More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2444 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2444  GMP synthase, small subunit  100 
 
 
184 aa  371  1e-102  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.433142  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1489  GMP synthase, small subunit  85.87 
 
 
184 aa  322  2e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2424  GMP synthase subunit A  78.02 
 
 
182 aa  298  2e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176542  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0029  GMP synthase subunit A  74.73 
 
 
183 aa  286  1e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.138973  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0571  GMP synthase subunit A  73.22 
 
 
184 aa  253  8e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2002  GMP synthase subunit A  54.89 
 
 
189 aa  205  4e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.3362  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0166  GMP synthase subunit A  53.59 
 
 
181 aa  195  3e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1588  GMP synthase subunit A  52.72 
 
 
188 aa  193  1e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0919  GMP synthase subunit A  57.61 
 
 
189 aa  193  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.956828 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0736  GMP synthase subunit A  49.46 
 
 
184 aa  191  6e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.683361  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0704  GMP synthase subunit A  50 
 
 
184 aa  185  4e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.2759 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1547  GMP synthase subunit A  46.99 
 
 
185 aa  178  4.999999999999999e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0133  GMP synthase subunit A  45.36 
 
 
189 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.361551  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0690  GMP synthase subunit A  43.17 
 
 
189 aa  160  9e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.635266  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1228  GMP synthase subunit A  43.72 
 
 
189 aa  159  2e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0756  GMP synthase subunit A  40.98 
 
 
189 aa  157  1e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0869  GMP synthase subunit A  40.98 
 
 
188 aa  153  1e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.143243  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1312  GMP synthase  43.15 
 
 
527 aa  140  8e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1617  GMP synthase  38.42 
 
 
517 aa  138  3.9999999999999997e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.322127  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0254  GMP synthase, small subunit  40.64 
 
 
188 aa  137  1e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1298  GMP synthase  40.82 
 
 
525 aa  137  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0606  GMP synthase, small subunit  40.98 
 
 
196 aa  136  2e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3003  GMP synthase  40 
 
 
525 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.417306  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1784  GMP synthase  39.78 
 
 
510 aa  135  4e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0148865  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0231  GMP synthase  37.37 
 
 
517 aa  135  4e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.233055  hitchhiker  2.8816700000000002e-18 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1560  GMP synthase  39.39 
 
 
525 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2429  GMP synthase  42.16 
 
 
527 aa  134  9e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1708  GMP synthase  42.16 
 
 
527 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3123  GMP synthase  39.09 
 
 
525 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  41.44 
 
 
516 aa  132  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1036  GMP synthase  41.24 
 
 
523 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.86774  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1269  GMP synthase  38.97 
 
 
525 aa  132  3e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0189098  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  43.96 
 
 
518 aa  131  5e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0421  GMP synthase  40.41 
 
 
523 aa  131  6e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  37.57 
 
 
511 aa  130  7.999999999999999e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1128  GMP synthase, large subunit  38.97 
 
 
525 aa  130  7.999999999999999e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340292  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0738  GMP synthase  37.97 
 
 
517 aa  130  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0070  GMP synthase  39.25 
 
 
513 aa  130  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.851751  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1364  GMP synthase subunit A  38.83 
 
 
189 aa  130  1.0000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1138  GMP synthase  38.46 
 
 
525 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.045866  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1727  GMP synthase  40.74 
 
 
525 aa  130  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.865891  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4241  GMP synthase  38.46 
 
 
525 aa  129  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0046  GMP synthase  38.17 
 
 
507 aa  129  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.214128  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1314  GMP synthase  38.46 
 
 
525 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.867472  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2728  GMP synthase, large subunit  38.46 
 
 
525 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.211488  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0297  GMP synthase  39.01 
 
 
517 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1557  GMP synthase, large subunit  35.6 
 
 
512 aa  129  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000239894  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0989  GMP synthase  40 
 
