71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3596 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_3596  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
418 aa  829    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4582  glycosyl transferase family 2  46.39 
 
 
386 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.077978 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4727  glycosyl transferase family 2  46.18 
 
 
386 aa  271  1e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0134814 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4212  glycosyl transferase family protein  46.15 
 
 
386 aa  264  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.787376  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0578  glycosyl transferase family protein  44.2 
 
 
419 aa  253  6e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4101  glycosyl transferase family protein  41.78 
 
 
390 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0116147  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2977  glycosyl transferase family protein  43.58 
 
 
390 aa  227  3e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.707645  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0799  glycosyl transferase family 2  37.57 
 
 
369 aa  179  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.958251 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1173  glycosyl transferase family 2  42.32 
 
 
372 aa  159  6e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1394  glycosyl transferase family 2  40.51 
 
 
362 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.295637 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1232  glycosyl transferase family protein  40.22 
 
 
362 aa  146  6e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5107  glycosyl transferase family protein  38.99 
 
 
364 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.120649  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2919  glycosyl transferase family 2  30.59 
 
 
384 aa  113  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.60146  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10920  acylphosphatase  31.58 
 
 
393 aa  73.2  0.000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.551581  normal  0.319268 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3001  glycosyl transferase family protein  29.48 
 
 
217 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1798  glycosyl transferase family protein  26.8 
 
 
224 aa  66.6  0.0000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.521662  normal  0.0312048 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2505  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
219 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1343  glycosyl transferase family protein  35.61 
 
 
522 aa  65.1  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725214  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2569  glycosyl transferase family 2  31.47 
 
 
227 aa  65.1  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392565  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0557  glycosyl transferase family 2  28.73 
 
 
250 aa  64.3  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2639  glycosyl transferase family protein  26.69 
 
 
232 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.613658 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3256  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.88 
 
 
219 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0789044  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2540  glycosyl transferase family protein  26.09 
 
 
219 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.409391 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  31.25 
 
 
236 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3134  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.97 
 
 
217 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0455635  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2953  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
268 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666852  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5418  glycosyl transferase family protein  29.02 
 
 
218 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39706  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0337  glycosyl transferase family protein  28.35 
 
 
273 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9270  glycosyltransferase-like protein  29.46 
 
 
243 aa  54.3  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0560  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 
225 aa  53.5  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0022  glycosyl transferase family protein  25.87 
 
 
234 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.647116  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2655  glycosyl transferase family protein  26.48 
 
 
223 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.584909  normal  0.786422 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4939  glycosyl transferase family protein  28.46 
 
 
227 aa  51.2  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2158  glycosyltransferase  26.78 
 
 
452 aa  51.2  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5874  glycosyl transferase family protein  27.89 
 
 
270 aa  51.2  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.191955 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2088  AMP-dependent synthetase and ligase  29.02 
 
 
807 aa  50.8  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3738  glycosyl transferase family 2  34.45 
 
 
279 aa  49.7  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3270  glycosyl transferase family 2  27.47 
 
 
247 aa  49.3  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141739  hitchhiker  0.0000443809 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0065  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  31.62 
 
 
398 aa  49.7  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3652  glycosyl transferase family 2  28.89 
 
 
246 aa  49.3  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0575879  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0510  glycosyl transferase family 2  31.54 
 
 
270 aa  48.5  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.319403  decreased coverage  0.000000276564 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0212  glycosyl transferase  33.33 
 
 
382 aa  48.9  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000843162  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2029  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 
217 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.80207  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2926  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.49 
 
 
396 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.896752  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3115  glycosyl transferase family 2  29.1 
 
 
235 aa  48.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1960  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.63 
 
 
389 aa  47  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20090  glycosyl transferase  25.48 
 
 
255 aa  47  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.308185  normal  0.813225 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1283  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.8 
 
 
396 aa  46.6  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2239  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.63 
 
 
394 aa  47  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0978  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.63 
 
 
394 aa  47  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1265  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.63 
 
 
394 aa  47  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.949141  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3051  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.8 
 
 
396 aa  46.6  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.074487  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3110  glycosyl transferase family 2  26.16 
 
 
325 aa  46.6  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1461  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
239 aa  46.6  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0964  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
488 aa  46.2  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.824604  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3111  glycosyl transferase family protein  30.19 
 
 
297 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  25.21 
 
 
304 aa  46.6  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3171  glycosyl transferase family protein  30.19 
 
 
297 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.675731  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2238  glycosyl transferase family 2  30.13 
 
 
374 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  28.15 
 
 
260 aa  45.4  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  26.45 
 
 
235 aa  45.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1158  glycosyl transferase family protein  31.69 
 
 
403 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1868  glycosyl transferase family protein  30.81 
 
 
503 aa  45.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.790321  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1536  glycosyl transferase family 2  33.9 
 
 
238 aa  44.3  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1200  glycosyl transferase family 2  25.71 
 
 
237 aa  43.9  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0386  glycosyl transferase family protein  31.93 
 
 
393 aa  43.9  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.737923  normal  0.151625 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2238  glycosyl transferase family 2  30.92 
 
 
218 aa  43.5  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0119  glycosyl transferase family protein  31.93 
 
 
232 aa  43.5  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3474  glycosyl transferase family protein  33.78 
 
 
375 aa  43.5  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.288784  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2354  glycosyl transferase family protein  50.98 
 
 
297 aa  43.1  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.358669  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2190  glycosyl transferase family 2  40.3 
 
 
450 aa  43.1  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>