58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4582 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4212  glycosyl transferase family protein  98.96 
 
 		 386 aa  730    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.787376  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4582  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 386 aa  739    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.077978 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4727  glycosyl transferase family 2  90.7 
 
 		 386 aa  634  1e-180  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0134814 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2977  glycosyl transferase family protein  69.13 
 
 		 390 aa  432  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.707645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3596  glycosyl transferase family 2  46.15 
 
 		 418 aa  276  3e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0578  glycosyl transferase family protein  43.84 
 
 		 419 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4101  glycosyl transferase family protein  43.01 
 
 		 390 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0116147  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0799  glycosyl transferase family 2  44.11 
 
 		 369 aa  183  3e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.958251 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1232  glycosyl transferase family protein  45.04 
 
 		 362 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1394  glycosyl transferase family 2  45.04 
 
 		 362 aa  164  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.295637 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5107  glycosyl transferase family protein  39.27 
 
 		 364 aa  164  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.120649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1173  glycosyl transferase family 2  45.67 
 
 		 372 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2919  glycosyl transferase family 2  34.46 
 
 		 384 aa  131  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.60146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2569  glycosyl transferase family 2  34.39 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392565  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0557  glycosyl transferase family 2  29.06 
 
 		 250 aa  72  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4939  glycosyl transferase family protein  30.83 
 
 		 227 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10920  acylphosphatase  33.84 
 
 		 393 aa  70.1  0.00000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.551581  normal  0.319268 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20090  glycosyl transferase  31.37 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.308185  normal  0.813225 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1798  glycosyl transferase family protein  27.35 
 
 		 224 aa  68.9  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.521662  normal  0.0312048 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2540  glycosyl transferase family protein  29.48 
 
 		 219 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409391 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5418  glycosyl transferase family protein  32.93 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39706  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3134  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.68 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0455635  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3270  glycosyl transferase family 2  30.53 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141739  hitchhiker  0.0000443809 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1343  glycosyl transferase family protein  35.27 
 
 		 522 aa  62.8  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725214  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2029  glycosyl transferase family protein  33.18 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.80207  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5874  glycosyl transferase family protein  29.6 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191955 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3001  glycosyl transferase family protein  29.08 
 
 		 217 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0337  glycosyl transferase family protein  30.41 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2639  glycosyl transferase family protein  27.02 
 
 		 232 aa  57  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613658 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0203  glycosyl transferase family 2  33.07 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.856102  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3256  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.69 
 
 		 219 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0789044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2505  glycosyl transferase family protein  28.35 
 
 		 219 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  29.49 
 
 		 236 aa  53.1  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0510  glycosyl transferase family 2  30.4 
 
 		 270 aa  51.6  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.319403  decreased coverage  0.000000276564 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0964  glycosyl transferase family protein  33.8 
 
 		 488 aa  50.8  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.824604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0022  glycosyl transferase family protein  27.95 
 
 		 234 aa  50.4  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.647116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3292  glycosyl transferase family 2  33.57 
 
 		 379 aa  50.4  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3738  glycosyl transferase family 2  32.31 
 
 		 279 aa  49.7  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2238  glycosyl transferase family 2  35.33 
 
 		 218 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0560  glycosyl transferase family protein  31.73 
 
 		 225 aa  48.5  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2236  glycosyl transferase family 2  26.7 
 
 		 343 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.92469 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2088  AMP-dependent synthetase and ligase  31.72 
 
 		 807 aa  48.5  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  28.35 
 
 		 304 aa  47.4  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2354  glycosyl transferase family protein  31.87 
 
 		 297 aa  47.4  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.358669  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0340  glycosyl transferase family 2  29.33 
 
 		 270 aa  46.2  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167181  normal  0.387021 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3353  glycosyl transferase family protein  26.99 
 
 		 312 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  28.24 
 
 		 235 aa  45.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1497  hypothetical protein  28.14 
 
 		 435 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1745  glycosyl transferase family 2  29.77 
 
 		 391 aa  44.3  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.298658  decreased coverage  0.00455743 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2174  polysaccharide-forming b-glycosyltransferase-like protein  27.23 
 
 		 376 aa  44.3  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.486335 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1818  glycosyl transferase family protein  32.82 
 
 		 335 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2655  glycosyl transferase family protein  26.59 
 
 		 223 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.584909  normal  0.786422 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3111  glycosyl transferase family protein  27.54 
 
 		 297 aa  43.5  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3171  glycosyl transferase family protein  27.54 
 
 		 297 aa  43.5  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.675731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  28.35 
 
 		 479 aa  43.5  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1781  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 		 326 aa  43.1  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.456914  normal  0.601286 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2935  family 2 glycosyl transferase  27.07 
 
 		 272 aa  43.1  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.231634 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0504  hypothetical protein  29.08 
 
 		 427 aa  43.1  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>