More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3319 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3319  ABC transporter related  100 
 
 		 257 aa  512  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2727  ABC transporter related  36.8 
 
 		 263 aa  176  4e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0769832 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0291  ABC transporter related  36.69 
 
 		 268 aa  175  8e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0162  ABC transporter related  36.9 
 
 		 261 aa  173  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.543023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1355  ABC transporter related  42.34 
 
 		 249 aa  170  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3381  ABC transporter related  35.63 
 
 		 265 aa  169  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1238  ABC transporter related  42.49 
 
 		 230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  37.3 
 
 		 265 aa  161  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1075  ABC transporter related  35.51 
 
 		 278 aa  160  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00032373  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6436  ABC transporter related  35.51 
 
 		 261 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8564  ABC transporter related  40.82 
 
 		 859 aa  159  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00150701  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3424  ABC transporter related  36.33 
 
 		 255 aa  159  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  38.1 
 
 		 264 aa  158  7e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6327  ABC transporter related  37.83 
 
 		 252 aa  158  8e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  37.04 
 
 		 271 aa  158  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3527  ABC transporter related  35.86 
 
 		 257 aa  157  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4010  ABC transporter related  33.59 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1015  ABC transporter related  37.55 
 
 		 249 aa  156  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5860  ABC transporter related  37.55 
 
 		 272 aa  156  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4075  ABC transporter related  35.1 
 
 		 268 aa  156  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.231771 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1750  ABC transporter related  36.04 
 
 		 253 aa  155  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.272511  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5704  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  35.77 
 
 		 248 aa  155  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.695215 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0211  ABC transporter related  38.56 
 
 		 245 aa  156  4e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4794  ABC transporter related  38.49 
 
 		 259 aa  156  4e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.130359  normal  0.133792 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2246  ABC transporter ATP-binding protein  33.87 
 
 		 257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.423117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3771  ABC transporter related protein  36.92 
 
 		 294 aa  155  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.417118  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3755  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  35.37 
 
 		 240 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1280  ABC transporter-related protein  33.47 
 
 		 277 aa  155  6e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.78204  normal  0.312074 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0111  ABC transporter related  37.01 
 
 		 257 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.683249  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2011  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  34.82 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1579  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  33.46 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3371  ABC transporter related  33.73 
 
 		 258 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4998  ABC transporter related  38.33 
 
 		 250 aa  154  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1253  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  36.82 
 
 		 244 aa  153  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.133556 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2468  ABC transporter related  32.24 
 
 		 256 aa  153  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3520  ABC transporter-related protein  33.6 
 
 		 257 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.341337 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  34.78 
 
 		 252 aa  154  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2032  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  34.82 
 
 		 257 aa  153  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0564166  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1582  ABC transporter related  33.86 
 
 		 250 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.921002 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1589  ABC transporter related  32.66 
 
 		 250 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.536198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1932  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  34.41 
 
 		 257 aa  152  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3167  ABC transporter related  34.78 
 
 		 251 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3650  ABC transporter-related protein  38.66 
 
 		 282 aa  152  4e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6266  ABC transporter related  33.06 
 
 		 258 aa  152  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0642  ABC transporter related  38.67 
 
 		 278 aa  152  5e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2329  ABC transporter related  33.86 
 
 		 251 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.170291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2517  ABC transporter related  34.39 
 
 		 256 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.547475  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2058  ABC transporter related  32.67 
 
 		 257 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2451  ABC transporter related  32.67 
 
 		 257 aa  152  7e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5164  ABC transporter related  31.84 
 
 		 256 aa  152  7e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  37.15 
 
 		 259 aa  152  7e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2953  ABC transporter related  39.22 
 
 		 258 aa  152  7e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.121974 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1802  ABC transporter related  34.41 
 
 		 257 aa  152  7e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.201927  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0375  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein livG  32.4 
 
 		 273 aa  151  8e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3539  ABC transporter related  33.73 
 
 		 256 aa  151  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.610144  normal  0.120136 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1767  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  34.41 
 
 		 257 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.790665  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2792  ABC transporter related protein  37.5 
 
 		 248 aa  151  8.999999999999999e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1793  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  34.41 
 
 		 257 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1750  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  34.41 
 
 		 257 aa  151  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.844188  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1933  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  34.41 
 
 		 257 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3410  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  34.41 
 
 		 257 aa  150  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000400579 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3591  ABC transporter-related protein  34.14 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1864  ABC transporter related  35.16 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3122  ABC transporter related  32.93 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4747  ABC transporter related  36 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  34.85 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2364  ABC transporter related  39.2 
 
 		 245 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.106174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1375  ABC transporter related  35.2 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0226  ABC transporter related  34.69 
 
 		 257 aa  149  3e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.733524  normal  0.0444601 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1968  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  34.01 
 
 		 257 aa  149  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000325906 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4380  ABC transporter related protein  40.99 
 
 		 251 aa  149  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.794104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3675  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  37.13 
 
 		 632 aa  149  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0407  ABC transporter-like protein  35.97 
 
 		 273 aa  149  4e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2955  ABC transporter related  32.79 
 
 		 251 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.26025  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3290  hypothetical protein  36.44 
 
 		 252 aa  149  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0159101 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3522  ABC transporter related  34.55 
 
 		 250 aa  149  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0311765  normal  0.543543 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0677  ABC transporter related  36.61 
 
 		 260 aa  149  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.888321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0357  ABC transporter related  34.39 
 
 		 261 aa  149  5e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4220  ABC transporter related  36.12 
 
 		 254 aa  149  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  35.22 
 
 		 256 aa  149  6e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  35.22 
 
 		 256 aa  149  6e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3344  ABC transporter ATP-binding protein  31.84 
 
 		 256 aa  148  7e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0598  ABC transporter related  37.05 
 
 		 253 aa  148  7e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2237  ABC transporter related  33.98 
 
 		 255 aa  148  9e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.945618  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2865  ABC transporter related  35.04 
 
 		 261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.538946 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  36.44 
 
 		 268 aa  147  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3304  ABC transporter component  34 
 
 		 250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2928  ABC transporter related  32.26 
 
 		 252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0097  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  39.02 
 
 		 302 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.232532 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6026  ABC transporter related  38.28 
 
 		 259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  32.2 
 
 		 284 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4009  ABC transporter related  32.38 
 
 		 250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.704457  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3213  ABC transporter related  33.33 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4556  ABC transporter related  33.73 
 
 		 250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1673  ABC transporter related  32.95 
 
 		 284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3736  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2988  ABC transporter related  36.12 
 
 		 250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.759622 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0460  ABC transporter related  33.73 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.530493  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4073  ABC transporter related  32.65 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1425  ABC transporter related  34.44 
 
 		 253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.715565  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>