More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2740 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2740  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
257 aa  527  1e-149  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0189  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  99.22 
 
 
257 aa  522  1e-147  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0274  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.7 
 
 
258 aa  323  1e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0951  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 
276 aa  178  8e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5255  NYC1; chlorophyll b reductase  35.06 
 
 
264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0552539  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6613  NYC1; chlorophyll b reductase  33.33 
 
 
254 aa  142  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0625441 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.98 
 
 
274 aa  125  5e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.157395 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
279 aa  124  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
274 aa  119  6e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00168385  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.17 
 
 
274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000578748  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1800  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
275 aa  113  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.454392 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0413  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.39 
 
 
274 aa  112  7.000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.642509  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0659  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.52 
 
 
245 aa  110  3e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.372694  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1969  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.69 
 
 
294 aa  107  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000507932  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1639  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.74 
 
 
274 aa  107  3e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1138  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.81 
 
 
246 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.697899  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39837  predicted protein  27.16 
 
 
309 aa  100  3e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.169011  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.72 
 
 
339 aa  96.7  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1326  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.3 
 
 
246 aa  96.7  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3994  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.54 
 
 
244 aa  96.3  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.11 
 
 
282 aa  95.5  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.25135  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 
240 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148916  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.11 
 
 
282 aa  95.1  9e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.694275  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.63 
 
 
252 aa  95.1  9e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3843  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.11 
 
 
282 aa  95.1  9e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.52 
 
 
276 aa  95.1  9e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.952588  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1156  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.34 
 
 
248 aa  94.7  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536759  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.63 
 
 
244 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.11 
 
 
248 aa  95.1  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0361624 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.63 
 
 
244 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365065 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.81 
 
 
247 aa  94.4  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1484  short chain dehydrogenase  28.38 
 
 
238 aa  94.4  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0301161  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.31 
 
 
244 aa  94  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2470  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.32 
 
 
244 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.63 
 
 
252 aa  94.4  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1914  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.67 
 
 
255 aa  94.4  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.142248  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08226  putative 3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  32.66 
 
 
269 aa  94  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.66 
 
 
249 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0450975 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1654  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.11 
 
 
246 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0676994 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3663  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.11 
 
 
246 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0383  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.03 
 
 
306 aa  92.8  5e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2090  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.68 
 
 
249 aa  92.4  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.120513 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3792  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.98 
 
 
290 aa  92.4  6e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.33 
 
 
256 aa  92  7e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44908  predicted protein  28.29 
 
 
877 aa  91.3  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0994  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.46 
 
 
248 aa  91.7  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.931337 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2353  gluconate 5-dehydrogenase  30.74 
 
 
262 aa  91.3  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0032  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.39 
 
 
342 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.891974  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3580  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.58 
 
 
246 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1017  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.53 
 
 
245 aa  90.5  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0112  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.56 
 
 
244 aa  90.1  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.1 
 
 
252 aa  90.1  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3907  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.3 
 
 
246 aa  90.5  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.267776 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0180  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.26 
 
 
245 aa  90.5  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00307059  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.44 
 
 
244 aa  89.7  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1374  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.63 
 
 
253 aa  89.7  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.542817  normal  0.89387 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3782  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.14 
 
 
269 aa  89.4  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3570  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.05 
 
 
246 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0348  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.94 
 
 
244 aa  89.4  5e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.708158  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0863  hypothetical protein  30.24 
 
 
282 aa  89.4  5e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0850  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.89 
 
 
249 aa  89.7  5e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.94 
 
 
261 aa  89.4  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1360  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.63 
 
 
243 aa  89.4  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000468393  normal  0.0479743 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3349  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.75 
 
 
246 aa  89.4  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.06131  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3722  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.1 
 
 
267 aa  89  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.848764  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3610  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.75 
 
 
246 aa  89.4  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.767339  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0634  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.99 
 
 
253 aa  89.4  6e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3314  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.05 
 
 
246 aa  89  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3264  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.05 
 
 
246 aa  88.6  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.32 
 
 
266 aa  89  8e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3563  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.05 
 
 
246 aa  89  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0125613 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1351  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.64 
 
 
282 aa  88.6  9e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0323  clavaldehyde dehydrogenase  33.33 
 
 
245 aa  88.6  9e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.869868 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.37 
 
 
231 aa  88.6  9e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1503  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.12 
 
 
248 aa  88.6  9e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2555  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.37 
 
 
231 aa  88.6  9e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.459049  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2044  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.63 
 
 
242 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252391  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1819  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.63 
 
 
242 aa  88.6  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1793  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.63 
 
 
242 aa  88.6  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.512815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1775  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.63 
 
 
242 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0338  hypothetical protein  29.39 
 
 
257 aa  87.8  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.45 
 
 
282 aa  87.8  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.115516  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1958  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.63 
 
 
242 aa  88.6  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0528  short chain dehydrogenase  30.65 
 
 
287 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3364  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.63 
 
 
239 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115947  hitchhiker  0.00000000000000894376 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0518  short chain dehydrogenase  30.65 
 
 
287 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.693984  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1995  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.63 
 
 
239 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.591310000000001e-44 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.58 
 
 
246 aa  88.2  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.809389  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1964  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.63 
 
 
239 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130885  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2065  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.63 
 
 
239 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000861938  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0540  short chain dehydrogenase  30.65 
 
 
287 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0506548  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.11 
 
 
317 aa  88.2  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00194851  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0894  hypothetical protein  29.76 
 
 
282 aa  87.8  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.28 
 
 
248 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154391  normal  0.241568 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.63 
 
 
260 aa  87.4  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4175  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.68 
 
 
258 aa  87.4  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.77 
 
 
244 aa  87.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202963  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2238  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.05 
 
 
317 aa  87  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.89 
 
 
256 aa  87.4  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10290  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.84 
 
 
250 aa  87.8  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00209821  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>