More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1588 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1588  GMP synthase subunit A  100 
 
 
188 aa  387  1e-107  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0704  GMP synthase subunit A  66.67 
 
 
184 aa  249  2e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.2759 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1547  GMP synthase subunit A  63.48 
 
 
185 aa  243  9.999999999999999e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0736  GMP synthase subunit A  61.75 
 
 
184 aa  238  2.9999999999999997e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.683361  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0166  GMP synthase subunit A  51.65 
 
 
181 aa  197  6e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2002  GMP synthase subunit A  51.37 
 
 
189 aa  194  8.000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.3362  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0919  GMP synthase subunit A  55.74 
 
 
189 aa  193  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.956828 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2444  GMP synthase, small subunit  52.72 
 
 
184 aa  193  1e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.433142  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1489  GMP synthase, small subunit  50.8 
 
 
184 aa  191  7e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2424  GMP synthase subunit A  50.54 
 
 
182 aa  182  2.0000000000000003e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176542  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0029  GMP synthase subunit A  46.52 
 
 
183 aa  174  9.999999999999999e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.138973  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0869  GMP synthase subunit A  42.31 
 
 
188 aa  160  1e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.143243  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0571  GMP synthase subunit A  48.37 
 
 
184 aa  157  6e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0133  GMP synthase subunit A  42.08 
 
 
189 aa  153  2e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.361551  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1228  GMP synthase subunit A  41.53 
 
 
189 aa  151  7e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0606  GMP synthase, small subunit  39.68 
 
 
196 aa  150  1e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0690  GMP synthase subunit A  40.98 
 
 
189 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.635266  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0756  GMP synthase subunit A  38.46 
 
 
189 aa  144  1e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0254  GMP synthase, small subunit  41.57 
 
 
188 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1364  GMP synthase subunit A  38.12 
 
 
189 aa  122  2e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1784  GMP synthase  36.76 
 
 
510 aa  123  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0148865  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  35.87 
 
 
511 aa  122  4e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  35.2 
 
 
514 aa  121  7e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0626  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing), C-terminal domain protein  35.45 
 
 
520 aa  120  8e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0342  GMP synthase  39.09 
 
 
514 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0702  GMP synthase  35.29 
 
 
520 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B17  GMP synthase  35.16 
 
 
511 aa  118  4.9999999999999996e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0163  GMP synthase, large subunit  35.83 
 
 
525 aa  117  7e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0231  GMP synthase  33.51 
 
 
517 aa  116  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.233055  hitchhiker  2.8816700000000002e-18 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2551  GMP synthase, large subunit  37.7 
 
 
533 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02180  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing), putative  34.74 
 
 
544 aa  115  3e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1543  GMP synthase, large subunit  34.41 
 
 
507 aa  115  3.9999999999999997e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1617  GMP synthase  34.27 
 
 
517 aa  114  6e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.322127  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0718  GMP synthase  37.57 
 
 
513 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl342  GMP synthase  33.7 
 
 
513 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.013965  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1133  GMP synthase  34.57 
 
 
508 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05566  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing] (EC 6.3.5.2)(Glutamine amidotransferase)(GMP synthetase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B1L4]  34.54 
 
 
533 aa  112  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152629  normal  0.706749 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70121  GMP synthase  35.11 
 
 
528 aa  112  3e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0970266  normal  0.0696406 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1772  GMP synthase  38.95 
 
 
505 aa  112  3e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.564322  hitchhiker  0.00463456 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1723  GMP synthase  38.1 
 
 
505 aa  112  5e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.734167 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0241  GMP synthase  37.24 
 
 
513 aa  111  5e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.212928  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1516  GMP synthase  38.25 
 
 
505 aa  111  6e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1460  GMP synthase  33.51 
 
 
542 aa  111  8.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.195625  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0694  GMP synthase  33.33 
 
 
542 aa  110  9e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0375  GMP synthase  32.02 
 
 
511 aa  110  9e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216851  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0722  GMP synthase  33.33 
 
