More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0254 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0254  GMP synthase, small subunit  100 
 
 
188 aa  385  1e-106  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1364  GMP synthase subunit A  67.91 
 
 
189 aa  280  7.000000000000001e-75  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1203  glutamine amidotransferase class-I  49.19 
 
 
188 aa  179  2e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.858252  hitchhiker  0.00205906 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0606  GMP synthase, small subunit  46.28 
 
 
196 aa  177  9e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  39.89 
 
 
513 aa  144  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1573  GMP synthase  40.43 
 
 
507 aa  143  1e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0869  GMP synthase subunit A  41.44 
 
 
188 aa  142  4e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.143243  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2589  GMP synthase  41.99 
 
 
528 aa  142  4e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  42.7 
 
 
516 aa  142  4e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  40.88 
 
 
510 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  38.1 
 
 
514 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4247  GMP synthase, large subunit  41.99 
 
 
527 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1516  GMP synthase  42.62 
 
 
505 aa  138  3.9999999999999997e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  41.99 
 
 
511 aa  138  3.9999999999999997e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1772  GMP synthase  44.32 
 
 
505 aa  138  4.999999999999999e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.564322  hitchhiker  0.00463456 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0919  GMP synthase subunit A  40 
 
 
189 aa  137  8.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.956828 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2444  GMP synthase, small subunit  40.64 
 
 
184 aa  137  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.433142  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0231  GMP synthase  38.1 
 
 
517 aa  137  1e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.233055  hitchhiker  2.8816700000000002e-18 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0166  GMP synthase subunit A  39.36 
 
 
181 aa  136  1e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5989  GMP synthase  39.89 
 
 
534 aa  136  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.319605  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1588  GMP synthase subunit A  41.57 
 
 
188 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0989  GMP synthase  39.15 
 
 
515 aa  135  4e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000791006  hitchhiker  0.000562363 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0645  GMP synthase  39.36 
 
 
556 aa  135  4e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.559088  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0816  GMP synthase  41.01 
 
 
506 aa  135  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0600  GMP synthase  42.62 
 
 
505 aa  134  7.000000000000001e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0760838  hitchhiker  0.0000221926 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2424  GMP synthase subunit A  36.9 
 
 
182 aa  134  7.000000000000001e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176542  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1723  GMP synthase  43.48 
 
 
505 aa  134  8e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.734167 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2002  GMP synthase subunit A  37.37 
 
 
189 aa  133  9.999999999999999e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.3362  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0887  GMP synthase, large subunit  40.11 
 
 
510 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000175854  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0690  GMP synthase subunit A  40.33 
 
 
189 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.635266  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0571  GMP synthase subunit A  39.89 
 
 
184 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08800  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  41.76 
 
 
533 aa  132  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  39.13 
 
 
509 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0629  GMP synthase large subunit  41.18 
 
 
517 aa  132  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.522683 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4006  GMP synthase, large subunit  41.44 
 
 
526 aa  132  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.371451 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  39.13 
 
 
509 aa  132  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1718  GMP synthase  40.43 
 
 
523 aa  132  3.9999999999999996e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0887175  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0029  GMP synthase subunit A  39.78 
 
 
183 aa  132  3.9999999999999996e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.138973  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0702  GMP synthase  41.3 
 
 
520 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1489  GMP synthase, small subunit  39.36 
 
 
184 aa  132  3.9999999999999996e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2375  GMP synthase  41.01 
 
 
513 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0414714  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1133  GMP synthase  42.16 
 
 
508 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0756  GMP synthase subunit A  41.44 
 
 
189 aa  131  6e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1617  GMP synthase  36.04 
 
 
517 aa  131  6.999999999999999e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.322127  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  40 
 
 
518 aa  130  7.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1228  GMP synthase subunit A  40.33 
 
 
189 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0449  GMP synthase  40.45 
 
 
513 aa  129  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0070  GMP synthase  39.89 
 
