More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6941 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6941  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
1169 aa  2366    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0447401  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3666  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  43.22 
 
 
1129 aa  836    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.802059  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2983  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  69.06 
 
 
1167 aa  1537    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3985  signal transduction histidine protein kinase  42.63 
 
 
1156 aa  874    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0386149 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4270  histidine kinase  45.86 
 
 
1175 aa  944    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2077  sensor histidine kinase/response regulator  34.59 
 
 
1082 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.981024  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2021  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.59 
 
 
1082 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2224  putative two-component regulatory system, sensor kinase protein  34.59 
 
 
1082 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3038  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.17 
 
 
936 aa  290  7e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0749319  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4626  two-component regulatory system sensor kinase  34.36 
 
 
983 aa  291  7e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.185559  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3749  histidine kinase  31.72 
 
 
935 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0736  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.71 
 
 
1074 aa  281  4e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3017  RcsC  30.15 
 
 
1083 aa  275  3e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5151  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.2 
 
 
1022 aa  274  6e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3015  kinase sensor protein  32.67 
 
 
936 aa  274  8.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.162793  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59780  putative kinase sensor protein  30.05 
 
 
1084 aa  272  4e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.000030188  hitchhiker  3.75506e-17 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0738  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.73 
 
 
925 aa  269  2.9999999999999995e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4963  two-component sensor response receiver component, histidine kinase  28.23 
 
 
1122 aa  266  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.341676 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3285  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.47 
 
 
1034 aa  262  3e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.347424  normal  0.554381 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1040  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  27.21 
 
 
934 aa  261  5.0000000000000005e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.301921  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59800  kinase sensor protein  32.07 
 
 
931 aa  258  5e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000197458  hitchhiker  2.65975e-17 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3751  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.69 
 
 
1070 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1622  capsular synthesis two-component sensor kinase and response regulator transcription regulator protein  26.47 
 
 
1098 aa  255  3e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.609482 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2456  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  28.59 
 
 
948 aa  251  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.290959  normal  0.1829 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2511  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  28.59 
 
 
948 aa  251  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0476144 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2497  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  28.59 
 
 
948 aa  251  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0147984  normal  0.803827 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2407  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  28.59 
 
 
948 aa  250  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000239257  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3040  histidine kinase  29.87 
 
 
1053 aa  250  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0526469  normal  0.364658 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2615  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  29.39 
 
 
915 aa  250  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.544475 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2882  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  29.43 
 
 
1032 aa  249  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02145  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  28.53 
 
 
933 aa  244  5e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02104  hypothetical protein  28.53 
 
 
933 aa  244  5e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1432  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  28.53 
 
 
949 aa  244  7e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0516926  hitchhiker  0.00218938 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2359  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  28.53 
 
 
949 aa  244  7e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000333746  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3358  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  28.49 
 
 
949 aa  244  7.999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00504503  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2367  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  28.49 
 
 
949 aa  243  1e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000101959  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1440  histidine kinase  28.49 
 
 
949 aa  243  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00541515  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1106  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  27.87 
 
 
951 aa  242  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.615004  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0720  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  28.49 
 
 
949 aa  242  2.9999999999999997e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00107574  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3268  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  27.93 
 
 
957 aa  241  6.999999999999999e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00176531  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2519  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  28.35 
 
 
949 aa  239  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000827535  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4222  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.18 
 
 
1002 aa  239  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.480663  normal  0.970552 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5219  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.8 
 
 
1029 aa  239  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1627  two-component system sensor protein  29.53 
 
 
988 aa  238  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0255919  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0180  response regulator/sensor histidine kinase  29.53 
 
 
1014 aa  238  7e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.696748  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0159  response regulator/sensor histidine kinase  29.53 
 
 
1032 aa  237  9e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636877  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2331  sensor histidine kinase/response regulator  34.67 
 
 
779 aa  234  7.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0909  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.95 
 
 
1333 aa  233  2e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.257325  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3210  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  26.38 
 
 
951 aa  231  4e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27550  putative sensor/response regulator hybrid  35.15 
 
 
786 aa  231  8e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00922112 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0141  two-component system sensor protein  29.63 
 
 
952 aa  230  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4966  two-component sensor response receiver component, histidine kinase  30.28 
 
 
951 aa  230  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.292915 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5724  two-component regulatory system sensory histidine kinase  33.01 
 
 
784 aa  230  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3652  Signal transduction histidine kinase-like  30.9 
 
 
765 aa  228  7e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.471696  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.63 
 
 
1768 aa  227  9e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2787  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.47 
 
 
909 aa  225  4e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319908  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.45 
 
 
1245 aa  225  4e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.62 
 
 
921 aa  224  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3011  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.38 
 
 
1436 aa  223  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.701044  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.99 
 
 
1266 aa  223  1.9999999999999999e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  30.61 
 
 
1177 aa  221  5e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4255  PAS/PAC sensor, hybrid histidine kinase  30.98 
 
 
1418 aa  221  5e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377123  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0139  histidine kinase  29.01 
 
 
1064 aa  221  7e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0484  multi-sensor histidine kinase  30.83 
 
 
1255 aa  220  1e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.908962 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4693  histidine kinase  26.53 
 
 
1120 aa  220  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.027571  hitchhiker  0.0000750184 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2946  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.64 
 
 
1303 aa  220  1e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  28.89 
 
 
1442 aa  219  2e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00475  two-component system sensor histidine kinase-response regulator hybridprotein  31.23 
 
 
1364 aa  219  2.9999999999999998e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.679058  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  30.42 
 
 
1763 aa  219  2.9999999999999998e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.91 
 
 
1771 aa  219  2.9999999999999998e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0072  putative sensor/response hybrid  32.53 
 
 
527 aa  219  4e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0111636 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3079  composite two component sensor histidine kinase and response regulator hybrid transcription regulator protein  31.64 
 
 
994 aa  218  4e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0449118  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5043  PAS  32.21 
 
 
855 aa  218  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.563138  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.43 
 
 
1363 aa  218  7e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0240  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.02 
 
 
1005 aa  217  9e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.76 
 
 
819 aa  217  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5216  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.24 
 
 
1001 aa  217  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5153  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.21 
 
 
1002 aa  217  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437111  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0223  PAS  33.46 
 
 
1214 aa  216  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  31.28 
 
 
923 aa  216  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.36 
 
 
1767 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.21 
 
 
1767 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.21 
 
 
1788 aa  216  2.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1949  two component hybrid histidine kinase/sensor response regulator  32.33 
 
 
833 aa  215  3.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1598  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.3 
 
 
964 aa  215  3.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.349888 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.81 
 
 
1782 aa  215  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.78 
 
 
1767 aa  215  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  29.54 
 
 
1014 aa  214  7.999999999999999e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.42 
 
 
1326 aa  214  7.999999999999999e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0981  putative sensor/response regulator hybrid  31.74 
 
 
1418 aa  214  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.195382  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1782  sensor histidine kinase/response regulator  31.83 
 
 
783 aa  213  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  25.95 
 
 
1331 aa  213  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0747  signal transduction histidine kinase-like protein  31.86 
 
 
1287 aa  212  3e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  31.66 
 
 
925 aa  212  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.173365 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.5 
 
 
812 aa  212  3e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1450  histidine kinase  32.7 
 
 
785 aa  212  4e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.106734  normal  0.251272 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3612  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  32.57 
 
 
796 aa  211  5e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.463414  normal  0.719468 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3979  histidine kinase  32.31 
 
 
778 aa  211  5e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.405731  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0358  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.89 
 
 
1485 aa  211  5e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3070  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.06 
 
 
1166 aa  211  6e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109625 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>