158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3134 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3134  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 		 217 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0455635  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3001  glycosyl transferase family protein  91.71 
 
 		 217 aa  407  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2540  glycosyl transferase family protein  62.33 
 
 		 219 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409391 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5418  glycosyl transferase family protein  60.47 
 
 		 218 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39706  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2029  glycosyl transferase family protein  57.28 
 
 		 217 aa  223  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.80207  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2639  glycosyl transferase family protein  53.92 
 
 		 232 aa  221  6e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613658 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4939  glycosyl transferase family protein  54.3 
 
 		 227 aa  221  9e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2238  glycosyl transferase family 2  58.53 
 
 		 218 aa  221  9e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2505  glycosyl transferase family protein  52.53 
 
 		 219 aa  214  5e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3256  glycosyl transferase, group 2 family protein  52.53 
 
 		 219 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0789044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2655  glycosyl transferase family protein  53.7 
 
 		 223 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.584909  normal  0.786422 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5874  glycosyl transferase family protein  50.93 
 
 		 270 aa  204  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191955 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1798  glycosyl transferase family protein  42.92 
 
 		 224 aa  171  1e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.521662  normal  0.0312048 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0557  glycosyl transferase family 2  40.6 
 
 		 250 aa  133  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20090  glycosyl transferase  37.34 
 
 		 255 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.308185  normal  0.813225 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0022  glycosyl transferase family protein  40.09 
 
 		 234 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.647116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0337  glycosyl transferase family protein  35.68 
 
 		 273 aa  109  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0203  glycosyl transferase family 2  39.65 
 
 		 225 aa  105  7e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.856102  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0510  glycosyl transferase family 2  37.87 
 
 		 270 aa  104  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.319403  decreased coverage  0.000000276564 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01090  uncharacterized LmbE-like protein  35.1 
 
 		 708 aa  95.1  7e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3270  glycosyl transferase family 2  34.33 
 
 		 247 aa  92  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141739  hitchhiker  0.0000443809 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10920  acylphosphatase  33.6 
 
 		 393 aa  92  6e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.551581  normal  0.319268 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2569  glycosyl transferase family 2  32.3 
 
 		 227 aa  85.5  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392565  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0560  glycosyl transferase family protein  32.73 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0578  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 		 419 aa  72  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4101  glycosyl transferase family protein  28 
 
 		 390 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0116147  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2977  glycosyl transferase family protein  31.85 
 
 		 390 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.707645  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3138  glycosyltransferase  42.67 
 
 		 253 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259725  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3434  glycosyl transferase, group 2 family protein  42.67 
 
 		 253 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3205  glycosyltransferase  42.67 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150696  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4582  glycosyl transferase family 2  30.68 
 
 		 386 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.077978 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3459  glycosyl transferase, group 2 family protein  42.67 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0198533  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3232  glycosyl transferase, group 2 family protein  42.67 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0263281  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3446  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.67 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3442  glycosyl transferase, group 2 family protein  41.33 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.184184  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4727  glycosyl transferase family 2  30.12 
 
 		 386 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0134814 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  27.93 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  27.23 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4212  glycosyl transferase family protein  30.68 
 
 		 386 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.787376  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2360  glycosyl transferase family 2  31.79 
 
 		 354 aa  60.5  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.571738  normal  0.010101 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1366  glycosyl transferase family protein  35.85 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1343  glycosyl transferase family protein  31.86 
 
 		 522 aa  60.5  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725214  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0119  glycosyl transferase family protein  34.78 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0799  glycosyl transferase family 2  29.44 
 
 		 369 aa  58.9  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.958251 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  29.59 
 
 		 315 aa  58.5  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3596  glycosyl transferase family 2  28.97 
 
 		 418 aa  58.5  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1536  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 238 aa  57  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4464  glycosyl transferase family 2  28.14 
 
 		 335 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1742  glycosyltransferase  28.5 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00465779  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2333  glycosyl transferase family protein  26.94 
 
