More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0274 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0274  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
258 aa  529  1e-149  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2740  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.7 
 
 
257 aa  323  1e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0189  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.31 
 
 
257 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0951  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.64 
 
 
276 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5255  NYC1; chlorophyll b reductase  35.27 
 
 
264 aa  170  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0552539  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6613  NYC1; chlorophyll b reductase  34.87 
 
 
254 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0625441 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.57 
 
 
279 aa  118  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39837  predicted protein  29.5 
 
 
309 aa  115  7.999999999999999e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.169011  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.17 
 
 
274 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.157395 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0383  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.35 
 
 
306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.39 
 
 
274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00168385  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1351  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.63 
 
 
282 aa  107  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2503  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase, putative  34.36 
 
 
243 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1800  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.66 
 
 
275 aa  105  9e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.454392 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.75 
 
 
274 aa  105  9e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000578748  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1639  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.66 
 
 
274 aa  104  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.92 
 
 
279 aa  102  5e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.509477 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1969  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.22 
 
 
294 aa  102  6e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000507932  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 
275 aa  101  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.74 
 
 
246 aa  101  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.596846  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.98 
 
 
339 aa  100  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0413  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.16 
 
 
274 aa  99  6e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.642509  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.08 
 
 
282 aa  99.4  6e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.115516  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
248 aa  98.6  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1484  short chain dehydrogenase  29.55 
 
 
238 aa  98.6  9e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0301161  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4446  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.98 
 
 
254 aa  98.2  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.287432  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0259  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
249 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.519285 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2090  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
249 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.120513 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 
248 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0528  short chain dehydrogenase  35.23 
 
 
287 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0774  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
248 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.295991  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0805  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 
248 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0518  short chain dehydrogenase  35.23 
 
 
287 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.693984  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0540  short chain dehydrogenase  35.23 
 
 
287 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0506548  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.47 
 
 
269 aa  98.2  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
249 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0450975 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0699  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
248 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.86 
 
 
239 aa  96.7  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.175599  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3894  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.88 
 
 
248 aa  96.3  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 
248 aa  95.5  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.445367  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1374  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.46 
 
 
253 aa  95.1  9e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.542817  normal  0.89387 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.57 
 
 
266 aa  94.7  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.26 
 
 
252 aa  94.7  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.99 
 
 
249 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0863  hypothetical protein  31.1 
 
 
282 aa  94  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3414  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.65 
 
 
247 aa  93.2  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1171  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.28 
 
 
238 aa  93.2  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.399765 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0690  short chain dehydrogenase  34.8 
 
 
292 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0965776 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1337  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.9 
 
 
238 aa  92  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.541378  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0764  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.05 
 
 
248 aa  92  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.467056  normal  0.141575 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.8 
 
 
249 aa  92  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.999176  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1589  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  28.78 
 
 
243 aa  92  8e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.511722  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.45 
 
 
244 aa  92  9e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0894  hypothetical protein  30.14 
 
 
282 aa  91.3  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44908  predicted protein  28.12 
 
 
877 aa  91.3  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0634  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.89 
 
 
253 aa  91.3  1e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
330 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.415615 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.8 
 
 
330 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0961773  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0659  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.96 
 
 
245 aa  90.9  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.372694  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1378  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.69 
 
 
248 aa  90.9  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.73447  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.16 
 
 
252 aa  90.5  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6105  short-chain dehydrogenase/reductase  36.46 
 
 
265 aa  90.9  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.542291  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.29 
 
 
255 aa  91.3  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.142248  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.86 
 
 
249 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.458004  normal  0.197887 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3258  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30 
 
 
246 aa  90.1  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.266771  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0093  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.46 
 
 
266 aa  89.7  4e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.16 
 
 
252 aa  89.7  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3335  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.28 
 
 
246 aa  89.4  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.62 
 
 
278 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.343225  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0602  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.12 
 
 
256 aa  89.4  5e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1975  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.41 
 
 
252 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.636697  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0904  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.47 
 
 
254 aa  89  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1201  short chain dehydrogenase  30.21 
 
 
289 aa  89  6e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0718298  normal  0.0224844 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0244  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.26 
 
 
291 aa  89.4  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.864634 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.22 
 
 
248 aa  89.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154391  normal  0.241568 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1055  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.8 
 
 
258 aa  89  6e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.95 
 
 
269 aa  89  7e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3994  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.88 
 
 
244 aa  89  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0088  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.09 
 
 
252 aa  89  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11130  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.68 
 
 
255 aa  88.6  8e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1188  short chain dehydrogenase  30.21 
 
 
291 aa  88.6  8e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0152839  normal  0.145128 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2093  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.26 
 
 
249 aa  88.6  9e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0144582 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3792  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.98 
 
 
290 aa  88.6  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4175  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.93 
 
 
258 aa  88.2  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5059  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.09 
 
 
266 aa  88.2  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.28 
 
 
252 aa  87.8  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.75 
 
 
332 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.261589  normal  0.281891 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.81 
 
 
257 aa  87.8  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11380  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.11 
 
 
247 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.833794 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.69 
 
 
239 aa  88.2  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.420603  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.35 
 
 
230 aa  87.4  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3570  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.13 
 
 
246 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3349  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.57 
 
 
246 aa  87.4  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.06131  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3314  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.13 
 
 
246 aa  87.4  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5037  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.84 
 
 
238 aa  87.4  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293143  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3610  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.57 
 
 
246 aa  87.4  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.767339  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.53 
 
 
248 aa  87.8  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3915  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.51 
 
 
248 aa  87.8  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29888  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
186 aa  87.4  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3580  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.13 
 
 
246 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>