More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0166 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0166  GMP synthase subunit A  100 
 
 
181 aa  372  1e-102  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2002  GMP synthase subunit A  57.07 
 
 
189 aa  231  6e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.3362  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0919  GMP synthase subunit A  60 
 
 
189 aa  217  7e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.956828 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1489  GMP synthase, small subunit  53.04 
 
 
184 aa  199  1.9999999999999998e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1588  GMP synthase subunit A  51.65 
 
 
188 aa  197  5e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2444  GMP synthase, small subunit  53.59 
 
 
184 aa  195  3e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.433142  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0704  GMP synthase subunit A  53.85 
 
 
184 aa  192  3e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.2759 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0736  GMP synthase subunit A  51.1 
 
 
184 aa  191  7e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.683361  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2424  GMP synthase subunit A  51.38 
 
 
182 aa  186  1e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176542  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1547  GMP synthase subunit A  47.51 
 
 
185 aa  183  9e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0029  GMP synthase subunit A  47.51 
 
 
183 aa  176  2e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.138973  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1228  GMP synthase subunit A  44.51 
 
 
189 aa  169  2e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0133  GMP synthase subunit A  45.6 
 
 
189 aa  168  4e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.361551  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0690  GMP synthase subunit A  43.96 
 
 
189 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.635266  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0869  GMP synthase subunit A  41.21 
 
 
188 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.143243  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0571  GMP synthase subunit A  49.72 
 
 
184 aa  161  5.0000000000000005e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0756  GMP synthase subunit A  42.86 
 
 
189 aa  156  2e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0606  GMP synthase, small subunit  42.02 
 
 
196 aa  153  1e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1364  GMP synthase subunit A  39.68 
 
 
189 aa  137  7.999999999999999e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0254  GMP synthase, small subunit  39.36 
 
 
188 aa  136  1e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  39.46 
 
 
513 aa  133  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0816  GMP synthase  42.16 
 
 
506 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1784  GMP synthase  38.92 
 
 
510 aa  132  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0148865  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  38.92 
 
 
516 aa  131  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08800  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  40.11 
 
 
533 aa  127  9.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  39.46 
 
 
510 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0718  GMP synthase  38.04 
 
 
513 aa  124  6e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1438  GMP synthase  38.92 
 
 
510 aa  122  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000788209  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0163  GMP synthase, large subunit  35.33 
 
 
525 aa  123  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1617  GMP synthase  35.29 
 
 
517 aa  121  5e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.322127  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  36.22 
 
 
512 aa  121  5e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0231  GMP synthase  35.29 
 
 
517 aa  121  5e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.233055  hitchhiker  2.8816700000000002e-18 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4247  GMP synthase, large subunit  37.57 
 
 
527 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0702  GMP synthase  36.41 
 
 
520 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2576  GMP synthase  36.81 
 
 
529 aa  119  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000141885 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0220  GMP synthase  35.16 
 
 
522 aa  116  1.9999999999999998e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0046  GMP synthase  33.7 
 
 
507 aa  116  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.214128  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2589  GMP synthase  35.91 
 
 
528 aa  115  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0626  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing), C-terminal domain protein  35.87 
 
 
520 aa  115  3e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1264  GMP synthase  34.24 
 
 
510 aa  115  3e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2202  GMP synthase  39.46 
 
 
511 aa  115  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0966  GMP synthase  34.76 
 
 
509 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.527198  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0769  GMP synthase, large subunit  34.59 
 
 
510 aa  115  5e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.655453  hitchhiker  0.000357154 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1203  glutamine amidotransferase class-I  37.84 
 
 
188 aa  114  5e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.858252  hitchhiker  0.00205906 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2949  GMP synthase  35.9 
 
 
526 aa  115  5e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.177687 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  33.16 
 
 
514 aa  114  6e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2375  GMP synthase  36.22 
 
 
513 aa  114  6e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0414714  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1875  GMP synthase, large subunit  34.95 
 
 
533 aa  114  7.999999999999999e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.124967  decreased coverage  0.00513433 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  35.91 
 
 
512 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0291  GMP synthase  35.16 
 
 
512 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000390147  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1183  GMP synthase C terminal domain protein  35.29 
 
 
523 aa  114  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.804519  normal  0.853141 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0319  GMP synthase  35.16 
 
 
515 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000015999  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  35.68 
 
 
511 aa  114  8.999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0449  GMP synthase  38.67 
 
 
513 aa  114  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  33.87 
 
 
511 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0438  GMP synthase  38.67 
 
 
513 aa  114  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  37.69 
 
 
522 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  35.14 
 
 
509 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1138  GMP synthase  35.53 
 
 
525 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.045866  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2869  GMP synthase  36.26 
 
 
529 aa  113  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.256862  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  33.69 
 
 
512 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0337  GMP synthase, large subunit  34.62 
 
 
510 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1314  GMP synthase  36.04 
 
 
525 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.867472  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  35.91 
 
 
512 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1739  GMP synthase  34.22 
 
 
512 aa  113  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1460  GMP synthase  35.9 
 
 
542 aa  113  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.195625  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  36.9 
 
 
510 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2998  GMP synthase  31.28 
 
 
525 aa  112  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0177003  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0705  GMP synthase, large subunit  35.36 
 
 
524 aa  112  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  35.91 
 
 
512 aa  112  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1199  GMP synthase  33.5 
 
 
522 aa  112  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.651967  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28370  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.52 
 
 
526 aa  112  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1298  GMP synthase  35.86 
 
 
525 aa  112  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  34.59 
 
 
509 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0254  GMP synthase  35.36 
 
 
515 aa  111  5e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0140882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0240  GMP synthase  35.36 
 
 
515 aa  111  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000319798  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0243  GMP synthase  35.36 
 
 
515 aa  111  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151075  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1560  GMP synthase  36.36 
 
 
525 aa  111  5e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B17  GMP synthase  35.83 
 
 
511 aa  111  5e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3292  GMP synthase  34.36 
 
 
525 aa  111  6e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  35.36 
 
 
512 aa  111  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1708  GMP synthase  34.52 
 
 
527 aa  111  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0247  GMP synthase  35.91 
 
 
512 aa  111  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000963805  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2429  GMP synthase  34.52 
 
 
527 aa  111  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0294  GMP synthase  35.36 
 
 
512 aa  111  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0989  GMP synthase  34.24 
 
 
515 aa  111  6e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000791006  hitchhiker  0.000562363 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0070  GMP synthase  38.12 
 
 
513 aa  111  7.000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.851751  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00361  GMP synthase  35.71 
 
 
528 aa  110  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.859384  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0964  GMP synthase  35.64 
 
 
518 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3595  GMP synthase  31.12 
 
 
525 aa  110  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0154182  normal  0.634347 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0501  GMP synthase  32.78 
 
 
511 aa  110  1.0000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0629  GMP synthase large subunit  35.29 
 
 
517 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.522683 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00361  GMP synthase  34.62 
 
 
528 aa  109  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2983  GMP synthase  33.33 
 
 
525 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.925294  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3141  GMP synthase  33.33 
 
 
525 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.273688 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0015  GMP synthase  32.82 
 
 
532 aa  109  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.235317 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2875  GMP synthase  30.77 
 
 
525 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1380  GMP synthase  33.33 
 
 
525 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.197214  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2703  GMP synthase  30.77 
 
 
525 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.668496  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2766  GMP synthase  30.77 
 
 
525 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>