 
513 aa  129  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.851751  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0438  GMP synthase  40.45 
 
 
513 aa  129  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0046  GMP synthase  38.62 
 
 
507 aa  129  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.214128  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1784  GMP synthase  38.76 
 
 
510 aa  129  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0148865  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0371  GMP synthase  39.23 
 
 
522 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  38.76 
 
 
510 aa  129  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0626  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing), C-terminal domain protein  41.3 
 
 
520 aa  129  3e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  39.33 
 
 
512 aa  128  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0736  GMP synthase subunit A  35.56 
 
 
184 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.683361  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0133  GMP synthase subunit A  39.23 
 
 
189 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.361551  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  39.34 
 
 
518 aa  128  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0189  GMP synthase, large subunit  38.83 
 
 
529 aa  128  5.0000000000000004e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0433911 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2202  GMP synthase  38.76 
 
 
511 aa  127  7.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2576  GMP synthase  40.66 
 
 
529 aa  127  7.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000141885 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  38.8 
 
 
511 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16470  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  41.44 
 
 
539 aa  127  1.0000000000000001e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.68109  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0749  GMP synthase  41.53 
 
 
547 aa  126  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2869  GMP synthase  41.21 
 
 
529 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.256862  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0645  GMP synthase, large subunit  42.08 
 
 
507 aa  127  1.0000000000000001e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000665212  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0718  GMP synthase  36.61 
 
 
513 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1183  GMP synthase C terminal domain protein  39.57 
 
 
523 aa  126  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.804519  normal  0.853141 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0704  GMP synthase subunit A  37.78 
 
 
184 aa  125  4.0000000000000003e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.2759 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0237  GMP synthase  36.61 
 
 
512 aa  124  6e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  37.5 
 
 
516 aa  124  6e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1438  GMP synthase  39.33 
 
 
510 aa  124  7e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000788209  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004340  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.64 
 
 
517 aa  124  7e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0705  GMP synthase, large subunit  39.78 
 
 
524 aa  124  7e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01077  GMP synthase  35.11 
 
 
517 aa  124  8.000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0392  GMP synthase, large subunit  37.23 
 
 
509 aa  124  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.932564  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1347  GMP synthase  34.18 
 
 
527 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.86051  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1250  GMP synthase, large subunit  37.91 
 
 
523 aa  123  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.026459  normal  0.348745 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2496  GMP synthase  39.25 
 
 
515 aa  124  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.1964  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2551  GMP synthase, large subunit  39.23 
 
 
533 aa  123  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15340  GMP synthase  34.18 
 
 
525 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000261534  hitchhiker  2.19845e-18 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0220  GMP synthase  37.7 
 
 
522 aa  123  1e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70121  GMP synthase  37.36 
 
 
528 aa  124  1e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0970266  normal  0.0696406 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0738  GMP synthase  34.57 
 
 
517 aa  122  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0297  GMP synthase  35.11 
 
 
517 aa  123  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1583  GMP synthase  35.64 
 
 
513 aa  123  2e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28370  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  38.67 
 
 
526 aa  122  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0254  GMP synthase  37.36 
 
 
515 aa  122  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0140882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0240  GMP synthase  37.36 
 
 
515 aa  122  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000319798  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0243  GMP synthase  37.36 
 
 
515 aa  122  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151075  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3458  GMP synthase, large subunit  37.17 
 
 
525 aa  122  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.160895 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0294  GMP synthase  37.36 
 
 
512 aa  122  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  37.91 
 
 
512 aa  122  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  37.36 
 
 
512 aa  122  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0264  GMP synthase  37.08 
 
 
507 aa  122  4e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  37.77 
 
 
516 aa  122  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1494  GMP synthase  34.01 
 
 
524 aa  122  4e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0452  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.96 
 
 
510 aa  121  5e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000512044  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0319  GMP synthase  37.36 
 
 
515 aa  121  5e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000015999  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1228  GMP synthase, large subunit  38.89 
 
 
513 aa  121  5e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>