.46 
 
 		 525 aa  131  6.999999999999999e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0518373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2882  GMP synthase  38.46 
 
 		 525 aa  131  6.999999999999999e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0113861  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2791  GMP synthase  38.46 
 
 		 525 aa  131  6.999999999999999e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000385155  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2875  GMP synthase  38.46 
 
 		 525 aa  131  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2766  GMP synthase  38.46 
 
 		 525 aa  131  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1170  GMP synthase  38.46 
 
 		 525 aa  131  6.999999999999999e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00961955  normal  0.0544013 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2658  GMP synthase  38.46 
 
 		 525 aa  131  6.999999999999999e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000100783  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3731  GMP synthase  38.46 
 
 		 525 aa  131  6.999999999999999e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00256427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2703  GMP synthase  38.46 
 
 		 525 aa  130  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.668496  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02399  bifunctional GMP synthase/glutamine amidotransferase protein  37.95 
 
 		 525 aa  130  9e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.119389  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1161  GMP synthase, large subunit  37.95 
 
 		 525 aa  130  9e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0469795  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02361  hypothetical protein  37.95 
 
 		 525 aa  130  9e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1002  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0231  GMP synthase  35.79 
 
 		 517 aa  130  9e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.233055  hitchhiker  2.8816700000000002e-18 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  38.62 
 
 		 512 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19190  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  39.89 
 
 		 536 aa  129  2.0000000000000002e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0538351 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0046  GMP synthase  37.63 
 
 		 507 aa  129  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.214128  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10270  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  40.96 
 
 		 530 aa  129  3e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.38684 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2645  GMP synthase  38.69 
 
 		 525 aa  129  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2998  GMP synthase  37.44 
 
 		 525 aa  129  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0177003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0816  GMP synthase  42.31 
 
 		 506 aa  129  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  39.04 
 
 		 511 aa  129  3e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0408  GMP synthase  39.18 
 
 		 525 aa  128  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000376888  decreased coverage  0.00000308048 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1314  GMP synthase  38.78 
 
 		 525 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.867472  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1303  GMP synthase  39.18 
 
 		 525 aa  128  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.222556  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3119  GMP synthase  38.46 
 
 		 525 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1196  GMP synthase  39.18 
 
 		 525 aa  128  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000372416  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2358  GMP synthase  40.31 
 
 		 525 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4241  GMP synthase  38.97 
 
 		 525 aa  127  7.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  39.25 
 
 		 512 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1557  GMP synthase, large subunit  33.51 
 
 		 512 aa  127  8.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000239894  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1203  glutamine amidotransferase class-I  38.22 
 
 		 188 aa  127  9.000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.858252  hitchhiker  0.00205906 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0254  GMP synthase  38.71 
 
 		 515 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0140882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0240  GMP synthase  38.71 
 
 		 515 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000319798  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0243  GMP synthase  38.71 
 
 		 515 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151075  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  38.71 
 
 		 512 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0294  GMP synthase  38.71 
 
 		 512 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  38.71 
 
 		 512 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1460  GMP synthase  39.68 
 
 		 542 aa  125  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.195625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0189  GMP synthase, large subunit  38.71 
 
 		 529 aa  126  2.0000000000000002e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0433911 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1133  GMP synthase  36.76 
 
 		 508 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0291  GMP synthase  38.5 
 
 		 512 aa  125  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000390147  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  35.98 
 
 		 514 aa  125  3e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B17  GMP synthase  34.04 
 
 		 511 aa  125  3e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0319  GMP synthase  38.5 
 
 		 515 aa  125  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000015999  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl342  GMP synthase  35.14 
 
 		 513 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.013965  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3141  GMP synthase  38.81 
 
 		 525 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.273688 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2983  GMP synthase  38.81 
 
 		 525 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.925294  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  37.1 
 
 		 511 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1235  GMP synthase  38.69 
 
 		 525 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.329718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2998  GMP synthase  38.81 
 
 		 525 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1236  GMP synthase  38.69 
 
 		 525 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1380  GMP synthase  38.5 
 
 		 525 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.197214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1306  GMP synthase  38.69 
 
 		 525 aa  124  6e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.439445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0989  GMP synthase  38.17 
 
 		 515 aa  124  7e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000791006  hitchhiker  0.000562363 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1588  GMP synthase  38.54 
 
 		 522 aa  124  7e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0589  GMP synthase  38.74 
 
 		 511 aa  124  9e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0942  GMP synthase, large subunit  39.04 
 
 		 535 aa  124  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00705801  normal  0.0196156 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1573  GMP synthase  35.6 
 
 		 507 aa  123  1e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4247  GMP synthase, large subunit  41.76 
 
 		 527 aa  124  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  38.17 
 
 		 512 aa  124  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02972  GMP synthase  40.51 
 
 		 525 aa  123  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00361  GMP synthase  38.25 
 
 		 528 aa  123  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.859384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>