156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2639 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2639  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 232 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613658 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3256  glycosyl transferase, group 2 family protein  88.58 
 
 		 219 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0789044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2505  glycosyl transferase family protein  87.21 
 
 		 219 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2655  glycosyl transferase family protein  76.61 
 
 		 223 aa  331  6e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.584909  normal  0.786422 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2540  glycosyl transferase family protein  53.95 
 
 		 219 aa  228  7e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409391 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3134  glycosyl transferase, group 2 family protein  53.92 
 
 		 217 aa  224  6e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0455635  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3001  glycosyl transferase family protein  53.46 
 
 		 217 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2029  glycosyl transferase family protein  51.17 
 
 		 217 aa  203  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.80207  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4939  glycosyl transferase family protein  48.91 
 
 		 227 aa  196  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5418  glycosyl transferase family protein  50.23 
 
 		 218 aa  190  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39706  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2238  glycosyl transferase family 2  51.17 
 
 		 218 aa  191  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5874  glycosyl transferase family protein  46.49 
 
 		 270 aa  178  4.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191955 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1798  glycosyl transferase family protein  42.47 
 
 		 224 aa  172  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.521662  normal  0.0312048 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0557  glycosyl transferase family 2  44.83 
 
 		 250 aa  148  7e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0022  glycosyl transferase family protein  43.69 
 
 		 234 aa  142  5e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.647116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20090  glycosyl transferase  37.77 
 
 		 255 aa  124  9e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.308185  normal  0.813225 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0203  glycosyl transferase family 2  41.67 
 
 		 225 aa  121  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.856102  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0337  glycosyl transferase family protein  38.86 
 
 		 273 aa  108  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0510  glycosyl transferase family 2  38.3 
 
 		 270 aa  104  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.319403  decreased coverage  0.000000276564 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3270  glycosyl transferase family 2  38.53 
 
 		 247 aa  99  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141739  hitchhiker  0.0000443809 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10920  acylphosphatase  36.6 
 
 		 393 aa  98.2  9e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.551581  normal  0.319268 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2569  glycosyl transferase family 2  36.68 
 
 		 227 aa  96.3  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392565  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01090  uncharacterized LmbE-like protein  37.25 
 
 		 708 aa  96.3  4e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0578  glycosyl transferase family protein  31.84 
 
 		 419 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4101  glycosyl transferase family protein  31.09 
 
 		 390 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0116147  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  28.03 
 
 		 236 aa  69.7  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5107  glycosyl transferase family protein  29.46 
 
 		 364 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.120649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3596  glycosyl transferase family 2  28.06 
 
 		 418 aa  67.4  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05340  Glycosyl transferase, family 2  32.74 
 
 		 321 aa  66.6  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000520172  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2017  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 		 322 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  24.11 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1173  glycosyl transferase family 2  29.48 
 
 		 372 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1394  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 		 362 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.295637 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4582  glycosyl transferase family 2  28.17 
 
 		 386 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.077978 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4727  glycosyl transferase family 2  28.46 
 
 		 386 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0134814 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0058  glycosyl transferase family 2  30.4 
 
 		 337 aa  58.9  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.246717 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4212  glycosyl transferase family protein  26.98 
 
 		 386 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.787376  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0799  glycosyl transferase family 2  28.91 
 
 		 369 aa  58.9  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.958251 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  29.02 
 
 		 328 aa  58.5  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1366  glycosyl transferase family protein  26.7 
 
 		 247 aa  58.5  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3442  glycosyl transferase, group 2 family protein  32 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.184184  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0560  glycosyl transferase family protein  29.81 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1447  glycosyl transferase family protein  26.7 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0726839  normal  0.0201369 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1232  glycosyl transferase family protein  28.06 
 
 		 362 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2977  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 		 390 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.707645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03040  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.84 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2467  glycosyl transferase family protein  31.74 
 
 		 322 aa  56.2  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  29.31 
 
 		 479 aa  56.2  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1200  glycosyl transferase family 2  32.69 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3738  glycosyl transferase family 2  26.13 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1525  glycosyl transferase family protein  35.59 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.201491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3446  glycosyl transferase, group 2 family protein  32 
 
