215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_68225 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009046  PICST_68225  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 360 aa  735    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05994  YjeF domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G10120)  39.3 
 
 		 369 aa  238  1e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.713376  normal  0.831278 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05250  cytoplasm protein, putative  31.01 
 
 		 363 aa  189  5.999999999999999e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19831  predicted protein  33.24 
 
 		 310 aa  165  1.0000000000000001e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18471  predicted protein  28.05 
 
 		 362 aa  107  4e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.23754 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1640  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.68 
 
 		 542 aa  91.3  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0283025 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1091  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.23 
 
 		 462 aa  89  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.214114  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0758  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.78 
 
 		 498 aa  83.6  0.000000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0354907 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0072  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.62 
 
 		 501 aa  81.6  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.87 
 
 		 492 aa  79.3  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1850  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.55 
 
 		 518 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.114808  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1126  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.08 
 
 		 504 aa  74.7  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.000000000609405  decreased coverage  0.000000000191646 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5089  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.84 
 
 		 493 aa  75.1  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000420091  normal  0.19658 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.92 
 
 		 483 aa  73.9  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3726  hypothetical protein  26.49 
 
 		 514 aa  74.3  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.10556  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  25.09 
 
 		 510 aa  73.6  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04034  predicted carbohydrate kinase  25.09 
 
 		 515 aa  72.8  0.000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00166005  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03996  hypothetical protein  25.09 
 
 		 515 aa  72.8  0.000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000718963  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1011  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.52 
 
 		 504 aa  72.4  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.311341  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1934  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.92 
 
 		 514 aa  72  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000050145 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.09 
 
 		 515 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0320  YjeF family protein  26.47 
 
 		 524 aa  71.2  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5683  hypothetical protein  25.09 
 
 		 510 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000899207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4752  hypothetical protein  23.79 
 
 		 514 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0825058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4773  hypothetical protein  23.79 
 
 		 514 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0676995 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  25.09 
 
 		 510 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4724  hypothetical protein  25.09 
 
 		 515 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000041383  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4633  hypothetical protein  23.79 
 
 		 514 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000149389  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4623  hypothetical protein  23.79 
 
 		 514 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4408  hypothetical protein  25.09 
 
 		 515 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000123487  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3924  hypothetical protein  25.37 
 
 		 510 aa  71.2  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00146397  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4716  hypothetical protein  23.79 
 
 		 514 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0539354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1880  YjeF-related protein  28.24 
 
 		 481 aa  70.9  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.523049  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1702  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.06 
 
 		 516 aa  70.1  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.214184  normal  0.051973 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0350  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.56 
 
 		 524 aa  70.1  0.00000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1204  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.27 
 
 		 523 aa  70.1  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.128075  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0350  hypothetical protein  24.4 
 
 		 508 aa  69.7  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00103587  hitchhiker  0.0000473112 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1292  carbohydrate kinase, YjeF related protein  23.67 
 
 		 286 aa  70.1  0.00000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.841389  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0426  hypothetical protein  26.47 
 
 		 462 aa  69.7  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000379244  hitchhiker  0.000000929429 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0530  hypothetical protein  24.63 
 
 		 503 aa  69.7  0.00000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0814299  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  24.16 
 
 		 504 aa  69.3  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233957  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0704  hypothetical protein  24.16 
 
 		 504 aa  68.9  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000056197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0510  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.45 
 
 		 314 aa  69.3  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0209732  normal  0.140618 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3804  hypothetical protein  24.16 
 
 		 504 aa  68.9  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026757  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4698  hypothetical protein  24.73 
 
 		 515 aa  68.2  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000112402  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1363  carbohydrate kinase, YjeF related protein  24.39 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3030  YjeF protein  28.74 
 
 		 496 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1235  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.94 
 
 		 482 aa  66.2  0.0000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00615219 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1453  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.33 
 
 		 501 aa  66.2  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.105421  normal  0.158331 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0495  hypothetical protein  25.82 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.44 
 
