207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNL05250 on replicon NC_006681
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006681  CNL05250  cytoplasm protein, putative  100 
 
 
363 aa  744    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05994  YjeF domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G10120)  40.05 
 
 
369 aa  234  2.0000000000000002e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.713376  normal  0.831278 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68225  conserved hypothetical protein  31.01 
 
 
360 aa  189  7e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19831  predicted protein  30.42 
 
 
310 aa  160  3e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18471  predicted protein  29.1 
 
 
362 aa  103  4e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.23754 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1880  YjeF-related protein  27.49 
 
 
481 aa  92  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.523049  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1091  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.84 
 
 
462 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.214114  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1640  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.95 
 
 
542 aa  80.9  0.00000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0283025 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0691  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.78 
 
 
287 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1702  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.58 
 
 
516 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.214184  normal  0.051973 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.94 
 
 
504 aa  77.8  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1934  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.64 
 
 
514 aa  75.1  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000050145 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0976  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.43 
 
 
390 aa  75.1  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.270642  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1126  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.24 
 
 
504 aa  73.9  0.000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000000000609405  decreased coverage  0.000000000191646 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1401  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.02 
 
 
507 aa  73.9  0.000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.324731  normal  0.9044 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0072  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.22 
 
 
501 aa  72  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.86 
 
 
483 aa  72  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0758  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.58 
 
 
498 aa  71.6  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0354907 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1364  carbohydrate kinase, YjeF related protein  23.42 
 
 
490 aa  68.9  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2235  hypothetical protein  25.99 
 
 
312 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1827  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.8 
 
 
480 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3545  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.71 
 
 
492 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1235  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.63 
 
 
482 aa  66.2  0.0000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00615219 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.18 
 
 
498 aa  65.9  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.18 
 
 
500 aa  65.5  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.82 
 
 
528 aa  63.9  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0530  hypothetical protein  26.67 
 
 
503 aa  63.5  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0814299  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0699  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.28 
 
 
504 aa  63.2  0.000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.239706  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1850  carbohydrate kinase, YjeF related protein  24.72 
 
 
518 aa  62.8  0.000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.114808  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1346  hypothetical protein  29.18 
 
 
458 aa  62.8  0.000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.212301  hitchhiker  0.000869519 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0404  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.19 
 
 
512 aa  62.8  0.000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0534144  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3898  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.66 
 
 
494 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000196302  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3772  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.66 
 
 
494 aa  62.8  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00405966  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1905  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.56 
 
 
511 aa  62.4  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0197843  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0427  carbohydrate kinase family protein  28.98 
 
 
512 aa  61.6  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00841365  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0463  sugar kinase  29.7 
 
 
286 aa  61.6  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.787563 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1527  sugar kinase  22.63 
 
 
273 aa  61.6  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000472  YjeF protein  27.47 
 
 
513 aa  62  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3715  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.66 
 
 
494 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  25.56 
 
 
499 aa  61.2  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1144  hypothetical protein  27.51 
 
 
485 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1161  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.51 
 
 
485 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.814108 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1171  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.51 
 
 
485 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.248327 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0671  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.67 
 
 
509 aa  60.8  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1520  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.06 
 
 
501 aa  60.5  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000211008 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0296  carbohydrate kinase, YjeF related protein  24.04 
 
 
520 aa  60.5  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.34818  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1860  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.51 
 
 
531 aa  60.1  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000355774 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7408  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.3 
 
 
501 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117304  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3437  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.04 
 
 
499 aa  60.1  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.446111  normal  0.221498 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0553  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.66 
 
 
494 aa  60.1  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000595011  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3285  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.42 
 
 
499 aa  60.1  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00260957  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1527  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.32 
 
 
531 aa  59.7  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.643488  normal  0.335611 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0518  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.24 
 
 
493 aa  59.7  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.076332  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0366  putative sugar kinase  26.54 
 
 
502 aa  59.7  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1720  hypothetical protein  25 
 
 
531 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.240927 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0320  YjeF family protein  31.76 
 
 
524 aa  58.9  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4175  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.59 
 
 
488 aa  59.3  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3063  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27 
 
 
508 aa  59.3  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.099293  normal  0.0195061 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0561  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  29.52 
 
 
492 aa  58.9  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0026662  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1793  carbohydrate kinase, YjeF related protein  22.95 
 
 
501 aa  58.9  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  28.48 
 
 
498 aa  58.2  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0704  hypothetical protein  27.27 
 
 
504 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000056197  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  27.27 
 
 
504 aa  58.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233957  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.17 
 
 
490 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4623  hypothetical protein  30.49 
 
 
514 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.41 
 
 
499 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0592  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.41 
 
 
499 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000415893 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4773  hypothetical protein  30.49 
 
 
514 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0676995 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4633  hypothetical protein  30.49 
 
 
514 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000149389  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3804  hypothetical protein  27.27 
 
 
504 aa  58.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026757  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4752  hypothetical protein  30.49 
 
 
514 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0825058  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4716  hypothetical protein  30.49 
 
 
514 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0539354  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13470  hypothetical protein  28.36 
 
 
473 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000625106 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.86 
 
 
533 aa  57.4  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1738  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.67 
 
 
490 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.203791  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  24.52 
 
 
510 aa  57.8  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  24.54 
 
 
492 aa  57.8  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0608  carbohydrate kinase, YjeF-like protein  25 
 
 
497 aa  57.8  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.723842 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1683  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.36 
 
 
467 aa  57.8  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_369  carbohydrate kinase  28.49 
 
 
512 aa  57.4  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136231  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2619  carbohydrate kinase, YjeF related protein  22.47 
 
 
536 aa  57.4  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0949888 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0263  sugar kinase  27.43 
 
 
275 aa  57.4  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1301  YjeF-related protein  30.22 
 
 
436 aa  57  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2331  carbohydrate kinase, YjeF related protein  24.55 
 
 
511 aa  56.6  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0350  carbohydrate kinase, YjeF related protein  23.47 
 
 
524 aa  56.6  0.0000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1419  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.13 
 
 
503 aa  56.2  0.0000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.228838  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1257  carbohydrate kinase, YjeF related protein  22.66 
 
 
504 aa  56.2  0.0000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.273999  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0792  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  26.69 
 
 
492 aa  56.2  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035803 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2378  hypothetical protein  25.86 
 
 
493 aa  56.2  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.946699  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0585  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.88 
 
 
294 aa  55.5  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1387  hypothetical protein  29.05 
 
 
526 aa  55.8  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176356  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1502  hypothetical protein  28.31 
 
 
509 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16359  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0661  hypothetical protein  24.72 
 
 
278 aa  55.8  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0426  hypothetical protein  27.05 
 
 
462 aa  55.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000379244  hitchhiker  0.000000929429 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2547  YjeF-related protein  26.99 
 
 
271 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1006  YjeF family protein  25.75 
 
 
501 aa  55.1  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1229  putative carbohydrate kinase  32.52 
 
 
488 aa  54.7  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1191  sugar kinase  28.89 
 
 
486 aa  54.7  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  24.64 
 
 
519 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0973  YjeF family protein  25.75 
 
 
501 aa  55.1  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.826646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>