More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2352 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
186 aa  367  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.5 
 
 
279 aa  145  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0616  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.45 
 
 
266 aa  104  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.02 
 
 
332 aa  98.2  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.755346  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.25 
 
 
330 aa  97.8  7e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.415615 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0413  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.48 
 
 
274 aa  97.8  8e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.642509  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1969  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
294 aa  96.7  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000507932  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.62 
 
 
330 aa  95.5  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0961773  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3170  putative Short-chain dehydrogenase/reductase  39.51 
 
 
544 aa  94.7  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0745281 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.99 
 
 
332 aa  94  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.261589  normal  0.281891 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.26 
 
 
274 aa  93.2  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00168385  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1826  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.1 
 
 
239 aa  93.2  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2044  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.1 
 
 
242 aa  92.4  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252391  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1819  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.1 
 
 
242 aa  92.4  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3364  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.1 
 
 
239 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115947  hitchhiker  0.00000000000000894376 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1793  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.1 
 
 
242 aa  92.4  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.512815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1775  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.1 
 
 
242 aa  92.4  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2065  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.1 
 
 
239 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000861938  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1958  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.1 
 
 
242 aa  92.4  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1964  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.1 
 
 
239 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.130885  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1800  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 
275 aa  92.4  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.454392 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1995  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.1 
 
 
239 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.591310000000001e-44 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1639  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.78 
 
 
274 aa  91.3  6e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2262  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.59 
 
 
244 aa  91.3  8e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000989308  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3972  short chain dehydrogenase  36.2 
 
 
441 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.75 
 
 
274 aa  90.1  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.157395 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1494  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.71 
 
 
239 aa  90.1  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128809  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2986  short chain dehydrogenase  36.25 
 
 
441 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.889744  normal  0.40482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1337  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.45 
 
 
238 aa  89  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.541378  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2200  short chain dehydrogenase  32.56 
 
 
256 aa  89.4  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2186  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.87 
 
 
241 aa  88.6  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0890  short chain dehydrogenase  36.5 
 
 
254 aa  89  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.21 
 
 
339 aa  88.6  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.04 
 
 
299 aa  88.2  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297651  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1704  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.48 
 
 
327 aa  88.2  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0865  short chain dehydrogenase  36.5 
 
 
254 aa  88.2  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2427  short chain dehydrogenase  35.62 
 
 
442 aa  87.8  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.15313  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1518  short chain dehydrogenase  35.51 
 
 
254 aa  87.8  9e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0138518 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0274  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
258 aa  87.4  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2604  short chain dehydrogenase  35.62 
 
 
441 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.155527 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5078  short chain dehydrogenase  37.01 
 
 
337 aa  86.7  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1658  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.85 
 
 
247 aa  86.7  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4004  gluconate 5-dehydrogenase  44.29 
 
 
267 aa  86.3  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.4 
 
 
278 aa  86.7  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.561593  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.34 
 
 
355 aa  85.9  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.453841  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3471  short chain dehydrogenase  35.77 
 
 
254 aa  85.9  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4061  short chain dehydrogenase  33.54 
 
 
337 aa  85.9  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5079  short chain dehydrogenase  39.31 
 
 
260 aa  86.3  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.703587  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.93 
 
 
326 aa  85.5  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248139  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.48 
 
 
270 aa  85.5  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.2513  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2862  short chain dehydrogenase  32.73 
 
 
255 aa  85.1  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2896  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.97 
 
 
240 aa  85.1  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148916  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.89 
 
 
333 aa  85.1  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.86 
 
 
334 aa  84.7  7e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.496064  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.86 
 
 
334 aa  84.3  8e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.223195 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0726  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.92 
 
 
366 aa  84.3  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.642345  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5018  short chain dehydrogenase  32.96 
 
 
254 aa  84.3  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5842  short chain dehydrogenase  32.96 
 
 
254 aa  84.3  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.443713  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4337  short chain dehydrogenase  37.5 
 
 
254 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351229  normal  0.909494 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2723  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  35.03 
 
 
255 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.849254  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5273  short chain dehydrogenase  36.81 
 
 
254 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.21 
 
 
258 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.500717  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2567  gluconate 5-dehydrogenase  37.04 
 
 
267 aa  84  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0700463  normal  0.82906 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3219  short chain dehydrogenase  38.62 
 
 
254 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28746  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.24 
 
 
252 aa  84  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0494  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 
252 aa  83.6  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 
252 aa  83.2  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1409  gluconate 5-dehydrogenase  44.92 
 
 
260 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7039  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.53 
 
 
258 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.607221 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.76 
 
 
336 aa  82.8  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.753592 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4714  short chain dehydrogenase  32.57 
 
 
254 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0274692  decreased coverage  0.00406557 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2139  short chain dehydrogenase  32.95 
 
 
254 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1361  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.25 
 
 
334 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0134131 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5045  short chain dehydrogenase  35.37 
 
 
254 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3637  short chain dehydrogenase  32.57 
 
 
254 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2705  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  36.36 
 
 
260 aa  82.8  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0392543  normal  0.0560385 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.97 
 
 
261 aa  82.4  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32556  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.85 
 
 
344 aa  82.4  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.753226  normal  0.910238 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5719  short chain dehydrogenase  31.84 
 
 
254 aa  82  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3988  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.3 
 
 
404 aa  82  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.326194 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.55 
 
 
258 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.55 
 
 
258 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4611  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.41 
 
 
356 aa  82  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4069  short chain dehydrogenase  36.23 
 
 
239 aa  81.6  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0596677  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6867  short chain dehydrogenase  31.21 
 
 
333 aa  82  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.27 
 
 
257 aa  82  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.401645  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0764  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.48 
 
 
270 aa  82  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.4598  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4578  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.68 
 
 
264 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3037  short chain dehydrogenase  36.81 
 
 
254 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0519224  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5897  short chain dehydrogenase  31.21 
 
 
328 aa  81.6  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.23 
 
 
239 aa  81.3  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.175599  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4466  glucose-1-dehydrogenase  34.15 
 
 
261 aa  81.3  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1851  gluconate 5-dehydrogenase  43.22 
 
 
260 aa  81.3  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.198252 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.01 
 
 
246 aa  81.3  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2513  short chain dehydrogenase  39.86 
 
 
256 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1575  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.01 
 
 
246 aa  81.3  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0944  short chain dehydrogenase  39.86 
 
 
256 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0281  short chain dehydrogenase  39.86 
 
 
256 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.701558  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1625  short chain dehydrogenase  39.86 
 
 
256 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2718  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  34.78 
 
 
256 aa  81.3  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.650562  normal  0.158048 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>