148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4939 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4939  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 227 aa  456  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2029  glycosyl transferase family protein  63.3 
 
 		 217 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.80207  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2238  glycosyl transferase family 2  63.01 
 
 		 218 aa  231  6e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3134  glycosyl transferase, group 2 family protein  54.3 
 
 		 217 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0455635  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2540  glycosyl transferase family protein  53.85 
 
 		 219 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409391 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5418  glycosyl transferase family protein  56.16 
 
 		 218 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39706  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3001  glycosyl transferase family protein  52.73 
 
 		 217 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5874  glycosyl transferase family protein  52.07 
 
 		 270 aa  195  6e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191955 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2639  glycosyl transferase family protein  48.91 
 
 		 232 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613658 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3256  glycosyl transferase, group 2 family protein  49.1 
 
 		 219 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0789044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2505  glycosyl transferase family protein  48.65 
 
 		 219 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2655  glycosyl transferase family protein  47.25 
 
 		 223 aa  174  9e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.584909  normal  0.786422 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1798  glycosyl transferase family protein  38.74 
 
 		 224 aa  142  3e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.521662  normal  0.0312048 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0557  glycosyl transferase family 2  43.97 
 
 		 250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0022  glycosyl transferase family protein  43.3 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.647116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20090  glycosyl transferase  37.71 
 
 		 255 aa  111  7.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.308185  normal  0.813225 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0337  glycosyl transferase family protein  39.47 
 
 		 273 aa  107  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0510  glycosyl transferase family 2  36.93 
 
 		 270 aa  102  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.319403  decreased coverage  0.000000276564 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10920  acylphosphatase  45.21 
 
 		 393 aa  98.2  9e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.551581  normal  0.319268 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2569  glycosyl transferase family 2  38.2 
 
 		 227 aa  95.1  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392565  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0203  glycosyl transferase family 2  38.86 
 
 		 225 aa  92.8  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.856102  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01090  uncharacterized LmbE-like protein  38.61 
 
 		 708 aa  85.5  6e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2977  glycosyl transferase family protein  33.47 
 
 		 390 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.707645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3270  glycosyl transferase family 2  34.05 
 
 		 247 aa  79  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141739  hitchhiker  0.0000443809 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1343  glycosyl transferase family protein  33.48 
 
 		 522 aa  75.9  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725214  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4582  glycosyl transferase family 2  30.83 
 
 		 386 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.077978 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0799  glycosyl transferase family 2  29.96 
 
 		 369 aa  71.2  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.958251 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4212  glycosyl transferase family protein  30.83 
 
 		 386 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.787376  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4727  glycosyl transferase family 2  30.95 
 
 		 386 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0134814 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9270  glycosyltransferase-like protein  34.13 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0560  glycosyl transferase family protein  32.73 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0578  glycosyl transferase family protein  28.35 
 
 		 419 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1200  glycosyl transferase family 2  28.96 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5890  glycosyl transferase family 2  31.28 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4101  glycosyl transferase family protein  28.35 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0116147  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2953  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 		 268 aa  57  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666852  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2919  glycosyl transferase family 2  27.73 
 
 		 384 aa  57  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.60146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1173  glycosyl transferase family 2  30.71 
 
 		 372 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3353  glycosyl transferase family protein  28.34 
 
 		 312 aa  53.9  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5107  glycosyl transferase family protein  30.2 
 
 		 364 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.120649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2088  AMP-dependent synthetase and ligase  30.73 
 
 		 807 aa  54.3  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0316  glycosyl transferase family protein  31.44 
 
 		 320 aa  53.5  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.982236 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1366  glycosyl transferase family protein  33.64 
 
 		 247 aa  52.8  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0119  glycosyl transferase family protein  33.65 
 
 		 232 aa  52.4  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2211  glycosyl transferase family protein  33.65 
 
 		 357 aa  52.4  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276702  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4143  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 		 291 aa  52  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.89997 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  31.78 
 
 		 337 aa  52  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0161  glycosyl transferase family 2  33.96 
 
