More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1198 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1198  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 318 aa  657    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01307  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  52.1 
 
 		 326 aa  332  6e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2471  glycosyl transferase family 2  32.77 
 
 		 311 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1776  glycosyl transferase family 2  31.93 
 
 		 311 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  31.93 
 
 		 328 aa  116  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2467  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 		 322 aa  106  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2333  glycosyl transferase family protein  25.68 
 
 		 327 aa  97.1  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.012677  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2017  glycosyl transferase family protein  30.09 
 
 		 322 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  25.79 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3115  glycosyl transferase family 2  30.72 
 
 		 235 aa  75.1  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1200  glycosyl transferase family 2  30.22 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05340  Glycosyl transferase, family 2  28.18 
 
 		 321 aa  71.6  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000520172  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  23.96 
 
 		 528 aa  70.9  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1274  glycosyl transferase family 2  23.72 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0487  glycosyl transferase family protein  25.61 
 
 		 284 aa  65.5  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.843285 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3182  glycosyl transferase family 2  24.02 
 
 		 322 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  30.16 
 
 		 324 aa  62  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  24.46 
 
 		 477 aa  62  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1355  glycosyl transferase family protein  27.75 
 
 		 310 aa  62  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0508  glycosyl transferase family protein  26.4 
 
 		 351 aa  61.6  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.239818  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  25.97 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3248  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 323 aa  60.1  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  28.26 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1510  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.97 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.932376  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2111  glycosyl transferase family 2  25.5 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1420  glycosyl transferase family protein  26.7 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  27.84 
 
 		 1015 aa  59.3  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4122  glycosyl transferase family protein  23.85 
 
 		 311 aa  59.3  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.408918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3808  glycosyl transferase family 2  26.44 
 
 		 344 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  21.11 
 
 		 337 aa  58.9  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2255  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4885  glycosyl transferase family 2  26.44 
 
 		 344 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0343644 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5040  glycosyl transferase family 2  26.16 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.476681  normal  0.0567661 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  26.26 
 
 		 1035 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5890  glycosyl transferase family 2  26.82 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  27.53 
 
 		 327 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3231  glycosyl transferase family protein  26.49 
 
 		 316 aa  58.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000094491  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4247  glycosyl transferase family 2  24.69 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12329  predicted protein  35.25 
 
 		 207 aa  57  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  25.76 
 
 		 305 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2580  glycosyl transferase family 2  26.73 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000593359  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3457  b-glycosyltransferase  24.53 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0284988 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3168  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.51 
 
 		 333 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1987  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.51 
 
 		 333 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1386  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.51 
 
 		 333 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.343804  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3039  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.51 
 
 		 333 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200076  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5508  glycosyl transferase family 2  22.08 
 
 		 283 aa  55.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0164497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  32.23 
 
 		 305 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2274  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.51 
 
 		 333 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.102891  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0943  glycosyl transferase family 2  29.44 
 
 		 351 aa  55.5  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.799144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1010  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.51 
 
 		 333 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.374388  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1298  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.51 
 
 		 333 aa  55.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.472979  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5657  glycosyl transferase family 2  32.11 
 
 		 303 aa  54.3  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.49465 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  25.89 
 
 		 333 aa  55.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3169  glycosyl transferase family 2  28.24 
 
 		 344 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4384  glycosyl transferase family protein  26.01 
 
 		 328 aa  54.7  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10710  membrane sugar transferase  24.76 
 
 		 470 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.456153 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  27.66 
 
 		 330 aa  54.3  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0633  glycosyl transferase family 2  27.03 
 
 		 333 aa  54.3  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.718934 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1382  glycosyl transferase family protein  25.3 
 
 		 333 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6447  glycosyl transferase family protein  25.3 
 
 		 333 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0237769  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  25 
 
 		 312 aa  53.5  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6038  glycosyl transferase family protein  25.3 
 
 		 333 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.738252 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3149  glycosyl transferase family protein  25.98 
 
 		 753 aa  53.5  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  29.12 
 
 		 314 aa  53.1  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4035  glycosyl transferase family protein  27.33 
 
 		 344 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5057  glycosyl transferase family protein  27.01 
 
 		 470 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1651  glycosyl transferase family 2  26.97 
 
 		 313 aa  53.1  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  20.99 
 
 		 310 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4024  glycosyl transferase family protein  22.92 
 
 		 322 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  24.52 
 
 		 362 aa  53.1  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  24.44 
 
 		 235 aa  52.8  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0249  glycosyl transferase family protein  26.56 
 
 		 573 aa  52.8  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  23.04 
 
 		 260 aa  52.8  0.000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0243  glycosyl transferase family protein  26.56 
 
 		 573 aa  52.8  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1299  glycosyl transferase family protein  23.61 
 
 		 470 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0628268 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0484  glycosyl transferase family 2  26.29 
 
 		 314 aa  52.8  0.000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02465  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  23.08 
 
 		 309 aa  52.8  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.248238  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  28 
 
 		 337 aa  52  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6397  glycosyl transferase family protein  24.1 
 
 		 333 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.441453  normal  0.138484 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1130  glycosyl transferase family 2  25.24 
 
 		 332 aa  52.4  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0354  glycosyl transferase family 2  27.62 
 
 		 331 aa  52  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1536  glycosyl transferase family 2  28.49 
 
 		 238 aa  52.4  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2354  glycosyl transferase family protein  25.37 
 
 		 297 aa  52  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.358669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5649  glycosyl transferase family protein  24.1 
 
 		 333 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0900976  normal  0.264223 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1428  hypothetical protein  34.31 
 
 		 346 aa  52.4  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.166911  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1503  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.3 
 
 		 300 aa  51.2  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.814973  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5280  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.06 
 
 		 273 aa  51.2  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5124  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.06 
 
 		 273 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5523  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.06 
 
 		 273 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26480  glycosyl transferase  25 
 
 		 672 aa  51.2  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 230 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1407  putative glycosyl transferase  28.82 
 
 		 243 aa  51.2  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2533  glycosyl transferase family protein  27.09 
 
 		 281 aa  51.6  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0703  glycosyl transferase family 2  24.82 
 
 		 348 aa  51.2  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.39468e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3024  putative glycosyl transferase  24.17 
 
 		 292 aa  51.6  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.308393  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2255  glycosyl transferase, group 1/glycosyl transferase, group 2  26.07 
 
 		 740 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2753  glycosyl transferase family 2  22.62 
 
 		 310 aa  50.8  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.8402 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  24.02 
 
 		 276 aa  50.8  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  31.19 
 
 		 379 aa  50.8  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>