144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2238 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2238  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
218 aa  426  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2029  glycosyl transferase family protein  93.95 
 
 
217 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.80207  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5418  glycosyl transferase family protein  66.04 
 
 
218 aa  270  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39706  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4939  glycosyl transferase family protein  63.01 
 
 
227 aa  256  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3134  glycosyl transferase, group 2 family protein  58.53 
 
 
217 aa  240  9e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0455635  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3001  glycosyl transferase family protein  57.14 
 
 
217 aa  238  4e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2540  glycosyl transferase family protein  56.48 
 
 
219 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.409391 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5874  glycosyl transferase family protein  55.61 
 
 
270 aa  226  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.191955 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3256  glycosyl transferase, group 2 family protein  51.17 
 
 
219 aa  208  4e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0789044  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2639  glycosyl transferase family protein  51.17 
 
 
232 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.613658 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2505  glycosyl transferase family protein  50.23 
 
 
219 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2655  glycosyl transferase family protein  50.94 
 
 
223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.584909  normal  0.786422 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1798  glycosyl transferase family protein  41.04 
 
 
224 aa  147  8e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.521662  normal  0.0312048 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0022  glycosyl transferase family protein  44.7 
 
 
234 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.647116  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0557  glycosyl transferase family 2  40.09 
 
 
250 aa  125  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20090  glycosyl transferase  39.91 
 
 
255 aa  122  5e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.308185  normal  0.813225 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0510  glycosyl transferase family 2  39.67 
 
 
270 aa  108  7.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.319403  decreased coverage  0.000000276564 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0337  glycosyl transferase family protein  37.44 
 
 
273 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0203  glycosyl transferase family 2  41.28 
 
 
225 aa  99  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.856102  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10920  acylphosphatase  37.11 
 
 
393 aa  97.8  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.551581  normal  0.319268 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01090  uncharacterized LmbE-like protein  32.11 
 
 
708 aa  79.7  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2569  glycosyl transferase family 2  35.59 
 
 
227 aa  79  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392565  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3270  glycosyl transferase family 2  37.55 
 
 
247 aa  76.3  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141739  hitchhiker  0.0000443809 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5107  glycosyl transferase family protein  34.14 
 
 
364 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.120649  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2977  glycosyl transferase family protein  33.06 
 
 
390 aa  68.2  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.707645  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4582  glycosyl transferase family 2  31.2 
 
 
386 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.077978 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0560  glycosyl transferase family protein  32.39 
 
 
225 aa  66.6  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0799  glycosyl transferase family 2  30.2 
 
 
369 aa  66.2  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.958251 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1366  glycosyl transferase family protein  33.16 
 
 
247 aa  65.9  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4212  glycosyl transferase family protein  31.2 
 
 
386 aa  65.1  0.0000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.787376  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0578  glycosyl transferase family protein  29.57 
 
 
419 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1232  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 
362 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1394  glycosyl transferase family 2  30.36 
 
 
362 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.295637 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  27.36 
 
 
236 aa  63.9  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1173  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 
372 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1343  glycosyl transferase family protein  30.87 
 
 
522 aa  60.8  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725214  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4727  glycosyl transferase family 2  30.83 
 
 
386 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0134814 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
235 aa  60.5  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1200  glycosyl transferase family 2  30.43 
 
 
237 aa  59.3  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  25.36 
 
 
528 aa  58.9  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9270  glycosyltransferase-like protein  32.83 
 
 
243 aa  58.5  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03040  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.11 
 
 
231 aa  57.8  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0161  glycosyl transferase family 2  38.61 
 
 
475 aa  56.6  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4143  glycosyl transferase family protein  31.1 
 
 
291 aa  56.6  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.89997 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4101  glycosyl transferase family protein  29.53 
 
 
390 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0116147  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3596  glycosyl transferase family 2  26.69 
 
 
418 aa  54.3  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3446  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.14 
 
 
253 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0140  glycosyl transferase family protein  31.19 
 
 
244 aa  53.9  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3442  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.65 
 