 
515 aa  129  3e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000791006  hitchhiker  0.000562363 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0610  GMP synthase  40.1 
 
 
528 aa  129  3e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.558276  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2337  GMP synthase  39.39 
 
 
544 aa  129  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.112508 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1912  GMP synthase, large subunit  42.27 
 
 
525 aa  129  3e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1588  GMP synthase  40.31 
 
 
522 aa  129  3e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2358  GMP synthase  40.31 
 
 
525 aa  129  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3595  GMP synthase  37.44 
 
 
525 aa  129  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0154182  normal  0.634347 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2703  GMP synthase  39.29 
 
 
525 aa  128  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.668496  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3485  GMP synthase  40.21 
 
 
525 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2998  GMP synthase  39.29 
 
 
525 aa  128  4.0000000000000003e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0177003  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0449  GMP synthase  38.1 
 
 
513 aa  128  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2744  GMP synthase  39.09 
 
 
525 aa  128  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.903073  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0438  GMP synthase  38.1 
 
 
513 aa  128  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2875  GMP synthase  39.29 
 
 
525 aa  128  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2766  GMP synthase  39.29 
 
 
525 aa  128  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2659  GMP synthase  39.29 
 
 
525 aa  128  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00262883  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19190  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  41.05 
 
 
536 aa  128  5.0000000000000004e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0538351 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2791  GMP synthase  36.41 
 
 
525 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000385155  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00906  GMP synthase  37.17 
 
 
521 aa  127  9.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00923984  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3731  GMP synthase  36.41 
 
 
525 aa  127  9.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00256427  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1170  GMP synthase  36.41 
 
 
525 aa  127  9.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00961955  normal  0.0544013 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2658  GMP synthase  36.41 
 
 
525 aa  127  9.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000100783  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2656  GMP synthase  36.41 
 
 
525 aa  127  9.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0518373  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02399  bifunctional GMP synthase/glutamine amidotransferase protein  36.41 
 
 
525 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.119389  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1161  GMP synthase, large subunit  36.41 
 
 
525 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0469795  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2882  GMP synthase  36.41 
 
 
525 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0113861  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0887  GMP synthase, large subunit  41.44 
 
 
510 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000175854  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0009  GMP synthase  37.7 
 
 
536 aa  126  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000958446 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1460  GMP synthase  38.62 
 
 
542 aa  126  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.195625  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1270  GMP synthase  37.89 
 
 
525 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0196123  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01077  GMP synthase  40.22 
 
 
517 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  37.36 
 
 
512 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02361  hypothetical protein  36.41 
 
 
525 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1002  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0964  GMP synthase  40.43 
 
 
518 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1751  GMP synthase  40.72 
 
 
520 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.485294  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1531  GMP synthase  39.79 
 
 
522 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0731  GMP synthase  39 
 
 
525 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0253  GMP synthase  37.36 
 
 
512 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00590273  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  37.36 
 
 
512 aa  125  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1016  GMP synthase  39.69 
 
 
525 aa  125  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.612801  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0702  GMP synthase  39.04 
 
 
520 aa  125  3e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0015  GMP synthase  36.46 
 
 
532 aa  125  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.235317 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1615  GMP synthase  39.49 
 
 
526 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.25634  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  40.33 
 
 
510 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004340  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  37.91 
 
 
517 aa  125  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  39.25 
 
 
510 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  39.56 
 
 
518 aa  125  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1672  GMP synthase  37.17 
 
 
521 aa  125  5e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.605377  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1667  GMP synthase  40.84 
 
 
513 aa  124  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0816  GMP synthase  41.99 
 
 
506 aa  125  5e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1203  glutamine amidotransferase class-I  39.06 
 
 
188 aa  124  6e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.858252  hitchhiker  0.00205906 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2645  GMP synthase  36.92 
 
 
525 aa  124  6e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1264  GMP synthase  39.36 
 
 
510 aa  124  7e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>