 		 475 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  25.37 
 
 		 328 aa  51.2  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1447  glycosyl transferase family protein  32.69 
 
 		 233 aa  50.8  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0726839  normal  0.0201369 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0943  glycosyl transferase family 2  31.96 
 
 		 351 aa  51.2  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.799144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3596  glycosyl transferase family 2  28.46 
 
 		 418 aa  51.2  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1525  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 		 240 aa  50.8  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.201491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1549  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 240 aa  50.4  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0584416  normal  0.851188 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1394  glycosyl transferase family 2  28.51 
 
 		 362 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.295637 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1232  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 		 362 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1910  glycosyl transferase family 2  32.38 
 
 		 622 aa  49.3  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00799183  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3115  glycosyl transferase family 2  30.28 
 
 		 235 aa  49.3  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  29.9 
 
 		 345 aa  48.9  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1742  glycosyltransferase  27.36 
 
 		 281 aa  48.5  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00465779  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0058  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 337 aa  48.5  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.246717 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  29.05 
 
 		 1015 aa  48.5  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  27.31 
 
 		 236 aa  48.5  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1256  glycosyl transferase family protein  33.65 
 
 		 240 aa  47.8  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000223583  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3499  glycosyl transferase family 2  40 
 
 		 497 aa  48.1  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.802267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1810  glycosyl transferase family protein  29.32 
 
 		 513 aa  47.8  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0885657  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  29.81 
 
 		 1157 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2168  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 		 391 aa  47.8  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3738  glycosyl transferase family 2  32.69 
 
 		 279 aa  47.8  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  24.55 
 
 		 305 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3045  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 305 aa  47.4  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.144194  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0340  glycosyl transferase family 2  31.19 
 
 		 270 aa  47.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167181  normal  0.387021 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  28.43 
 
 		 315 aa  47.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0563  hypothetical protein  24.34 
 
 		 227 aa  46.6  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.559548  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05661  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  25.52 
 
 		 236 aa  46.2  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.287128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0968  hypothetical protein  34.62 
 
 		 235 aa  45.8  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.683686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1092  glycosyl transferase family protein  29.55 
 
 		 315 aa  45.4  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.221871  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4098  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  31.2 
 
 		 1148 aa  45.8  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3305  glycosyl transferase family protein  28.95 
 
 		 342 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3987  putative glycosyl transferase  33.33 
 
 		 344 aa  45.8  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4032  putative glycosyl transferase  33.33 
 
 		 344 aa  45.8  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0315657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  25.24 
 
 		 322 aa  45.4  0.0007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0300  glycosyl transferase family protein  32.08 
 
 		 322 aa  45.1  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0343  glycosyl transferase family protein  28.18 
 
 		 302 aa  45.1  0.0009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00301214  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3908  glycosyl transferase, WecB/TagA/CpsF family  28.05 
 
 		 907 aa  44.3  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1536  glycosyl transferase family 2  36.54 
 
 		 238 aa  45.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2889  glycosyltransferase-like  28.18 
 
 		 316 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0584  glycosyl transferase family protein  27.94 
 
 		 481 aa  44.3  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2807  putative glycosyl transferase  31.73 
 
 		 332 aa  45.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0445722 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3925  putative glycosyl transferase  33.33 
 
 		 344 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0071  glycosyl transferase family 2  22.86 
 
 		 236 aa  44.7  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  30.1 
 
 		 2401 aa  44.3  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0952  glycosyl transferase family 2  38.05 
 
 		 377 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0435  glycosyltransferase  28.7 
 
 		 512 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  31.78 
 
 		 672 aa  43.9  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2341  glycosyl transferase family protein  33.66 
 
 		 236 aa  44.3  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  23.97 
 
 		 289 aa  43.9  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03040  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.66 
 
 		 231 aa  44.3  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3906  putative glycosyl transferase  32.35 
 
 		 344 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.66206  normal  0.305957 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4093  putative glycosyl transferase  33.33 
 
 		 344 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>