 
253 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.184184  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1165  glycosyl transferase CpsO(V)  23.55 
 
 
327 aa  54.3  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0353426  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3232  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.65 
 
 
193 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0263281  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3138  glycosyltransferase  32.65 
 
 
253 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259725  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0316  glycosyl transferase family protein  30.26 
 
 
320 aa  53.9  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.982236 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3434  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.65 
 
 
253 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06181  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  25.97 
 
 
234 aa  53.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.630616  normal  0.683964 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1447  glycosyl transferase family protein  26.43 
 
 
233 aa  52.8  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0726839  normal  0.0201369 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  30.43 
 
 
694 aa  52.4  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2333  glycosyl transferase family protein  28.23 
 
 
327 aa  52  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.012677  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1525  glycosyl transferase family protein  30.73 
 
 
240 aa  52  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.201491  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2919  glycosyl transferase family 2  25.79 
 
 
384 aa  51.6  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.60146  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0119  glycosyl transferase family protein  33.04 
 
 
232 aa  51.6  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3205  glycosyltransferase  32.65 
 
 
253 aa  51.2  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150696  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1893  glycosyltransferase  23.66 
 
 
234 aa  50.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2953  glycosyl transferase family protein  28 
 
 
268 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666852  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3459  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.65 
 
 
253 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0198533  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0947  glycosyl transferase family 2  27.57 
 
 
227 aa  50.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  28.37 
 
 
315 aa  50.8  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  24.77 
 
 
305 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3194  glycosyl transferase family 2  28.16 
 
 
455 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3908  glycosyl transferase, WecB/TagA/CpsF family  27.94 
 
 
907 aa  49.3  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  26.91 
 
 
477 aa  48.5  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0943  glycosyl transferase family 2  27.54 
 
 
351 aa  48.5  0.00007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.799144  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0487  glycosyl transferase family protein  24.48 
 
 
284 aa  48.1  0.00009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.843285 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  30.83 
 
 
337 aa  48.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1198  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 
318 aa  47.8  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0377  glycosyl transferase family 2  41.67 
 
 
523 aa  47.4  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3658  glycosyl transferase family protein  36.19 
 
 
349 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2341  glycosyl transferase family protein  28.5 
 
 
236 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  35.87 
 
 
344 aa  48.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3499  glycosyl transferase family 2  40.23 
 
 
497 aa  48.1  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.802267  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1536  glycosyl transferase family 2  32.67 
 
 
238 aa  47.8  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1205  Putative glycosyl/glycerophosphate transferase involved in teichoic acid biosynthesis TagF/TagB/EpsJ/RodC- like protein  30.26 
 
 
1173 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1910  glycosyl transferase family 2  28.44 
 
 
622 aa  48.1  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00799183  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1549  glycosyl transferase family protein  35.29 
 
 
240 aa  47  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0584416  normal  0.851188 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0798  glycosyl transferase family protein  26.22 
 
 
316 aa  47  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0913386  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3115  glycosyl transferase family 2  28.76 
 
 
235 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5289  glycosyl transferase family 2  30.69 
 
 
403 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3652  glycosyl transferase family 2  26.6 
 
 
246 aa  46.6  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0575879  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6545  glycosyl transferase family protein  31.55 
 
 
293 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.125421 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2582  glycosyl transferase family 2  25.81 
 
 
1038 aa  46.6  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.601969  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4777  glycosyl transferase family 2  24.1 
 
 
393 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.340207 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4098  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  26.27 
 
 
1148 aa  46.2  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2017  glycosyl transferase family protein  26.18 
 
 
322 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  24.64 
 
 
260 aa  46.2  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0563  hypothetical protein  26.06 
 
 
227 aa  45.8  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.559548  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  27.14 
 
 
328 aa  45.8  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0301  glycosyltransferase  26.36 
 
 
309 aa  45.4  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.4815  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2328  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.75 
 
 
466 aa  45.4  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.417791  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2554  glycosyl transferase family 2  34.75 
 
 
385 aa  45.4  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1742  glycosyltransferase  27.57 
 
 
281 aa  45.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00465779  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>