168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2505 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2505  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 219 aa  440  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3256  glycosyl transferase, group 2 family protein  96.8 
 
 		 219 aa  427  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0789044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2639  glycosyl transferase family protein  87.21 
 
 		 232 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613658 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2655  glycosyl transferase family protein  80.28 
 
 		 223 aa  349  2e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.584909  normal  0.786422 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2540  glycosyl transferase family protein  54.42 
 
 		 219 aa  228  8e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409391 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3134  glycosyl transferase, group 2 family protein  52.53 
 
 		 217 aa  214  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0455635  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3001  glycosyl transferase family protein  52.07 
 
 		 217 aa  210  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2029  glycosyl transferase family protein  50 
 
 		 217 aa  194  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.80207  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5418  glycosyl transferase family protein  51.63 
 
 		 218 aa  191  8e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39706  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4939  glycosyl transferase family protein  48.65 
 
 		 227 aa  186  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2238  glycosyl transferase family 2  50.23 
 
 		 218 aa  181  6e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5874  glycosyl transferase family protein  47.2 
 
 		 270 aa  172  3.9999999999999995e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191955 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1798  glycosyl transferase family protein  41.44 
 
 		 224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.521662  normal  0.0312048 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0022  glycosyl transferase family protein  44.8 
 
 		 234 aa  152  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.647116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0557  glycosyl transferase family 2  43.97 
 
 		 250 aa  145  6e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20090  glycosyl transferase  38.3 
 
 		 255 aa  132  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.308185  normal  0.813225 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0203  glycosyl transferase family 2  43.91 
 
 		 225 aa  131  6e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.856102  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0510  glycosyl transferase family 2  39.57 
 
 		 270 aa  111  7.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.319403  decreased coverage  0.000000276564 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0337  glycosyl transferase family protein  37.07 
 
 		 273 aa  102  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01090  uncharacterized LmbE-like protein  37.85 
 
 		 708 aa  100  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10920  acylphosphatase  37.85 
 
 		 393 aa  99.8  3e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.551581  normal  0.319268 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3270  glycosyl transferase family 2  37.07 
 
 		 247 aa  94.7  9e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141739  hitchhiker  0.0000443809 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2569  glycosyl transferase family 2  36.89 
 
 		 227 aa  93.2  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392565  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0578  glycosyl transferase family protein  29.8 
 
 		 419 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4101  glycosyl transferase family protein  30.16 
 
 		 390 aa  72.4  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0116147  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5107  glycosyl transferase family protein  29.76 
 
 		 364 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.120649  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05340  Glycosyl transferase, family 2  35.18 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000520172  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1173  glycosyl transferase family 2  30.74 
 
 		 372 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  28.97 
 
 		 236 aa  68.9  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3596  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 		 418 aa  65.5  0.0000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2017  glycosyl transferase family protein  30.88 
 
 		 322 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1394  glycosyl transferase family 2  28.74 
 
 		 362 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.295637 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1366  glycosyl transferase family protein  29.33 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0560  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1232  glycosyl transferase family protein  27.82 
 
 		 362 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  25.81 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  28.1 
 
 		 479 aa  60.8  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  28.57 
 
 		 479 aa  60.5  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1525  glycosyl transferase family protein  37.29 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.201491  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  28.65 
 
 		 328 aa  59.3  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  27.48 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2088  AMP-dependent synthetase and ligase  30.54 
 
 		 807 aa  58.2  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9270  glycosyltransferase-like protein  29.86 
 
 		 243 aa  58.2  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3442  glycosyl transferase, group 2 family protein  32 
 
 		 253 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.184184  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1343  glycosyl transferase family protein  33.05 
 
 		 522 aa  57  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725214  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2467  glycosyl transferase family protein  30.54 
 
 		 322 aa  56.6  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3115  glycosyl transferase family 2  30.11 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03040  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.08 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1141  glycosyl transferase/polysaccharide deacetylase family protein  28.1 
 
