91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_0760 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010117  COXBURSA331_A1205  cell envelope biogenesis protein YhbN  100 
 
 
171 aa  350  5e-96  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0760  hypothetical protein  100 
 
 
171 aa  350  5e-96  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.879513  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12810  LPS transport protein LptA  36.22 
 
 
184 aa  81.3  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2791  OstA-like protein  30.97 
 
 
275 aa  77  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.127705  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0872  OstA family protein  30.81 
 
 
181 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0206259  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57920  hypothetical protein  32.81 
 
 
175 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2107  hypothetical protein  29.66 
 
 
179 aa  72.4  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5033  hypothetical protein  33.59 
 
 
175 aa  70.9  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0234887  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0974  OstA-like protein  28.66 
 
 
180 aa  69.3  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0899  hypothetical protein  33.75 
 
 
169 aa  66.2  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0868  hypothetical protein  33.75 
 
 
169 aa  66.2  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3579  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  30.49 
 
 
184 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2890  OstA family protein  30.32 
 
 
173 aa  62.8  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.745795  normal  0.143441 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3615  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  30.49 
 
 
184 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.190854 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3510  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  30.49 
 
 
184 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3508  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  30.49 
 
 
184 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3677  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  30.49 
 
 
184 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.148558 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002405  LptA protein  27.21 
 
 
164 aa  62.8  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.122787  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2416  cell envelope biogenesis YhbN  25.77 
 
 
175 aa  62  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.972183  normal  0.0334942 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4145  OstA-like protein  28 
 
 
182 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0507  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  31.17 
 
 
185 aa  62  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0500  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  31.17 
 
 
185 aa  62  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.850542  normal  0.391623 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3496  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  31.17 
 
 
185 aa  62  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3688  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  31.17 
 
 
185 aa  62  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3393  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  31.17 
 
 
185 aa  62  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3570  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  31.17 
 
 
185 aa  62  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4451  ostA family protein  28 
 
 
182 aa  62  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.953915  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4522  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  31.17 
 
 
185 aa  62  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.599849  normal  0.710923 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0728  OstA-like protein  27.56 
 
 
180 aa  62  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3177  alpha amylase domain-containing protein  30.89 
 
 
179 aa  61.2  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0500  hypothetical protein  29.68 
 
 
166 aa  61.2  0.000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.108043  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2713  OstA family protein  28.57 
 
 
188 aa  60.8  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0276  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  28.29 
 
 
190 aa  60.1  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0311412  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03016  hypothetical protein  30.52 
 
 
185 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000479332  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0743  hypothetical protein  28.19 
 
 
177 aa  58.9  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0171086  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3636  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  30.28 
 
 
157 aa  58.9  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.34297  normal  0.130415 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03065  predicted transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  30.52 
 
 
185 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000332715  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3655  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  28.29 
 
 
202 aa  58.2  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03662  hypothetical protein  26.28 
 
 
164 aa  57.8  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0283  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  27.63 
 
 
190 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.24235  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1489  OstA-like protein  30.26 
 
 
189 aa  56.2  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0428752  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0925  OstA-like protein  30.26 
 
 
189 aa  56.2  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03191  OstA-like protein  30.12 
 
 
184 aa  55.8  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0825  cell envelope biogenesis YhbN  31.82 
 
 
157 aa  55.1  0.0000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3813  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  26.97 
 
 
189 aa  54.3  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.277414  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0140  OstA-like protein  27.98 
 
 
176 aa  53.9  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4365  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  27.56 
 
 
179 aa  53.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.201613  normal  0.154984 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2228  OstA family protein  30.48 
 
 
175 aa  52.4  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2635  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  28.32 
 
 
182 aa  52.4  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.317916  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1175  hypothetical protein  27.27 
 
 
172 aa  52.4  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0753  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  26.25 
 
 
194 aa  52.4  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.703312  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3027  hypothetical protein  28.32 
 
 
182 aa  52.4  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4238  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  33.61 
 
 
196 aa  52  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000789736 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0859  OstA-like protein  27.89 
 
 
181 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.492596  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0086  OstA-like protein  23.95 
 
 
190 aa  50.1  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.100502  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3309  OstA family protein  28.3 
 
 
181 aa  50.4  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000684229  normal  0.786006 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0491  OstA-like protein  29.81 
 
 
184 aa  48.5  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.148147  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0674  OstA family protein  27.22 
 
 
183 aa  48.1  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.20726  normal  0.0960529 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2124  OstA family protein  26.27 
 
 
175 aa  47  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4487  OstA-like protein  27.61 
 
 
205 aa  46.2  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.149914 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3347  OstA family protein  26.58 
 
 
183 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00730418  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0877  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  23.68 
 
 
180 aa  46.2  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000011507  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3375  OstA family protein  27.04 
 
 
193 aa  45.8  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.25365  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0535  OstA-like family protein  23.08 
 
 
177 aa  45.1  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.872333  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4261  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  27.15 
 
 
174 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0728  OstA family protein  31.36 
 
 
217 aa  45.1  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.201644 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3614  cell envelope biogenesis YhbN  29.41 
 
 
179 aa  44.7  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0599225  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0709  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  24.68 
 
 
184 aa  44.3  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686411  normal  0.0194673 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3708  OstA family protein  28.17 
 
 
214 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.14713 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0675  OstA family protein  25.95 
 
 
183 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.155422  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3421  OstA-like protein  23.88 
 
 
200 aa  43.9  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.44027e-25  normal  0.738624 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0688  cell envelope biogenesis YhbN  25.32 
 
 
184 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00274419  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1151  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  25.53 
 
 
181 aa  43.5  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3666  OstA family protein  25.32 
 
 
184 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000733032  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0443  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  25.53 
 
 
181 aa  43.5  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0718  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  25.32 
 
 
184 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.460129 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3086  OstA-like protein  25.62 
 
 
184 aa  43.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431766  normal  0.101166 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0507  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  25.53 
 
 
181 aa  43.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.970543  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0993  cell envelope biogenesis YhbN  25.68 
 
 
174 aa  41.6  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0961  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  25.68 
 
 
174 aa  41.6  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0954  hypothetical protein  25.68 
 
 
174 aa  41.6  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0157  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  25 
 
 
207 aa  41.6  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.503776 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0526  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  38.98 
 
 
221 aa  41.2  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2816  OstA family protein  23.39 
 
 
163 aa  40.8  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.402903  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6119  OstA-like protein  38.98 
 
 
221 aa  40.8  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.578391  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1155  OstA-like protein  23.39 
 
 
163 aa  40.8  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2707  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  38.98 
 
 
221 aa  40.8  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0137528 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2789  OstA family protein  38.98 
 
 
221 aa  40.8  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.156758  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2849  OstA family protein  38.98 
 
 
221 aa  40.8  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.258721  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2800  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  38.98 
 
 
221 aa  40.8  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.29652 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2175  OstA-like protein  38.98 
 
 
221 aa  40.8  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>