79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0899 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0899  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  351  2.9999999999999997e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0868  hypothetical protein  99.41 
 
 
169 aa  350  4e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57920  hypothetical protein  33.33 
 
 
175 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5033  hypothetical protein  31.95 
 
 
175 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0234887  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2224  OstA-like protein  27.82 
 
 
174 aa  72.4  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12810  LPS transport protein LptA  32.68 
 
 
184 aa  73.2  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0872  OstA family protein  29.94 
 
 
181 aa  68.2  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0206259  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3086  OstA-like protein  31.68 
 
 
184 aa  67.8  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431766  normal  0.101166 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4145  OstA-like protein  30.32 
 
 
182 aa  67.4  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4451  ostA family protein  30.32 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.953915  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4238  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  30 
 
 
196 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000789736 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2890  OstA family protein  30.95 
 
 
173 aa  64.7  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.745795  normal  0.143441 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0728  OstA family protein  29.38 
 
 
217 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.201644 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3309  OstA family protein  28.66 
 
 
181 aa  62.8  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000684229  normal  0.786006 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0760  hypothetical protein  33.56 
 
 
171 aa  61.2  0.000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.879513  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1205  cell envelope biogenesis protein YhbN  33.56 
 
 
171 aa  61.2  0.000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2107  hypothetical protein  24.54 
 
 
179 aa  59.3  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3177  alpha amylase domain-containing protein  31.25 
 
 
179 aa  59.7  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0491  OstA-like protein  27.06 
 
 
184 aa  58.9  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.148147  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3813  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  27.63 
 
 
189 aa  58.9  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.277414  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1175  hypothetical protein  25.15 
 
 
172 aa  57.4  0.00000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3655  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  25.97 
 
 
202 aa  57  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3579  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  24.24 
 
 
184 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3615  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  24.24 
 
 
184 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.190854 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3510  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  24.24 
 
 
184 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3508  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  24.24 
 
 
184 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3677  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  24.24 
 
 
184 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.148558 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3496  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  24.85 
 
 
185 aa  55.1  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0500  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  24.85 
 
 
185 aa  55.1  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.850542  normal  0.391623 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0507  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  24.85 
 
 
185 aa  55.1  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3570  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  24.85 
 
 
185 aa  55.1  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3688  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  24.85 
 
 
185 aa  55.1  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3393  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  24.85 
 
 
185 aa  55.1  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4522  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  24.85 
 
 
185 aa  55.1  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.599849  normal  0.710923 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0728  OstA-like protein  26.92 
 
 
180 aa  54.3  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2791  OstA-like protein  27.15 
 
 
275 aa  54.3  0.0000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.127705  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4261  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  25 
 
 
174 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3614  cell envelope biogenesis YhbN  29.45 
 
 
179 aa  53.9  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0599225  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0276  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  24.85 
 
 
190 aa  53.9  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0311412  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2713  OstA family protein  26.67 
 
 
188 aa  53.9  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3027  hypothetical protein  32.26 
 
 
182 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0717  OstA family protein  27.01 
 
 
184 aa  53.1  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.184609  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2635  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  32.26 
 
 
182 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.317916  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0283  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  24.24 
 
 
190 aa  52.8  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.24235  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0859  OstA-like protein  25.57 
 
 
181 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.492596  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0961  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  24.67 
 
 
174 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0954  hypothetical protein  24.67 
 
 
174 aa  52  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0993  cell envelope biogenesis YhbN  24.67 
 
 
174 aa  52  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0709  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  27.01 
 
 
184 aa  52  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686411  normal  0.0194673 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03065  predicted transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  24.24 
 
 
185 aa  51.6  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000332715  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03016  hypothetical protein  24.24 
 
 
185 aa  51.6  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000479332  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0500  hypothetical protein  21.56 
 
 
166 aa  51.2  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.108043  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3636  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  24.82 
 
 
157 aa  51.2  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.34297  normal  0.130415 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4365  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  24.38 
 
 
179 aa  50.8  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.201613  normal  0.154984 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0086  OstA-like protein  25.14 
 
 
190 aa  50.8  0.000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.100502  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0718  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  27.01 
 
 
184 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.460129 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3666  OstA family protein  27.01 
 
 
184 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000733032  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0674  OstA family protein  28.4 
 
 
183 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.20726  normal  0.0960529 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0688  cell envelope biogenesis YhbN  27.01 
 
 
184 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00274419  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0825  cell envelope biogenesis YhbN  23.68 
 
 
157 aa  48.9  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3347  OstA family protein  27.81 
 
 
183 aa  48.5  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00730418  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1151  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  23.02 
 
 
181 aa  48.1  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03662  hypothetical protein  21.99 
 
 
164 aa  48.1  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03191  OstA-like protein  25.16 
 
 
184 aa  48.1  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0443  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  23.02 
 
 
181 aa  48.1  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0507  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  23.02 
 
 
181 aa  48.1  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.970543  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0743  hypothetical protein  25 
 
 
177 aa  47.8  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0171086  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0974  OstA-like protein  26.99 
 
 
180 aa  47  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0675  OstA family protein  27.22 
 
 
183 aa  47  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.155422  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002405  LptA protein  23.02 
 
 
164 aa  46.2  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.122787  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0925  OstA-like protein  20.99 
 
 
189 aa  46.6  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3375  OstA family protein  27.98 
 
 
193 aa  46.2  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.25365  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4541  OstA family protein  29.66 
 
 
201 aa  45.8  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3586  OstA family protein  24.58 
 
 
170 aa  45.4  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0535  OstA-like family protein  27.73 
 
 
177 aa  45.1  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.872333  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1489  OstA-like protein  21.43 
 
 
189 aa  45.1  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0428752  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0140  OstA-like protein  23.12 
 
 
176 aa  43.9  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2124  OstA family protein  23.74 
 
 
175 aa  43.9  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2416  cell envelope biogenesis YhbN  22.29 
 
 
175 aa  43.9  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.972183  normal  0.0334942 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>