 		 327 aa  56.2  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.012677  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0487  glycosyl transferase family protein  24.74 
 
 		 284 aa  56.2  0.0000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.843285 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1200  glycosyl transferase family 2  29.12 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4777  glycosyl transferase family 2  32.61 
 
 		 393 aa  55.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.340207 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1173  glycosyl transferase family 2  29.8 
 
 		 372 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1256  glycosyl transferase family protein  33.66 
 
 		 240 aa  55.1  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000223583  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2370  glycosyltransferase  26.28 
 
 		 319 aa  54.7  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  24.88 
 
 		 333 aa  53.9  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1078  glycosyl transferase family protein  26.07 
 
 		 232 aa  53.1  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892634  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5107  glycosyl transferase family protein  27.67 
 
 		 364 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.120649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03040  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.16 
 
 		 231 aa  53.1  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  25.6 
 
 		 477 aa  52.8  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  27.6 
 
 		 1120 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1447  glycosyl transferase family protein  28.71 
 
 		 233 aa  52.8  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0726839  normal  0.0201369 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3115  glycosyl transferase family 2  26.96 
 
 		 235 aa  51.6  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1307  glycosyl transferase family protein  30.14 
 
 		 335 aa  51.6  0.000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1165  glycosyl transferase CpsO(V)  23.31 
 
 		 327 aa  51.2  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0353426  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  33.06 
 
 		 694 aa  51.6  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2334  glycosyl transferase family 2  35.51 
 
 		 417 aa  51.2  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.876722  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  25.36 
 
 		 345 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1704  glycosyl transferase family 2  39.73 
 
 		 398 aa  50.8  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3023  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.4 
 
 		 505 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1810  glycosyl transferase family protein  30.33 
 
 		 513 aa  50.1  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0885657  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2554  glycosyl transferase family 2  32.38 
 
 		 385 aa  50.1  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0219  glycosyl transferase family protein  24.88 
 
 		 247 aa  49.7  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9270  glycosyltransferase-like protein  26.53 
 
 		 243 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5289  glycosyl transferase family 2  25.99 
 
 		 403 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2328  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.73 
 
 		 466 aa  49.3  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.417791  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  30.19 
 
 		 479 aa  49.3  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0044  glycosyltransferase  40 
 
 		 352 aa  49.3  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117079  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  29.25 
 
 		 479 aa  49.3  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1675  glycosyl transferase family 2  25.84 
 
 		 415 aa  48.9  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2813  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.37 
 
 		 505 aa  48.5  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.188674  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2761  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.37 
 
 		 505 aa  48.5  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.022038  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2744  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.37 
 
 		 505 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.613025  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3026  group 2 family glycosyl transferase  32.37 
 
 		 505 aa  48.5  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.284753  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2042  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.73 
 
 		 466 aa  48.5  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2953  glycosyl transferase family protein  28.37 
 
 		 268 aa  48.5  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666852  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3021  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.37 
 
 		 505 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05340  Glycosyl transferase, family 2  29.2 
 
 		 321 aa  48.5  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000520172  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0140  glycosyl transferase family protein  29.59 
 
 		 244 aa  48.1  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  38.54 
 
 		 355 aa  47.8  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1913  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.98 
 
 		 382 aa  48.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0808  glycosyl transferase family 2  25.47 
 
 		 334 aa  47.4  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000227461  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0435  glycosyltransferase  32.56 
 
 		 512 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0058  glycosyl transferase family 2  28.8 
 
 		 337 aa  47.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.246717 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2124  glycosyl transferase family protein  38.04 
 
 		 340 aa  46.6  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  24.03 
 
 		 1002 aa  46.6  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3499  glycosyl transferase family 2  29.45 
 
 		 497 aa  46.6  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.802267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3266  glycosyl transferase family protein  29.31 
 
 		 301 aa  46.2  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.987947  normal  0.0247911 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0943  glycosyl transferase family 2  28.44 
 
 		 351 aa  46.6  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.799144  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>