88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_20090 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_20090  glycosyl transferase  100 
 
 		 255 aa  491  9.999999999999999e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.308185  normal  0.813225 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0510  glycosyl transferase family 2  51 
 
 		 270 aa  182  3e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.319403  decreased coverage  0.000000276564 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0557  glycosyl transferase family 2  41.25 
 
 		 250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0337  glycosyl transferase family protein  41.94 
 
 		 273 aa  139  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3256  glycosyl transferase, group 2 family protein  40 
 
 		 219 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0789044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2505  glycosyl transferase family protein  39.15 
 
 		 219 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3134  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.53 
 
 		 217 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0455635  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3001  glycosyl transferase family protein  38.53 
 
 		 217 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2639  glycosyl transferase family protein  38.63 
 
 		 232 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613658 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1798  glycosyl transferase family protein  31.6 
 
 		 224 aa  122  5e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.521662  normal  0.0312048 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2655  glycosyl transferase family protein  39.15 
 
 		 223 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.584909  normal  0.786422 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4939  glycosyl transferase family protein  39.57 
 
 		 227 aa  115  5e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3270  glycosyl transferase family 2  38.56 
 
 		 247 aa  115  5e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141739  hitchhiker  0.0000443809 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5874  glycosyl transferase family protein  37.55 
 
 		 270 aa  112  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191955 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2029  glycosyl transferase family protein  39.48 
 
 		 217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.80207  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0022  glycosyl transferase family protein  36.25 
 
 		 234 aa  108  6e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.647116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2238  glycosyl transferase family 2  40.52 
 
 		 218 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2540  glycosyl transferase family protein  34.04 
 
 		 219 aa  106  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409391 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5418  glycosyl transferase family protein  37.17 
 
 		 218 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39706  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01090  uncharacterized LmbE-like protein  42.25 
 
 		 708 aa  98.6  8e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0203  glycosyl transferase family 2  41.98 
 
 		 225 aa  94  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.856102  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2569  glycosyl transferase family 2  39.11 
 
 		 227 aa  90.1  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392565  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10920  acylphosphatase  32.94 
 
 		 393 aa  83.6  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.551581  normal  0.319268 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5107  glycosyl transferase family protein  32.85 
 
 		 364 aa  78.6  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.120649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4582  glycosyl transferase family 2  31.66 
 
 		 386 aa  75.5  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.077978 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4212  glycosyl transferase family protein  30.89 
 
 		 386 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.787376  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2977  glycosyl transferase family protein  33.85 
 
 		 390 aa  68.9  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.707645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4727  glycosyl transferase family 2  31.27 
 
 		 386 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0134814 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0799  glycosyl transferase family 2  28.89 
 
 		 369 aa  67.8  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.958251 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1343  glycosyl transferase family protein  31.7 
 
 		 522 aa  65.9  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725214  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1173  glycosyl transferase family 2  28.68 
 
 		 372 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0578  glycosyl transferase family protein  29.92 
 
 		 419 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4101  glycosyl transferase family protein  28.31 
 
 		 390 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0116147  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1447  glycosyl transferase family protein  25.12 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0726839  normal  0.0201369 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1232  glycosyl transferase family protein  27.65 
 
 		 362 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3596  glycosyl transferase family 2  25.48 
 
 		 418 aa  55.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1394  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 		 362 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.295637 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2088  AMP-dependent synthetase and ligase  26.21 
 
 		 807 aa  52.8  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0560  glycosyl transferase family protein  31.28 
 
 		 225 aa  52.8  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05340  Glycosyl transferase, family 2  26.64 
 
 		 321 aa  50.4  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000520172  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  26.67 
 
 		 236 aa  50.8  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0119  glycosyl transferase family protein  25.46 
 
 		 232 aa  50.4  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0506  glycosyl transferase  26.48 
 
 		 332 aa  50.1  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641026  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  26.36 
 
 		 235 aa  48.9  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1256  glycosyl transferase family protein  26.48 
 
 		 240 aa  47.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000223583  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3232  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.99 
 
 		 193 aa  46.6  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0263281  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0340  glycosyl transferase family 2  27.6 
 
 		 270 aa  46.6  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167181  normal  0.387021 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0863  ribonuclease III  27.81 
 
 		 312 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4098  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  34.74 
 
 		 1148 aa  45.8  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3446  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.54 
 
 		 253 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2017  glycosyl transferase family protein  24.45 
 
 		 322 aa  45.4  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3442  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.27 
 
 		 253 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.184184  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  32.65 
 
 		 1157 aa  45.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3395  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  30.82 
 
 		 322 aa  44.7  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2919  glycosyl transferase family 2  24.71 
 
 		 384 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.60146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1366  glycosyl transferase family protein  24.87 
 
 		 247 aa  44.3  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1525  glycosyl transferase family protein  29.36 
 
 		 240 aa  44.3  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.201491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2953  glycosyl transferase family protein  25.54 
 
 		 268 aa  43.9  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666852  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1078  glycosyl transferase family protein  26.42 
 
 		 232 aa  44.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892634  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3138  glycosyltransferase  27.54 
 
 		 253 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259725  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4187  glycosyl transferase family 2  30.71 
 
 		 386 aa  43.5  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02139  hypothetical protein  30.19 
 
 		 322 aa  43.5  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2399  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  30.19 
 
 		 322 aa  43.5  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.911848  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2549  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  30.19 
 
 		 322 aa  43.5  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3459  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.71 
 
 		 253 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0198533  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3205  glycosyltransferase  25.71 
 
 		 253 aa  43.9  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150696  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1404  glycosyl transferase family 2  30.19 
 
 		 322 aa  43.5  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6545  glycosyl transferase family protein  42.86 
 
 		 293 aa  43.5  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.125421 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1395  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  30.19 
 
 		 322 aa  43.5  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02180  undecaprenyl phosphate-L-Ara4FN transferase  30.19 
 
 		 322 aa  43.5  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  26.59 
 
 		 333 aa  43.1  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2434  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  29.81 
 
 		 327 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2526  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  29.81 
 
 		 327 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2538  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  29.81 
 
 		 327 aa  43.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2408  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  32.05 
 
 		 322 aa  43.1  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0429  glycosyl transferase  26.75 
 
 		 328 aa  42.7  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.541189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1629  glycosyl transferase family protein  34.94 
 
 		 342 aa  43.1  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2483  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  29.81 
 
 		 327 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1536  glycosyl transferase family 2  24.65 
 
 		 238 aa  42.7  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1767  glycosyl transferase family 2  33 
 
 		 331 aa  42.7  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3281  glycosyl transferase family 2  21.89 
 
 		 307 aa  42.4  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2155  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  27.89 
 
 		 326 aa  42.4  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2642  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  29.81 
 
 		 327 aa  42.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.812613  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0135  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.67 
 
 		 326 aa  42.4  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00814446  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0124  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.67 
 
 		 326 aa  42.4  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.854442  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3434  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.96 
 
 		 253 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3738  glycosyl transferase family 2  26.4 
 
 		 279 aa  42  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2333  glycosyl transferase family protein  21.05 
 
 		 327 aa  42  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.012677  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>