More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1355 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1355  ABC transporter related  100 
 
 		 249 aa  499  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1015  ABC transporter related  43.8 
 
 		 249 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1238  ABC transporter related  41.28 
 
 		 230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4328  ABC transporter related  40.98 
 
 		 269 aa  178  7e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1968  ABC transporter related  43.21 
 
 		 827 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140835  normal  0.0336357 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0659  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  39.09 
 
 		 269 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5338  ABC transporter related  42.8 
 
 		 823 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.591038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1661  ABC transporter related  39.67 
 
 		 260 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3715  ABC transporter related  39.27 
 
 		 256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.231207  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4851  ABC transporter related  42.8 
 
 		 823 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.356064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4217  ABC transporter related  39.92 
 
 		 260 aa  172  3.9999999999999995e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5836  ABC transporter related  40.64 
 
 		 272 aa  171  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011865 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2762  ABC transporter related  38.1 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3319  ABC transporter related  42.34 
 
 		 257 aa  170  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2430  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  39.92 
 
 		 263 aa  168  6e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0185  ABC transporter related  39.09 
 
 		 268 aa  167  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1947  ABC transporter related  38.46 
 
 		 256 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3132  ABC transporter related  38.46 
 
 		 256 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0678345  normal  0.466722 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3827  ABC transporter related  39.41 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1671  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  42.15 
 
 		 248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.513247  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  40.96 
 
 		 276 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1243  ABC transporter related  41.1 
 
 		 260 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2704  ABC transporter related  41.46 
 
 		 842 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.565726  normal  0.530497 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0344  ABC transporter related  39.84 
 
 		 336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.952475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0642  ABC transporter related  38.43 
 
 		 278 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  38.96 
 
 		 271 aa  163  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1389  ABC transporter related  38.96 
 
 		 256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3305  ABC transporter related  40.51 
 
 		 822 aa  163  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2163  ABC transporter related  41.08 
 
 		 828 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0310151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8564  ABC transporter related  39.43 
 
 		 859 aa  163  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00150701  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5693  ABC transporter related  40.4 
 
 		 271 aa  163  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0103926 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3338  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  36 
 
 		 251 aa  162  4.0000000000000004e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  39.34 
 
 		 258 aa  162  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  41.6 
 
 		 261 aa  162  6e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4463  ABC transporter related  39.09 
 
 		 265 aa  162  7e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27047  normal  0.236919 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2316  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  36.08 
 
 		 261 aa  161  8.000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0671  ABC transporter related  39.76 
 
 		 252 aa  161  8.000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3102  ABC transporter related protein  37.45 
 
 		 256 aa  161  9e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  38.52 
 
 		 250 aa  160  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2477  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  35.34 
 
 		 255 aa  160  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0920701 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4056  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  35.69 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4062  ABC transporter related  37.19 
 
 		 259 aa  159  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662042  normal  0.243406 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3771  ABC transporter related protein  41.04 
 
 		 294 aa  159  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.417118  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0622  ABC transporter related  37.8 
 
 		 269 aa  159  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.105631  normal  0.0623344 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0546  ABC transporter related  38.55 
 
 		 270 aa  159  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7594  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  36.69 
 
 		 250 aa  159  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3237  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  40.33 
 
 		 259 aa  159  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0314824  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0291  ABC transporter related  36.99 
 
 		 268 aa  159  5e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0760  ABC transporter related  38.78 
 
 		 273 aa  159  5e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3290  hypothetical protein  36.8 
 
 		 252 aa  158  6e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0159101 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2058  ABC transporter related  38.62 
 
 		 257 aa  158  6e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3869  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  35.29 
 
 		 256 aa  158  7e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2451  ABC transporter related  38.62 
 
 		 257 aa  158  8e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  37.11 
 
 		 256 aa  158  9e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0101  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  34.87 
 
 		 256 aa  157  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4009  ABC transporter related  39.34 
 
 		 250 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.704457  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1384  ABC transporter related  36.44 
 
 		 252 aa  158  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0904717 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20630  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  38 
 
 		 333 aa  157  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  36.86 
 
 		 284 aa  157  1e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2423  ABC transporter related  38.59 
 
 		 269 aa  157  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3626  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  37.11 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7683  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.55 
 
 		 254 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  35.6 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1288  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  37.14 
 
 		 233 aa  156  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0107  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  34.87 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0111  ABC transporter related  38.4 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.683249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3163  ABC transporter related protein  39.22 
 
 		 292 aa  156  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0375758  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0836  ABC transporter-related protein  39.2 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.547307  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4779  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  37.7 
 
 		 250 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00385754  normal  0.485127 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3057  ABC transporter related  37.7 
 
 		 334 aa  157  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0799758  hitchhiker  0.0000824418 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2314  ABC transporter related  38.11 
 
 		 249 aa  156  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2947  ABC transporter related  37.14 
 
 		 233 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.921249  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2246  ABC transporter ATP-binding protein  38.27 
 
 		 257 aa  156  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.423117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1836  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  36.68 
 
 		 257 aa  156  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.101541  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4817  putative ABC transporter, ATP-binding protein  37.19 
 
 		 260 aa  156  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.355184  normal  0.730838 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3835  ABC transporter related  40.25 
 
 		 830 aa  156  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3147  ABC transporter related  36.33 
 
 		 307 aa  156  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.32124  normal  0.601015 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  38.58 
 
 		 293 aa  156  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  37.8 
 
 		 283 aa  155  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6490  ABC transporter related  39.24 
 
 		 244 aa  156  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2502  ABC transporter related protein  35.06 
 
 		 254 aa  155  4e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2083  inner-membrane translocator ABC transporter  38.17 
 
 		 832 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.27241 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3374  ABC transporter related  36.33 
 
 		 302 aa  155  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1373  ABC transporter related  37.35 
 
 		 254 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.791476 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3736  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.8 
 
 		 251 aa  156  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4998  ABC transporter related  39.48 
 
 		 250 aa  155  4e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6327  ABC transporter related  37.96 
 
 		 252 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29711  putative ATP binding subunit of urea ABC transport system  35.95 
 
 		 250 aa  155  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1582  ABC transporter related  37.35 
 
 		 250 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.921002 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0859  ABC transporter related  42.24 
 
 		 250 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.240847  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  39.6 
 
 		 252 aa  155  5.0000000000000005e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  38.04 
 
 		 275 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  38.04 
 
 		 275 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  38.04 
 
 		 275 aa  155  6e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1978  ABC transporter related  40.6 
 
 		 259 aa  155  6e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.951957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0334  ABC transporter related  40.64 
 
 		 266 aa  155  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4429  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  36.72 
 
 		 257 aa  155  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108866 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3501  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  38.27 
 
 		 257 aa  155  7e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.638418  normal  0.331611 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  35.34 
 
 		 259 aa  155  7e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4072  ABC transporter related  39.2 
 
 		 261 aa  155  7e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>