More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6613 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6613  NYC1; chlorophyll b reductase  100 
 
 
254 aa  504  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0625441 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0951  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.7 
 
 
276 aa  201  8e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5255  NYC1; chlorophyll b reductase  45.93 
 
 
264 aa  195  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0552539  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0189  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.66 
 
 
257 aa  162  7e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2740  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.66 
 
 
257 aa  162  7e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0274  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.97 
 
 
258 aa  159  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0602  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.15 
 
 
256 aa  145  4.0000000000000006e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44908  predicted protein  37.35 
 
 
877 aa  138  7e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1639  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.46 
 
 
274 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1969  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
294 aa  126  3e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000507932  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.32 
 
 
274 aa  125  5e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00168385  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1800  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 
275 aa  123  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.454392 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1351  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.9 
 
 
282 aa  124  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.95 
 
 
274 aa  122  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.157395 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.31 
 
 
279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.96 
 
 
274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000578748  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0413  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.45 
 
 
274 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.642509  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1154  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  31.28 
 
 
253 aa  112  5e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000294561  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.05 
 
 
248 aa  112  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154391  normal  0.241568 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.42 
 
 
248 aa  112  7.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0361624 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0991  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  31.28 
 
 
253 aa  112  8.000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2901  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.76 
 
 
256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0383  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.34 
 
 
306 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.65 
 
 
279 aa  109  5e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.509477 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
253 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2185  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 
237 aa  105  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.756927  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39837  predicted protein  34.59 
 
 
309 aa  104  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.169011  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4780  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.35 
 
 
227 aa  103  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.18592  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.71 
 
 
269 aa  100  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 
244 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2473  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.43 
 
 
256 aa  99.4  5e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0616  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.02 
 
 
266 aa  99.4  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.09 
 
 
282 aa  98.2  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.115516  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.25 
 
 
246 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0902023 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01927  putative oxidoreductase  36.56 
 
 
252 aa  97.4  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.160278  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 
252 aa  97.1  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.96 
 
 
251 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.265476  normal  0.579067 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.61 
 
 
261 aa  96.7  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3389  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.96 
 
 
251 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.45 
 
 
246 aa  96.7  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.596846  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.96 
 
 
251 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.282866  normal  0.301564 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3969  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.5 
 
 
253 aa  96.3  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5671  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.62 
 
 
271 aa  95.9  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.55 
 
 
244 aa  95.9  5e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3904  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 
228 aa  95.5  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.164626 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3592  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
286 aa  95.9  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.894525 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.12 
 
 
254 aa  95.5  8e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 
246 aa  95.1  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.809389  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.63 
 
 
266 aa  95.1  9e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00111461  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.02 
 
 
280 aa  94.7  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.06 
 
 
246 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1575  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.06 
 
 
246 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
254 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2844  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.3 
 
 
246 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.874316 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3892  putative oxidoreductase  36.74 
 
 
244 aa  94  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.300054  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2238  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.23 
 
 
317 aa  94  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3335  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 
246 aa  93.2  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3989  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
260 aa  93.6  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.673066  normal  0.302564 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4446  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.93 
 
 
254 aa  92.8  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.287432  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.32 
 
 
257 aa  93.2  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.313012  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.92 
 
 
262 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0112  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.95 
 
 
244 aa  92.8  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2068  putative L-2,3-butanediol dehydrogenase  32.91 
 
 
261 aa  92.8  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000343042  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3801  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.42 
 
 
251 aa  92.4  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00700482  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.53 
 
 
246 aa  92.4  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0163129  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.7 
 
 
347 aa  92  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.27 
 
 
274 aa  92  7e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.448097 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4578  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
264 aa  92  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 
272 aa  92  9e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3992  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.19 
 
 
226 aa  92  9e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.280022  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2470  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.18 
 
 
244 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0097  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
262 aa  91.3  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.05 
 
 
250 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4845  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.49 
 
 
252 aa  91.3  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3722  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.87 
 
 
267 aa  91.7  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.848764  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1540  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.79 
 
 
267 aa  91.7  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.239754  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3907  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.99 
 
 
246 aa  91.3  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.267776 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1374  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.62 
 
 
253 aa  91.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.542817  normal  0.89387 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.05 
 
 
252 aa  90.5  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.950748  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.53 
 
 
252 aa  90.9  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.586754  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2262  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.54 
 
 
244 aa  90.5  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000989308  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.26 
 
 
247 aa  90.5  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0433  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.13 
 
 
244 aa  90.5  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00087459  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08163  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_5G02870)  34.76 
 
 
251 aa  90.5  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.132741 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 
289 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.312268  normal  0.0519409 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.22 
 
 
249 aa  90.1  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.875683  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 
262 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.87 
 
 
279 aa  90.5  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141613  normal  0.0207226 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.45 
 
 
263 aa  90.1  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3068  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.97 
 
 
253 aa  89.7  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2110  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 
246 aa  89.7  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0101774  normal  0.961149 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9335  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.51 
 
 
250 aa  89.7  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0716  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.96 
 
 
249 aa  89.7  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3588  hypothetical protein  32.83 
 
 
254 aa  89.7  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00208776  normal  0.410255 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.73 
 
 
269 aa  89.7  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.55 
 
 
245 aa  89.7  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.89 
 
 
244 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.977766  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2495  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.22 
 
 
254 aa  89.7  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.27 
 
 
242 aa  89.7  4e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2972  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.03 
 
 
245 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>