More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1489 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1489  GMP synthase, small subunit  100 
 
 
184 aa  370  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2444  GMP synthase, small subunit  85.87 
 
 
184 aa  322  2e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.433142  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2424  GMP synthase subunit A  76.37 
 
 
182 aa  291  4e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176542  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0029  GMP synthase subunit A  73.51 
 
 
183 aa  284  5.999999999999999e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.138973  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0571  GMP synthase subunit A  74.32 
 
 
184 aa  257  8e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2002  GMP synthase subunit A  54.35 
 
 
189 aa  210  7.999999999999999e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.3362  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0919  GMP synthase subunit A  57.84 
 
 
189 aa  200  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.956828 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0166  GMP synthase subunit A  53.04 
 
 
181 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1588  GMP synthase subunit A  50.8 
 
 
188 aa  191  7e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0704  GMP synthase subunit A  50.54 
 
 
184 aa  183  2.0000000000000003e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.2759 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0736  GMP synthase subunit A  48.65 
 
 
184 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.683361  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1547  GMP synthase subunit A  46.45 
 
 
185 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0756  GMP synthase subunit A  40.98 
 
 
189 aa  158  5e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0133  GMP synthase subunit A  42.08 
 
 
189 aa  156  2e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.361551  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0690  GMP synthase subunit A  40.98 
 
 
189 aa  155  4e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.635266  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0869  GMP synthase subunit A  41.53 
 
 
188 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.143243  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1228  GMP synthase subunit A  40.98 
 
 
189 aa  152  4e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0606  GMP synthase, small subunit  41.71 
 
 
196 aa  146  2.0000000000000003e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1298  GMP synthase  38.69 
 
 
525 aa  134  8e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  41.49 
 
 
516 aa  134  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0254  GMP synthase, small subunit  39.36 
 
 
188 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1617  GMP synthase  34.74 
 
 
517 aa  130  7.999999999999999e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.322127  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1364  GMP synthase subunit A  38.62 
 
 
189 aa  129  2.0000000000000002e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1314  GMP synthase  38.27 
 
 
525 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.867472  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1312  GMP synthase  39.59 
 
 
527 aa  128  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1138  GMP synthase  37.24 
 
 
525 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.045866  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3123  GMP synthase  37.19 
 
 
525 aa  127  6e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0989  GMP synthase  38.71 
 
 
515 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000791006  hitchhiker  0.000562363 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1560  GMP synthase  37.06 
 
 
525 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1708  GMP synthase  39.71 
 
 
527 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  36.02 
 
 
511 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1270  GMP synthase  36.73 
 
 
525 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0196123  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1269  GMP synthase  38.07 
 
 
525 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0189098  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2429  GMP synthase  39.22 
 
 
527 aa  125  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19190  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  39.27 
 
 
536 aa  125  3e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0538351 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1036  GMP synthase  39.69 
 
 
523 aa  125  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.86774  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3003  GMP synthase  38.07 
 
 
525 aa  125  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.417306  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0816  GMP synthase  41.4 
 
 
506 aa  125  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1264  GMP synthase  39.57 
 
 
510 aa  125  3e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0231  GMP synthase  33.68 
 
 
517 aa  125  4.0000000000000003e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.233055  hitchhiker  2.8816700000000002e-18 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1727  GMP synthase  40.1 
 
 
525 aa  125  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.865891  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  35.29 
 
 
512 aa  124  8.000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0046  GMP synthase  37.04 
 
 
507 aa  124  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.214128  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2645  GMP synthase  36.73 
 
 
525 aa  124  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1784  GMP synthase  38.17 
 
 
510 aa  123  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0148865  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  39.78 
 
 
510 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0887  GMP synthase, large subunit  39.68 
 
 
510 aa  123  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000175854  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1203  glutamine amidotransferase class-I  39.06 
 
 
188 aa  123  2e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.858252  hitchhiker  0.00205906 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  36.9 
 
 
509 aa  123  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2358  GMP synthase  38.07 
 
 
525 aa  123  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0702  GMP synthase  37.43 
 
 
520 aa  122  3e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  37.43 
 
 
509 aa  122  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0912  GMP synthase  38.14 
 
 
520 aa  122  3e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00396953  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1494  GMP synthase  36.22 
 
 
524 aa  122  4e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1235  GMP synthase  37.24 
 
 
525 aa  122  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.329718  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1236  GMP synthase  37.24 
 
 
525 aa  122  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  38.71 
 
 
513 aa  121  4e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  33.85 
 
 
514 aa  121  4e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1380  GMP synthase  36.36 
 
 
525 aa  121  4e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.197214  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2184  GMP synthase, large subunit  37.77 
 
 
507 aa  122  4e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.255738  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1557  GMP synthase, large subunit  33.33 
 
 
512 aa  121  5e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000239894  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2998  GMP synthase  36.36 
 
 
525 aa  121  5e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2983  GMP synthase  36.36 
 
 
525 aa  121  5e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.925294  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3141  GMP synthase  36.36 
 
 
525 aa  121  5e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.273688 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  35.52 
 
 
512 aa  121  6e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2644  GMP synthase  34.03 
 
 
513 aa  121  7e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1128  GMP synthase, large subunit  36.55 
 
 
525 aa  121  7e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340292  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1306  GMP synthase  37.24 
 
 
525 aa  121  7e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.439445  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  40.64 
 
 
518 aa  120  8e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  37.82 
 
 
522 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0738  GMP synthase  37.37 
 
 
517 aa  120  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  35.52 
 
 
512 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2728  GMP synthase, large subunit  36.55 
 
 
525 aa  120  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.211488  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1573  GMP synthase  34.02 
 
 
507 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  35.52 
 
 
512 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1430  GMP synthase  35.71 
 
 
524 aa  120  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0291  GMP synthase  34.97 
 
 
512 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000390147  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0254  GMP synthase  35.52 
 
 
515 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0140882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0240  GMP synthase  35.52 
 
 
515 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000319798  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0243  GMP synthase  35.52 
 
 
515 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151075  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  35.52 
 
 
512 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01077  GMP synthase  39.15 
 
 
517 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0189  GMP synthase, large subunit  37.82 
 
 
529 aa  120  1.9999999999999998e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0433911 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0626  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing), C-terminal domain protein  37.37 
 
 
520 aa  119  1.9999999999999998e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0421  GMP synthase  37.44 
 
 
523 aa  119  1.9999999999999998e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0294  GMP synthase  35.52 
 
 
512 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2496  GMP synthase  39.36 
 
 
515 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.1964  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1739  GMP synthase  40 
 
 
512 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0070  GMP synthase  38.58 
 
 
513 aa  119  3e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.851751  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0319  GMP synthase  34.97 
 
 
515 aa  119  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000015999  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1588  GMP synthase  37.11 
 
 
522 aa  119  3e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1912  GMP synthase, large subunit  39.69 
 
 
525 aa  119  3e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0247  GMP synthase  35.52 
 
 
512 aa  119  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000963805  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0598  GMP synthase  36.51 
 
 
505 aa  119  3e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.57475 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0449  GMP synthase  38 
 
 
513 aa  119  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3292  GMP synthase  36.73 
 
 
525 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3595  GMP synthase  36.04 
 
 
525 aa  118  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0154182  normal  0.634347 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  36.9 
 
 
516 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0438  GMP synthase  38 
 
 
513 aa  119  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00906  GMP synthase  34.02 
 
 
521 aa  118  3.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00923984  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>