 		 481 aa  55.5  0.0000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.226715  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1549  glycosyl transferase family protein  36.44 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0584416  normal  0.851188 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1701  glycosyl transferase family protein  45.54 
 
 		 276 aa  55.5  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0805319 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3738  glycosyl transferase family 2  26.9 
 
 		 279 aa  55.1  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3446  glycosyl transferase, group 2 family protein  32 
 
 		 253 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1200  glycosyl transferase family 2  29.58 
 
 		 237 aa  55.1  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4098  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  30.77 
 
 		 1148 aa  55.1  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0058  glycosyl transferase family 2  29.27 
 
 		 337 aa  54.7  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.246717 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3138  glycosyltransferase  28.85 
 
 		 253 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259725  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4582  glycosyl transferase family 2  28.35 
 
 		 386 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.077978 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4727  glycosyl transferase family 2  30.92 
 
 		 386 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0134814 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3434  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.62 
 
 		 253 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3232  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.85 
 
 		 193 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0263281  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0119  glycosyl transferase family protein  32.46 
 
 		 232 aa  53.1  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0799  glycosyl transferase family 2  26.32 
 
 		 369 aa  53.1  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.958251 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4212  glycosyl transferase family protein  28.29 
 
 		 386 aa  52  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.787376  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2977  glycosyl transferase family protein  25.67 
 
 		 390 aa  52  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.707645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4777  glycosyl transferase family 2  36.47 
 
 		 393 aa  52  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.340207 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  28.46 
 
 		 694 aa  52  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3459  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.85 
 
 		 253 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0198533  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3205  glycosyltransferase  28.85 
 
 		 253 aa  51.6  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150696  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  27.84 
 
 		 315 aa  51.2  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5165  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  31.2 
 
 		 1168 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.390829 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1447  glycosyl transferase family protein  22.75 
 
 		 233 aa  50.1  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0726839  normal  0.0201369 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1414  glycosyl transferase family protein  38.61 
 
 		 276 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402537 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1196  b-glycosyltransferase  25.11 
 
 		 349 aa  48.9  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.959593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2919  glycosyl transferase family 2  24.71 
 
 		 384 aa  48.9  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.60146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2355  glycosyl transferase family protein  26.09 
 
 		 232 aa  48.9  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0218  glycosyl transferase family protein  22.88 
 
 		 379 aa  48.9  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0353  glycosyl transferase family 2  21.72 
 
 		 312 aa  48.5  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000439981  normal  0.42611 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3591  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  37.4 
 
 		 252 aa  48.5  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.221254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0161  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 475 aa  48.1  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08261  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  25.41 
 
 		 231 aa  48.5  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0167  glycosyl transferase family 2  24.43 
 
 		 365 aa  48.1  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00277804  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1158  glycosyl transferase family protein  43.33 
 
 		 403 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3138  glycosyl transferase family protein  26.44 
 
 		 236 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  29.37 
 
 		 1157 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2718  glycosyl transferase family protein  28.43 
 
 		 325 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.543733  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2760  glycosyl transferase family 2  28.81 
 
 		 242 aa  47.4  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0363167  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2133  glycosyl transferase family 2  28.81 
 
 		 340 aa  47  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0441778  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2444  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 		 320 aa  47  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.181475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1776  glycosyl transferase family 2  29.32 
 
 		 311 aa  47.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2471  glycosyl transferase family 2  29.79 
 
 		 311 aa  46.6  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 		 477 aa  46.6  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2577  glycosyl transferase family protein  28.43 
 
 		 325 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1840  cell wall membrane glycosyltransferase  25.42 
 
 		 308 aa  46.6  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0276  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.63 
 
 		 245 aa  46.2  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.50271  decreased coverage  0.0000266916 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0674  glycosyl transferase family 2  29.18 
 
 		 382 aa  46.2  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4464  glycosyl transferase family 2  34.69 
 
 		 335 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0337  glycosyl transferase family 2  24.75 
 
 		 349 aa  46.2  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4255  glycosyl transferase family protein  26.9 
 
 		 330 aa  45.8  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  24.74 
 
 		 305 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>