 		 519 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1401  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.52 
 
 		 507 aa  65.1  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.324731  normal  0.9044 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0007  hypothetical protein  22.88 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0007  hypothetical protein  22.88 
 
 		 270 aa  65.1  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.365981  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1346  hypothetical protein  27.69 
 
 		 458 aa  64.3  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.212301  hitchhiker  0.000869519 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0561  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  26.06 
 
 		 492 aa  64.3  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0026662  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0738  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.64 
 
 		 502 aa  63.5  0.000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000211989  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1387  hypothetical protein  26.47 
 
 		 526 aa  63.2  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176356  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0976  carbohydrate kinase, YjeF related protein  24.63 
 
 		 390 aa  63.2  0.000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.270642  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1257  carbohydrate kinase, YjeF related protein  24.03 
 
 		 504 aa  63.2  0.000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.273999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4175  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.09 
 
 		 488 aa  62.8  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0518  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.13 
 
 		 493 aa  62.8  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.076332  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0608  carbohydrate kinase, YjeF-like protein  28.32 
 
 		 497 aa  62.4  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.723842 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1647  carbohydrate kinase, YjeF related protein  24.03 
 
 		 524 aa  62.4  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0299074  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2450  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.85 
 
 		 477 aa  62.4  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0296  carbohydrate kinase, YjeF related protein  24.33 
 
 		 520 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.34818  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  24.14 
 
 		 515 aa  61.6  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1084  hypothetical protein  25.61 
 
 		 494 aa  61.2  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.387482  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2547  YjeF-related protein  22.51 
 
 		 271 aa  61.2  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0263  sugar kinase  24.45 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1827  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.54 
 
 		 480 aa  60.8  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0366  putative sugar kinase  26.54 
 
 		 502 aa  60.5  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  22.9 
 
 		 510 aa  60.1  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0283  carbohydrate kinase family protein  28.93 
 
 		 499 aa  60.5  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2757  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.49 
 
 		 494 aa  60.5  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1267  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.36 
 
 		 505 aa  60.5  0.00000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  25.35 
 
 		 512 aa  60.1  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2927  carbohydrate kinase, YjeF related protein  22.34 
 
 		 516 aa  60.1  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.449906  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.1 
 
 		 490 aa  59.7  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1905  carbohydrate kinase, YjeF related protein  23.88 
 
 		 511 aa  59.7  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0197843  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2405  carbohydrate kinase, YjeF related protein  27.1 
 
 		 478 aa  58.9  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.104844  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0487  hypothetical protein  28.97 
 
 		 513 aa  59.3  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000620084  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0699  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.27 
 
 		 504 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.239706  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.16 
 
 		 498 aa  58.9  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1272  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.31 
 
 		 530 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0216258 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  28.93 
 
 		 499 aa  58.2  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1264  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.45 
 
 		 527 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.15 
 
 		 521 aa  58.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3772  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.52 
 
 		 494 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00405966  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3898  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.14 
 
 		 494 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000196302  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0877  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.54 
 
 		 471 aa  57.8  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3715  carbohydrate kinase, YjeF related protein  26.52 
 
 		 494 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6197  carbohydrate kinase, YjeF related protein  22.9 
 
 		 514 aa  57.4  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.327318 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0626  hypothetical protein  22.38 
 
 		 482 aa  57  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0494651  normal  0.803312 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0661  hypothetical protein  22.43 
 
 		 278 aa  57  0.0000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0553  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.76 
 
 		 494 aa  57  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000595011  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0427  carbohydrate kinase family protein  22.63 
 
 		 512 aa  57  0.0000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00841365  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1860  carbohydrate kinase, YjeF related protein  22.14 
 
 		 531 aa  56.6  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355774 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11168  putative YjeF-related sugar kinase  23.69 
 
 		 511 aa  56.6  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.291128  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2608  hypothetical protein  30.97 
 
 		 490 aa  56.2  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.518872  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>