More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6651 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6651  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 299 aa  598  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.450186 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0265  LysR family transcriptional regulator  68.42 
 
 		 302 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0677  LysR family transcriptional regulator  59.03 
 
 		 298 aa  327  1.0000000000000001e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5155  LysR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 298 aa  247  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.272154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2936  LysR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 292 aa  189  4e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2393  transcriptional regulator, LysR family  39.59 
 
 		 304 aa  188  8e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340015 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2719  transcriptional regulator, LysR family  38.6 
 
 		 300 aa  188  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4138  transcriptional regulator, LysR family  39.53 
 
 		 296 aa  186  4e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3220  transcriptional regulator, LysR family  37.54 
 
 		 293 aa  183  3e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5166  LysR family transcriptional regulator  36.39 
 
 		 308 aa  182  7e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2257  LysR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 304 aa  181  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.368371  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2666  LysR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 299 aa  180  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1833  LysR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 294 aa  179  5.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0313852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1872  transcriptional regulator, LysR family  36.24 
 
 		 297 aa  177  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4560  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 302 aa  177  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.788363  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1199  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  32.3 
 
 		 300 aa  175  8e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6129  LysR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 305 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.414294 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6611  LysR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 305 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.541537 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5764  LysR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 305 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1107  transcriptional regulator, LysR family  35.76 
 
 		 293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1434  LysR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 301 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325668  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5323  transcriptional regulator, LysR family  36.39 
 
 		 313 aa  170  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7632  LysR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 305 aa  169  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2632  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 291 aa  169  4e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5843  LysR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 294 aa  168  9e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6079  LysR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 294 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.929985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0554  LysR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 301 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0255315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3910  LysR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.268348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1113  LysR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 313 aa  167  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.800719  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  34.67 
 
 		 335 aa  167  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3940  transcriptional regulator, LysR family  36.24 
 
 		 295 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2485  LysR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 313 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.434999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6055  LysR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 294 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.031905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3059  LysR family transcriptional regulator  36.39 
 
 		 310 aa  166  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2711  LysR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 292 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1474  transcriptional regulator, LysR family  36.42 
 
 		 308 aa  165  9e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0906205  hitchhiker  0.00000000107366 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1198  LysR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 298 aa  165  9e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0549  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0269293 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1164  LysR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.376229  normal  0.0112805 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1729  transcription regulator protein  36.64 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.693233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2693  LysR, substrate-binding  34.49 
 
 		 313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.426832  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0123  transcriptional regulator  34.69 
 
 		 302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0260  LysR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 302 aa  163  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.026779 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1523  transcriptional regulator, LysR family  38.19 
 
 		 308 aa  163  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.072714  normal  0.539823 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1185  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 313 aa  163  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0305189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7201  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 297 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7497  transcriptional regulator LysR family  33.22 
 
 		 296 aa  162  4.0000000000000004e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.185509  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2411  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 304 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.410162  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4248  LysR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 298 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01682  transcription regulator protein  35.02 
 
 		 309 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3034  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 313 aa  162  6e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3048  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 313 aa  162  7e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0118588  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1330  transcriptional regulator, LysR family  33.79 
 
 		 313 aa  162  7e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00626709  hitchhiker  0.000619665 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3191  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 313 aa  162  7e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0504852  normal  0.2192 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2660  transcriptional regulator, LysR family  35.64 
 
 		 300 aa  162  7e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.11047 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3363  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 312 aa  161  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1128  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 313 aa  161  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0984  LysR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 300 aa  161  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2961  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 292 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0923221 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0523  LysR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 310 aa  160  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47830  transcription regulator pirR  36.3 
 
 		 293 aa  160  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.850432  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2695  LysR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 337 aa  160  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.933352  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2223  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 310 aa  160  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.499839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1186  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 313 aa  160  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4927  transcriptional regulator, LysR family  34.68 
 
 		 318 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.364408  normal  0.198885 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1256  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 313 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00128178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5691  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 308 aa  160  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536168 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3230  regulatory protein, LysR  33.11 
 
 		 298 aa  160  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.796191 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1437  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  37.37 
 
 		 293 aa  159  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4749  LysR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 297 aa  159  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2573  LysR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 303 aa  159  4e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.888641  normal  0.0140677 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2019  LysR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 296 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5398  transcriptional regulator, LysR family  34.81 
 
 		 295 aa  159  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.187721  normal  0.0384441 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2733  transcriptional regulator, LysR family  34.01 
 
 		 300 aa  159  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1755  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 318 aa  159  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000250234  normal  0.12184 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2502  LysR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 308 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1041  LysR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 306 aa  159  6e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2868  transcriptional regulator, LysR family protein  33.9 
 
 		 313 aa  159  6e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0376307  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0139  LysR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 301 aa  159  7e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0154099 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2452  LysR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 300 aa  159  7e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0783  LysR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 301 aa  159  8e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.806567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 298 aa  158  8e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5132  LysR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 302 aa  158  9e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.052958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1499  transcriptional regulator, LysR family  35.99 
 
 		 296 aa  157  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456019 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1475  LysR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 325 aa  157  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1211  LysR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 296 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159802  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1324  LysR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 313 aa  158  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.230209 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3358  transcriptional regulator, LysR family  33.11 
 
 		 302 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0114591 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3583  transcriptional regulator, LysR family  36.27 
 
 		 300 aa  157  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.23323  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3188  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.84 
 
 		 301 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.872504  normal  0.155223 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1919  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 307 aa  157  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4901  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 303 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.795056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2043  LysR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.448688  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4606  LysR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 303 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.127451  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5698  LysR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 303 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167817 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1182  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 298 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.815774  normal  0.250883 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2292  LysR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 299 aa  156  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0521  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 317 aa  157  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0522  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 317 aa  156  3e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 298 aa  156  3e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>