46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0799 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0799  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
369 aa  726    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.958251 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4101  glycosyl transferase family protein  40.44 
 
 
390 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0116147  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4582  glycosyl transferase family 2  40.4 
 
 
386 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.077978 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4727  glycosyl transferase family 2  40.28 
 
 
386 aa  194  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0134814 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3596  glycosyl transferase family 2  37.57 
 
 
418 aa  192  6e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4212  glycosyl transferase family protein  39.61 
 
 
386 aa  189  7e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.787376  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0578  glycosyl transferase family protein  37.12 
 
 
419 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2977  glycosyl transferase family protein  40.5 
 
 
390 aa  177  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.707645  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1232  glycosyl transferase family protein  40.91 
 
 
362 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1173  glycosyl transferase family 2  42.19 
 
 
372 aa  162  9e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1394  glycosyl transferase family 2  41.98 
 
 
362 aa  162  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.295637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2919  glycosyl transferase family 2  32.29 
 
 
384 aa  155  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.60146  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5107  glycosyl transferase family protein  41.26 
 
 
364 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.120649  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1343  glycosyl transferase family protein  35.22 
 
 
522 aa  71.2  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725214  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4939  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 
227 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10920  acylphosphatase  31.7 
 
 
393 aa  69.3  0.00000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.551581  normal  0.319268 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5418  glycosyl transferase family protein  33.06 
 
 
218 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39706  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20090  glycosyl transferase  28.52 
 
 
255 aa  64.7  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.308185  normal  0.813225 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2540  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 
219 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.409391 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3001  glycosyl transferase family protein  29.84 
 
 
217 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2569  glycosyl transferase family 2  33.77 
 
 
227 aa  60.8  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392565  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0557  glycosyl transferase family 2  26.29 
 
 
250 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3134  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.44 
 
 
217 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0455635  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2029  glycosyl transferase family protein  29.36 
 
 
217 aa  57  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.80207  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5874  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 
270 aa  57  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.191955 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2639  glycosyl transferase family protein  28.91 
 
 
232 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.613658 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0337  glycosyl transferase family protein  29.81 
 
 
273 aa  53.5  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0510  glycosyl transferase family 2  30.38 
 
 
270 aa  53.5  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.319403  decreased coverage  0.000000276564 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2505  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 
219 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1798  glycosyl transferase family protein  26.25 
 
 
224 aa  52.4  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.521662  normal  0.0312048 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3256  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.32 
 
 
219 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0789044  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2655  glycosyl transferase family protein  27.56 
 
 
223 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.584909  normal  0.786422 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1913  glycosyl transferase family 2  29.37 
 
 
286 aa  48.1  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1040  glycosyl transferase family 2  31.15 
 
 
380 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2953  glycosyl transferase family protein  28.11 
 
 
268 aa  47.4  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666852  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2238  glycosyl transferase family 2  34.9 
 
 
218 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0073  glycosyl transferase family 2  31.55 
 
 
232 aa  47  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3738  glycosyl transferase family 2  33.96 
 
 
279 aa  46.6  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  31.01 
 
 
235 aa  46.2  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0022  glycosyl transferase family protein  27.13 
 
 
234 aa  46.2  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.647116  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1742  glycosyltransferase  27.43 
 
 
281 aa  46.2  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00465779  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3652  glycosyl transferase family 2  29.82 
 
 
246 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0575879  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1078  glycosyl transferase family protein  32.17 
 
 
232 aa  44.3  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892634  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1447  glycosyl transferase family protein  26.96 
 
 
233 aa  43.5  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0726839  normal  0.0201369 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0484  glycosyl transferase family protein  26.39 
 
 
301 aa  43.5  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.68216 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2238  glycosyl transferase family 2  32.76 
 
 
374 aa  42.7  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>