 		 253 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4777  glycosyl transferase family 2  40 
 
 		 393 aa  55.5  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.340207 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2088  AMP-dependent synthetase and ligase  28.08 
 
 		 807 aa  55.1  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9270  glycosyltransferase-like protein  29.44 
 
 		 243 aa  55.1  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1343  glycosyl transferase family protein  30.49 
 
 		 522 aa  54.7  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725214  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  28.16 
 
 		 235 aa  54.7  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  28.74 
 
 		 479 aa  54.7  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3434  glycosyl transferase, group 2 family protein  27 
 
 		 253 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3232  glycosyl transferase, group 2 family protein  27 
 
 		 193 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0263281  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3138  glycosyltransferase  30.67 
 
 		 253 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259725  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0119  glycosyl transferase family protein  33.66 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3115  glycosyl transferase family 2  30.11 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  29.27 
 
 		 694 aa  53.1  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1893  glycosyltransferase  22.51 
 
 		 234 aa  52.8  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2471  glycosyl transferase family 2  27.81 
 
 		 311 aa  52  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3459  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.67 
 
 		 253 aa  52  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0198533  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3205  glycosyltransferase  30.67 
 
 		 253 aa  52  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150696  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1549  glycosyl transferase family protein  34.75 
 
 		 240 aa  52  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0584416  normal  0.851188 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2760  glycosyl transferase family 2  29.66 
 
 		 242 aa  51.6  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0363167  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2333  glycosyl transferase family protein  24.35 
 
 		 327 aa  51.6  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.012677  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1776  glycosyl transferase family 2  27.37 
 
 		 311 aa  51.6  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1141  glycosyl transferase/polysaccharide deacetylase family protein  32.67 
 
 		 481 aa  50.4  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.226715  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5165  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  32 
 
 		 1168 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.390829 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2341  glycosyl transferase family protein  26.54 
 
 		 236 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0218  glycosyl transferase family protein  22.61 
 
 		 379 aa  50.8  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4098  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  29.37 
 
 		 1148 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3591  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  36.59 
 
 		 252 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.221254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1536  glycosyl transferase family 2  31.68 
 
 		 238 aa  49.3  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1078  glycosyl transferase family protein  24.66 
 
 		 232 aa  49.3  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892634  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1701  glycosyl transferase family protein  34.93 
 
 		 276 aa  49.3  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0805319 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0161  glycosyl transferase family 2  32.32 
 
 		 475 aa  49.3  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05661  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  24.63 
 
 		 236 aa  48.9  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.287128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1957  glycosyl transferase family protein  30.11 
 
 		 327 aa  48.9  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.890096  normal  0.0695773 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  38.32 
 
 		 672 aa  48.5  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3353  glycosyl transferase family protein  26.44 
 
 		 312 aa  48.5  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0505  glycosyl transferase family protein  34.17 
 
 		 262 aa  48.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06181  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  25 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.630616  normal  0.683964 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2577  glycosyl transferase family protein  29.35 
 
 		 325 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1414  glycosyl transferase family protein  31.51 
 
 		 276 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402537 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2360  glycosyl transferase family 2  26.94 
 
 		 354 aa  47.8  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.571738  normal  0.010101 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0174  glycosyl transferase family 2  27.53 
 
 		 288 aa  47.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  27.6 
 
 		 315 aa  47.8  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2133  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 340 aa  47.4  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0441778  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  38.05 
 
 		 477 aa  47.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0674  glycosyl transferase family 2  29.61 
 
 		 382 aa  47  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1256  glycosyl transferase family protein  24.23 
 
 		 240 aa  47  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000223583  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0353  glycosyl transferase family 2  25.49 
 
 		 312 aa  46.6  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000439981  normal  0.42611 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1910  glycosyl transferase family 2  24.77 
 
 		 622 aa  47  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00799183  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3137  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.86 
 
 		 325 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46761  normal  0.406504 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>