130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0974 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_0974  OstA-like protein  100 
 
 
180 aa  368  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0753  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  31.08 
 
 
194 aa  89.7  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.703312  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0925  OstA-like protein  31.98 
 
 
189 aa  83.6  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1489  OstA-like protein  31.98 
 
 
189 aa  81.6  0.000000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0428752  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0825  cell envelope biogenesis YhbN  32.91 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2791  OstA-like protein  31.07 
 
 
275 aa  77  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.127705  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0728  OstA-like protein  30.17 
 
 
180 aa  75.5  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12810  LPS transport protein LptA  33.78 
 
 
184 aa  73.9  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2635  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  34.07 
 
 
182 aa  72.8  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.317916  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3027  hypothetical protein  34.07 
 
 
182 aa  72.8  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4261  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  35.46 
 
 
174 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3177  alpha amylase domain-containing protein  29.53 
 
 
179 aa  71.6  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0140  OstA-like protein  29.07 
 
 
176 aa  68.9  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2713  OstA family protein  27.4 
 
 
188 aa  68.6  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0872  OstA family protein  32.76 
 
 
181 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0206259  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0859  OstA-like protein  30.46 
 
 
181 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.492596  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0760  hypothetical protein  30.28 
 
 
171 aa  66.6  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.879513  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1205  cell envelope biogenesis protein YhbN  30.28 
 
 
171 aa  66.6  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0954  hypothetical protein  34.04 
 
 
174 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02229  hypothetical protein  27.46 
 
 
179 aa  66.2  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.70202  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0993  cell envelope biogenesis YhbN  34.04 
 
 
174 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0961  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  34.04 
 
 
174 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2228  OstA family protein  32.37 
 
 
175 aa  64.7  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0507  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  28.92 
 
 
185 aa  64.3  0.0000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4522  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  28.92 
 
 
185 aa  64.3  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.599849  normal  0.710923 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3393  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  28.92 
 
 
185 aa  64.3  0.0000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3688  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  28.92 
 
 
185 aa  64.3  0.0000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0500  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  28.92 
 
 
185 aa  64.3  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.850542  normal  0.391623 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3496  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  28.92 
 
 
185 aa  64.3  0.0000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3570  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  28.92 
 
 
185 aa  64.3  0.0000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57920  hypothetical protein  30.77 
 
 
175 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0276  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  27.32 
 
 
190 aa  63.5  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0311412  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5033  hypothetical protein  28.4 
 
 
175 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0234887  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3655  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  27.65 
 
 
202 aa  63.2  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3636  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  32.37 
 
 
157 aa  62.8  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.34297  normal  0.130415 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0206  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  25.6 
 
 
179 aa  62  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03065  predicted transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  28.31 
 
 
185 aa  61.6  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000332715  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03016  hypothetical protein  28.31 
 
 
185 aa  61.6  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000479332  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0500  hypothetical protein  27.27 
 
 
166 aa  61.2  0.000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.108043  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0491  OstA-like protein  32.5 
 
 
184 aa  60.8  0.000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.148147  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4238  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  28.67 
 
 
196 aa  60.8  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000789736 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3677  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  28.31 
 
 
184 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.148558 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3508  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  28.31 
 
 
184 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3086  OstA-like protein  27.17 
 
 
184 aa  60.1  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431766  normal  0.101166 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3510  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  28.31 
 
 
184 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3579  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  28.31 
 
 
184 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03191  OstA-like protein  26.82 
 
 
184 aa  60.5  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3615  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  28.31 
 
 
184 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.190854 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0709  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  30.99 
 
 
184 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686411  normal  0.0194673 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3666  OstA family protein  30.99 
 
 
184 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000733032  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0688  cell envelope biogenesis YhbN  30.99 
 
 
184 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00274419  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03662  hypothetical protein  28.26 
 
 
164 aa  59.7  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0718  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  30.99 
 
 
184 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.460129 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0675  OstA family protein  28.09 
 
 
183 aa  59.3  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.155422  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3813  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  25.27 
 
 
189 aa  58.9  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.277414  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0283  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  26.32 
 
 
190 aa  59.3  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.24235  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2416  cell envelope biogenesis YhbN  26.58 
 
 
175 aa  59.3  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.972183  normal  0.0334942 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3347  OstA family protein  29.68 
 
 
183 aa  58.5  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00730418  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0535  OstA-like family protein  26.28 
 
 
177 aa  58.2  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.872333  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0368  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  25.35 
 
 
174 aa  58.2  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.166234 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3375  OstA family protein  31.89 
 
 
193 aa  57.8  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.25365  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4541  OstA family protein  31.88 
 
 
201 aa  57.4  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0674  OstA family protein  29.03 
 
 
183 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.20726  normal  0.0960529 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2168  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  27.22 
 
 
182 aa  56.6  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0758  hypothetical protein  25.49 
 
 
176 aa  56.2  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0672  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  25.49 
 
 
176 aa  56.2  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4487  OstA-like protein  25.7 
 
 
205 aa  55.8  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.149914 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0717  OstA family protein  28.65 
 
 
184 aa  56.2  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.184609  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4451  ostA family protein  31.47 
 
 
182 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.953915  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3614  cell envelope biogenesis YhbN  28.89 
 
 
179 aa  55.5  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0599225  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002405  LptA protein  27.94 
 
 
164 aa  55.1  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.122787  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0743  hypothetical protein  28.15 
 
 
177 aa  54.3  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0171086  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4145  OstA-like protein  30.77 
 
 
182 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3309  OstA family protein  29.73 
 
 
181 aa  54.3  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000684229  normal  0.786006 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0752  OstA family protein  28.99 
 
 
153 aa  53.1  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.52807  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0086  OstA-like protein  23.26 
 
 
190 aa  53.5  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.100502  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2224  OstA-like protein  27.89 
 
 
174 aa  53.1  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1175  hypothetical protein  27.17 
 
 
172 aa  53.5  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0677  OstA family protein  28.99 
 
 
153 aa  53.1  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.25138  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0776  OstA-like protein  25.41 
 
 
213 aa  52.8  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.896639  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2890  OstA family protein  32.06 
 
 
173 aa  52.4  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.745795  normal  0.143441 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1350  OstA family protein  28.68 
 
 
153 aa  51.6  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0566  OstA-like protein  28.15 
 
 
173 aa  51.2  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.256416  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0956  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  24.69 
 
 
183 aa  51.2  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.226208 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4365  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  27.59 
 
 
179 aa  51.2  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.201613  normal  0.154984 
 
 
-
 
NC_004310  BR0156  hypothetical protein  23.39 
 
 
204 aa  50.8  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0464  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  25.19 
 
 
239 aa  50.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.150432  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6119  OstA-like protein  31.85 
 
 
221 aa  50.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.578391  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0151  hypothetical protein  23.39 
 
 
216 aa  50.8  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0300186  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0168  OstA family protein  22.28 
 
 
216 aa  50.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2849  OstA family protein  28.12 
 
 
221 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.258721  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2707  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  28.12 
 
 
221 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0137528 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2175  OstA-like protein  31.11 
 
 
221 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2789  OstA family protein  31.11 
 
 
221 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.156758  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2800  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  31.11 
 
 
221 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.29652 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1992  cell envelope biogenesis protein YhbN  29.2 
 
 
158 aa  48.9  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0488  OstA-like protein  28.89 
 
 
221 aa  48.5  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.298829  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0877  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  27.12 
 
 
180 aa  48.5  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000011507  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0443  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  27.94 
 
 
181 aa  48.5  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1151  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  27.94 
 
 
181 aa  48.5  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>