More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0691 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0691  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 
287 aa  567  1e-161  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1934  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.48 
 
 
514 aa  185  7e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000050145 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1126  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.74 
 
 
504 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000000000609405  decreased coverage  0.000000000191646 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1401  carbohydrate kinase, YjeF related protein  41.24 
 
 
507 aa  182  7e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.324731  normal  0.9044 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1520  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.65 
 
 
501 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000211008 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0758  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.47 
 
 
498 aa  172  5.999999999999999e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0354907 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1091  carbohydrate kinase, YjeF related protein  42.01 
 
 
462 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.214114  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0072  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.85 
 
 
501 aa  157  2e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.45 
 
 
483 aa  155  6e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1640  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.32 
 
 
542 aa  153  4e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0283025 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1880  YjeF-related protein  37.17 
 
 
481 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.523049  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0738  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.98 
 
 
502 aa  136  3.0000000000000003e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000211989  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1346  hypothetical protein  37.22 
 
 
458 aa  133  3e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.212301  hitchhiker  0.000869519 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2927  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35 
 
 
516 aa  132  7.999999999999999e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.449906  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0366  putative sugar kinase  41.04 
 
 
502 aa  128  9.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.98 
 
 
515 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1235  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.45 
 
 
482 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00615219 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0699  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.8 
 
 
504 aa  124  2e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.239706  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1827  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.7 
 
 
480 aa  123  4e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1257  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.03 
 
 
504 aa  122  8e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.273999  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.69 
 
 
498 aa  122  9e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1793  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.33 
 
 
501 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.69 
 
 
500 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1683  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.54 
 
 
467 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0951  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.62 
 
 
479 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1453  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.46 
 
 
501 aa  116  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.105421  normal  0.158331 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1419  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.62 
 
 
503 aa  115  6e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.228838  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2405  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.78 
 
 
478 aa  115  6e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.104844  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.34 
 
 
519 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2277  hypothetical protein  34.09 
 
 
479 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1267  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.84 
 
 
505 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  30.24 
 
 
517 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.88 
 
 
533 aa  112  9e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0426  hypothetical protein  31.72 
 
 
462 aa  112  9e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000379244  hitchhiker  0.000000929429 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2531  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.72 
 
 
450 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.83 
 
 
528 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2235  hypothetical protein  28.92 
 
 
312 aa  110  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0296  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.72 
 
 
520 aa  108  2e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.34818  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.24 
 
 
509 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1583  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.34 
 
 
512 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0797204 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.18 
 
 
492 aa  105  6e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1065  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.37 
 
 
487 aa  105  8e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  31.21 
 
 
514 aa  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_369  carbohydrate kinase  28.67 
 
 
512 aa  104  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136231  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0427  carbohydrate kinase family protein  29.21 
 
 
512 aa  103  3e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00841365  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3924  hypothetical protein  30.9 
 
 
510 aa  103  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00146397  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0976  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.77 
 
 
390 aa  103  5e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.270642  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  32.54 
 
 
530 aa  102  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.82 
 
 
530 aa  102  6e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1617  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.09 
 
 
514 aa  102  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.865669  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1364  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.6 
 
 
490 aa  102  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1702  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.67 
 
 
516 aa  100  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.214184  normal  0.051973 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.64 
 
 
502 aa  99  7e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0518  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.73 
 
 
493 aa  99  8e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.076332  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3063  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.33 
 
 
508 aa  99  9e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.099293  normal  0.0195061 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0263  sugar kinase  29.27 
 
 
275 aa  98.2  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0561  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  29.35 
 
 
492 aa  98.6  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0026662  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.98 
 
 
504 aa  97.8  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.25 
 
 
524 aa  97.8  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.57 
 
 
510 aa  97.8  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0471  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.56 
 
 
532 aa  98.2  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0304  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.93 
 
 
533 aa  97.8  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.734599  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0986  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.01 
 
 
487 aa  97.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00577615 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1850  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.15 
 
 
518 aa  97.8  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.114808  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2450  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.2 
 
 
477 aa  97.1  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3545  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.79 
 
 
492 aa  96.7  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  29.82 
 
 
504 aa  96.7  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233957  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2333  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.77 
 
 
506 aa  96.3  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  27.18 
 
 
510 aa  95.9  6e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0086  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.39 
 
 
523 aa  95.9  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0723  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.93 
 
 
511 aa  95.9  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.191783  normal  0.257286 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3285  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.15 
 
 
499 aa  95.5  9e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00260957  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1802  YjeF family protein  32.85 
 
 
519 aa  94.7  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0891524  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3804  hypothetical protein  29.82 
 
 
504 aa  95.1  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026757  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4899  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.1 
 
 
286 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2547  YjeF-related protein  28.47 
 
 
271 aa  94.7  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5185  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.23 
 
 
497 aa  94  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0182  hypothetical protein  28.99 
 
 
293 aa  94.4  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0704  hypothetical protein  29.47 
 
 
504 aa  94.4  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000056197  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.83 
 
 
515 aa  94  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.1 
 
 
307 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.686463  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4408  hypothetical protein  27.5 
 
 
515 aa  94  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000123487  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4724  hypothetical protein  26.83 
 
 
515 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000041383  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  26.83 
 
 
510 aa  94  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5683  hypothetical protein  26.83 
 
 
510 aa  94  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000899207  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2867  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.41 
 
 
517 aa  94  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1586  carbohydrate kinase  32.69 
 
 
508 aa  93.6  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0792  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  32.97 
 
 
492 aa  93.2  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035803 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0648  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.96 
 
 
518 aa  93.2  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.97 
 
 
499 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1140  YjeF-like protein  33.07 
 
 
533 aa  92.8  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023582  normal  0.362209 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04034  predicted carbohydrate kinase  26.83 
 
 
515 aa  92.4  7e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00166005  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2331  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.79 
 
 
511 aa  92.4  7e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03996  hypothetical protein  26.83 
 
 
515 aa  92.4  7e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000718963  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3022  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.21 
 
 
520 aa  92.4  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4181  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.97 
 
 
567 aa  92.4  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5089  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.27 
 
 
493 aa  92.4  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000420091  normal  0.19658 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0345  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.03 
 
 
495 aa  92.4  8e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.256389  normal  0.0299797 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  30.32 
 
 
499 aa  92  9e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2084  hypothetical protein  28.93 
 
 
496 aa  91.3  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>