More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1271 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
269 aa  543  1e-153  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1351  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.38 
 
 
282 aa  284  9e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0383  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  51.35 
 
 
306 aa  264  1e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1373  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.56 
 
 
285 aa  256  4e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00505195  normal  0.27128 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.6 
 
 
279 aa  253  3e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.509477 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.56 
 
 
282 aa  230  1e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.115516  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44908  predicted protein  35 
 
 
877 aa  117  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0274  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.47 
 
 
258 aa  98.2  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39837  predicted protein  31.51 
 
 
309 aa  98.6  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.169011  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2740  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.66 
 
 
257 aa  86.7  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0189  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.24 
 
 
257 aa  84.7  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0413  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.65 
 
 
274 aa  84  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.642509  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.97 
 
 
231 aa  83.2  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.97 
 
 
231 aa  83.2  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.459049  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.56 
 
 
252 aa  81.6  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6613  NYC1; chlorophyll b reductase  38.35 
 
 
254 aa  81.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0625441 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5255  NYC1; chlorophyll b reductase  35.18 
 
 
264 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0552539  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.13 
 
 
262 aa  81.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.365337 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.23 
 
 
266 aa  80.9  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.96 
 
 
274 aa  80.9  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00168385  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.24 
 
 
253 aa  80.5  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.135569  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.11 
 
 
252 aa  80.1  0.00000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1639  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.43 
 
 
274 aa  79.3  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.39 
 
 
274 aa  79  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.157395 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.8 
 
 
263 aa  78.6  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.101369  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.73 
 
 
257 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.07 
 
 
269 aa  76.6  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1969  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.76 
 
 
294 aa  76.3  0.0000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000507932  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.84 
 
 
230 aa  75.1  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0616  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.16 
 
 
266 aa  73.9  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.9 
 
 
244 aa  73.6  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202963  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0991  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  26.26 
 
 
253 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3017  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.21 
 
 
250 aa  73.6  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.85 
 
 
246 aa  73.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0902023 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27 
 
 
274 aa  72  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0476258  hitchhiker  0.000204678 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.83 
 
 
330 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.415615 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.76 
 
 
239 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.34 
 
 
332 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.261589  normal  0.281891 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1154  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  25.76 
 
 
253 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000294561  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.79 
 
 
279 aa  71.6  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0894  hypothetical protein  27.78 
 
 
282 aa  71.2  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0980  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.19 
 
 
238 aa  70.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000633587  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0951  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.03 
 
 
276 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.94 
 
 
262 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.251558  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3989  short chain dehydrogenase  42.35 
 
 
265 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.826773  normal  0.0182099 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0863  hypothetical protein  28.28 
 
 
282 aa  70.5  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2238  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.33 
 
 
317 aa  70.5  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3587  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.05 
 
 
254 aa  70.1  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.302231 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.42 
 
 
330 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0961773  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4563  short chain dehydrogenase  41.18 
 
 
265 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00447639  hitchhiker  0.00143466 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4032  short chain dehydrogenase  28.28 
 
 
268 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4334  short chain dehydrogenase  28.28 
 
 
268 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0926  gluconate 5-dehydrogenase  26.7 
 
 
259 aa  69.3  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6716  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.86 
 
 
247 aa  69.3  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.32 
 
 
274 aa  69.3  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000578748  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.52 
 
 
351 aa  68.9  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.358421  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.44 
 
 
266 aa  68.9  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.871012  hitchhiker  0.000000000383418 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3756  gluconate 5-dehydrogenase  27.41 
 
 
257 aa  68.6  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1110  short chain dehydrogenase  41.18 
 
 
265 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0177225  normal  0.229286 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3663  short chain dehydrogenase  42.35 
 
 
265 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5596  short chain dehydrogenase  42.35 
 
 
265 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.329102 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4704  short chain dehydrogenase  42.35 
 
 
265 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000843868  normal  0.155835 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2282  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.95 
 
 
244 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.626733  normal  0.253561 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0659  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.43 
 
 
245 aa  68.6  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.372694  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6198  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.61 
 
 
260 aa  68.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.93 
 
 
344 aa  68.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.753226  normal  0.910238 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2647  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.32 
 
 
253 aa  68.2  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.63 
 
 
237 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.29 
 
 
263 aa  67.8  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2410  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.92 
 
 
255 aa  67.8  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5867  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32 
 
 
244 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1363  short chain dehydrogenase  29.38 
 
 
258 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.737736 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1861  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.47 
 
 
273 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.0078052  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.01 
 
 
262 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.207826 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4842  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25 
 
 
249 aa  67.8  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00384997  hitchhiker  0.000208801 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.68 
 
 
283 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179165  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3574  short chain dehydrogenase  40 
 
 
267 aa  67  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.11528  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11957  short chain dehydrogenase  33.5 
 
 
255 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0556392  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.72 
 
 
238 aa  67.4  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1138  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.04 
 
 
246 aa  67  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.697899  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4098  short chain dehydrogenase  40 
 
 
265 aa  67  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.474708 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.89 
 
 
249 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.65 
 
 
245 aa  66.6  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.553727  normal  0.0273902 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4238  short chain dehydrogenase  41.18 
 
 
268 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.27 
 
 
248 aa  66.6  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.62 
 
 
186 aa  66.2  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1957  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.19 
 
 
259 aa  66.2  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1960  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.19 
 
 
250 aa  66.6  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223206  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1326  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.04 
 
 
246 aa  66.2  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2218  short chain dehydrogenase  25.25 
 
 
249 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0180  short chain dehydrogenase  41.18 
 
 
269 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.88 
 
 
249 aa  66.2  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5601  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.99 
 
 
252 aa  66.2  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2110  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.78 
 
 
246 aa  65.9  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0101774  normal  0.961149 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.29 
 
 
1219 aa  65.9  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5518  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.61 
 
 
260 aa  65.9  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000468902  normal  0.0104317 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1875  tropinone reductase  27.84 
 
 
258 aa  65.9  0.0000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3606  oxoacyl carrier protein reductase  29.95 
 
 
259 aa  65.5  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.117732  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2093  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.89 
 
 
249 aa  65.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0144582 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1940  tropinone reductase  27.84 
 
 
258 aa  65.5  0.0000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.803191  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>