 
542 aa  110  9e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0373308  normal  0.160767 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0738  GMP synthase  32.2 
 
 
517 aa  110  9e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0645  GMP synthase, large subunit  36 
 
 
507 aa  110  1.0000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000665212  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  33.15 
 
 
512 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0422  GMP synthase  36.17 
 
 
516 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  31.35 
 
 
516 aa  110  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1708  GMP synthase  31.12 
 
 
527 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0887  GMP synthase, large subunit  33.7 
 
 
510 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000175854  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1875  GMP synthase, large subunit  36.96 
 
 
533 aa  108  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.124967  decreased coverage  0.00513433 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2869  GMP synthase  34.43 
 
 
529 aa  109  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.256862  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0070  GMP synthase  34.55 
 
 
513 aa  108  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.851751  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1203  glutamine amidotransferase class-I  36.41 
 
 
188 aa  108  4.0000000000000004e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.858252  hitchhiker  0.00205906 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2429  GMP synthase  31.09 
 
 
527 aa  108  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0291  GMP synthase  33.15 
 
 
512 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000390147  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0319  GMP synthase  33.15 
 
 
515 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000015999  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3038  GMP synthase, large subunit  34.81 
 
 
515 aa  107  8.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.60036  hitchhiker  0.00129396 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0294  GMP synthase  33.15 
 
 
512 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0268  GMP synthase  33.15 
 
 
512 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000477204  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0966  GMP synthase  32.97 
 
 
509 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.527198  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0254  GMP synthase  33.15 
 
 
515 aa  107  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0140882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0240  GMP synthase  33.15 
 
 
515 aa  107  9.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000319798  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0243  GMP synthase  33.15 
 
 
515 aa  107  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0151075  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2576  GMP synthase  33.33 
 
 
529 aa  107  9.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000141885 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0220  GMP synthase  33.69 
 
 
522 aa  107  9.000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0297  GMP synthase  31.64 
 
 
517 aa  107  9.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28370  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.16 
 
 
526 aa  107  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0449  GMP synthase  34.03 
 
 
513 aa  107  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  32.28 
 
 
509 aa  107  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1583  GMP synthase  33.33 
 
 
513 aa  107  1e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0438  GMP synthase  34.03 
 
 
513 aa  107  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08800  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.88 
 
 
533 aa  107  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  34.05 
 
 
518 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1718  GMP synthase  34.04 
 
 
523 aa  106  2e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0887175  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1557  GMP synthase, large subunit  30.85 
 
 
512 aa  106  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000239894  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1946  GMP synthase  35.42 
 
 
513 aa  106  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  31.75 
 
 
509 aa  106  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00451  GMP synthase  34.04 
 
 
528 aa  106  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0189  GMP synthase, large subunit  34.27 
 
 
529 aa  106  2e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0433911 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2644  GMP synthase  35.53 
 
 
513 aa  106  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5024  GMP synthase  32.61 
 
 
512 aa  105  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000319692  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07680  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.42 
 
 
527 aa  105  3e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.130273  normal  0.713681 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1739  GMP synthase  36.07 
 
 
512 aa  105  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0300  GMP synthase  32.61 
 
 
512 aa  105  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00113361  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0046  GMP synthase  32.62 
 
 
507 aa  105  4e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.214128  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01077  GMP synthase  31.64 
 
 
517 aa  105  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1116  GMP synthase  32.8 
 
 
510 aa  105  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0015  GMP synthase  31.35 
 
 
532 aa  105  5e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.235317 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2880  GMP synthase  31.72 
 
 
542 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1128  GMP synthase, large subunit  33.33 
 
 
525 aa  105  6e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340292  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0189  GMP synthase  32.26 
 
 
575 aa  104  6e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0315  GMP synthase  34.72 
 
 
518 aa  104  6e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.185414 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2589  GMP synthase  31.72 
 
 
528 aa  104  7e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1312  GMP synthase  32.82 
 
 
527 aa  104  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  34.08 
 
 
511 aa  104  7e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0247  GMP synthase  32.61 
 
 
512 aa  104  7e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000963805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>