82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2816 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1155  OstA-like protein  100 
 
 		 163 aa  323  6e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2816  OstA family protein  100 
 
 		 163 aa  323  6e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.402903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2772  OstA family protein  85.28 
 
 		 168 aa  232  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3586  OstA family protein  52.08 
 
 		 170 aa  139  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0025  OstA-like protein  48.59 
 
 		 144 aa  125  3e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00942039  normal  0.387287 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2606  OstA family protein  52.35 
 
 		 161 aa  121  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0226  OstA-like protein  41.56 
 
 		 160 aa  117  9e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0194  cell envelope biogenesis YhbN  36.42 
 
 		 197 aa  90.5  9e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.106383  normal  0.827244 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0049  OstA family protein  35.29 
 
 		 221 aa  89  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162045  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0066  OstA family protein  36.36 
 
 		 230 aa  88.2  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.297106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0176  OstA-like protein  32.98 
 
 		 221 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.435721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0657  OstA-like protein  33.33 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.292624 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0123  hypothetical protein  33.11 
 
 		 225 aa  83.6  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0308315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3249  OstA-like protein  38.6 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0417  OstA-like protein  31.36 
 
 		 225 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0177  OstA-like protein  30.77 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0249318  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2341  OstA-like protein  31.25 
 
 		 191 aa  75.5  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.239355 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2905  OstA family protein  34.31 
 
 		 173 aa  74.3  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0173  OstA-like protein  30.52 
 
 		 227 aa  73.9  0.0000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.65593 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2499  OstA family protein  29.49 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0667889  normal  0.241313 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0017  OstA family protein  29.79 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148492 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2722  OstA family protein  28.75 
 
 		 246 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.475694  normal  0.0622049 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5469  OstA family protein  30.36 
 
 		 223 aa  71.2  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.12141  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0062  OstA family protein  27.08 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2427  OstA family protein  28.3 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0150816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3669  OstA-like protein  29.45 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1281  OstA-like protein  32.54 
 
 		 169 aa  68.2  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000052201 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0046  OstA family protein  26.51 
 
 		 211 aa  67.8  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5924  OstA family protein  28.74 
 
 		 239 aa  67.4  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.657817  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1889  hypothetical protein  29.37 
 
 		 167 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0570  OstA family protein  27.21 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0406  cell envelope biogenesis protein YhbN  28.57 
 
 		 187 aa  61.2  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0107  OstA family protein  30.99 
 
 		 180 aa  61.2  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.587032 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002405  LptA protein  31.33 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.122787  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0157  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  25.97 
 
 		 207 aa  60.5  0.000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.503776 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2071  OstA family protein  28.78 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0437606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1369  OstA family protein  24.85 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.524769  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0151  hypothetical protein  29.94 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0300186  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0156  hypothetical protein  29.94 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0168  OstA family protein  31.45 
 
 		 216 aa  57.8  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3336  OstA family protein  30.88 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5273  OstA family protein  37.04 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03662  hypothetical protein  30.67 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2416  cell envelope biogenesis YhbN  26.62 
 
 		 175 aa  55.5  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.972183  normal  0.0334942 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4956  OstA family protein  27.85 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2107  hypothetical protein  28.97 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0728  OstA-like protein  30.15 
 
 		 180 aa  53.9  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03191  OstA-like protein  27.91 
 
 		 184 aa  50.4  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0972  OstA family protein  25.47 
 
 		 174 aa  50.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000111121  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0206  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  20.86 
 
 		 179 aa  49.7  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0508  OstA family protein  30.19 
 
 		 198 aa  49.3  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.346357  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2168  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  22.98 
 
 		 182 aa  48.9  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2224  OstA-like protein  45.83 
 
 		 174 aa  48.5  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2635  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  29.32 
 
 		 182 aa  48.1  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.317916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3027  hypothetical protein  29.32 
 
 		 182 aa  48.1  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0429  OstA family protein  23.56 
 
 		 224 aa  47.8  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.034618 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4314  OstA family protein  28.45 
 
 		 186 aa  47.4  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.257817 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0825  cell envelope biogenesis YhbN  27.63 
 
 		 157 aa  47.4  0.00009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1769  hypothetical protein  25.53 
 
 		 179 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1489  OstA-like protein  26.54 
 
 		 189 aa  46.2  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0428752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2791  OstA-like protein  23.24 
 
 		 275 aa  45.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.127705  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0152  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  24.44 
 
 		 175 aa  45.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.301086  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0925  OstA-like protein  26.54 
 
 		 189 aa  45.1  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2890  OstA family protein  25 
 
 		 173 aa  43.5  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.745795  normal  0.143441 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1603  OstA family protein  26.57 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0753  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  22.46 
 
 		 194 aa  43.1  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.703312  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0507  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  29.46 
 
 		 185 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4522  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  29.46 
 
 		 185 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.599849  normal  0.710923 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1175  hypothetical protein  24.65 
 
 		 172 aa  42.4  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3570  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  29.46 
 
 		 185 aa  42  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3496  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  29.46 
 
 		 185 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0500  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  29.46 
 
 		 185 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.850542  normal  0.391623 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3688  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  29.46 
 
 		 185 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3393  lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA  29.46 
 
 		 185 aa  42  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12810  LPS transport protein LptA  24 
 
 		 184 aa  42  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3177  alpha amylase domain-containing protein  29.17 
 
 		 179 aa  41.6  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2124  OstA family protein  24.48 
 
 		 175 aa  41.2  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1205  cell envelope biogenesis protein YhbN  23.39 
 
 		 171 aa  40.8  0.008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0872  OstA family protein  23.68 
 
 		 181 aa  40.8  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0206259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0760  hypothetical protein  23.39 
 
 		 171 aa  40.8  0.008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.879513  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1245  OstA family protein  32.5 
 
 		 573 aa  40.8  0.008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.483214  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0974  OstA-like protein  23.24 
 
 		 180 aa  40.4  0.01  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>