72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4101 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4101  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 390 aa  780    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0116147  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0578  glycosyl transferase family protein  73.25 
 
 		 419 aa  548  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3596  glycosyl transferase family 2  41.78 
 
 		 418 aa  230  3e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4582  glycosyl transferase family 2  46.74 
 
 		 386 aa  224  3e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.077978 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4727  glycosyl transferase family 2  46.9 
 
 		 386 aa  219  7e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0134814 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4212  glycosyl transferase family protein  45.36 
 
 		 386 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.787376  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2977  glycosyl transferase family protein  45.69 
 
 		 390 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.707645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0799  glycosyl transferase family 2  40.44 
 
 		 369 aa  177  4e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.958251 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1394  glycosyl transferase family 2  41.41 
 
 		 362 aa  149  7e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.295637 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1232  glycosyl transferase family protein  40.16 
 
 		 362 aa  145  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2919  glycosyl transferase family 2  34.08 
 
 		 384 aa  143  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.60146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1173  glycosyl transferase family 2  39.06 
 
 		 372 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5107  glycosyl transferase family protein  35.8 
 
 		 364 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.120649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2540  glycosyl transferase family protein  31.5 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409391 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10920  acylphosphatase  32.56 
 
 		 393 aa  76.3  0.0000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.551581  normal  0.319268 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1343  glycosyl transferase family protein  33.07 
 
 		 522 aa  73.2  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725214  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3256  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.56 
 
 		 219 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0789044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2505  glycosyl transferase family protein  30.16 
 
 		 219 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2639  glycosyl transferase family protein  29.92 
 
 		 232 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613658 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0557  glycosyl transferase family 2  30.92 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3134  glycosyl transferase, group 2 family protein  28 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0455635  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2569  glycosyl transferase family 2  30.92 
 
 		 227 aa  65.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392565  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1798  glycosyl transferase family protein  26.29 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.521662  normal  0.0312048 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3001  glycosyl transferase family protein  27.2 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3270  glycosyl transferase family 2  31.2 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141739  hitchhiker  0.0000443809 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0337  glycosyl transferase family protein  29.48 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2655  glycosyl transferase family protein  29.2 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.584909  normal  0.786422 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4939  glycosyl transferase family protein  28.35 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2088  AMP-dependent synthetase and ligase  33.77 
 
 		 807 aa  56.6  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0022  glycosyl transferase family protein  26.19 
 
 		 234 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.647116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5418  glycosyl transferase family protein  26.91 
 
 		 218 aa  54.7  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39706  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5874  glycosyl transferase family protein  27.18 
 
 		 270 aa  54.3  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191955 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2953  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 		 268 aa  54.3  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666852  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3738  glycosyl transferase family 2  31.08 
 
 		 279 aa  51.2  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3446  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.67 
 
 		 253 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9270  glycosyltransferase-like protein  27.68 
 
 		 243 aa  49.7  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2334  glycosyl transferase family 2  29.2 
 
 		 417 aa  48.5  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.876722  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4488  glycosyl transferase family 2  34.65 
 
 		 273 aa  48.5  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20090  glycosyl transferase  26.1 
 
 		 255 aa  48.5  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.308185  normal  0.813225 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4118  putative glycosyl transferase  27.5 
 
 		 344 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.910618  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3652  glycosyl transferase family 2  27.6 
 
 		 246 aa  48.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0575879  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4042  putative glycosyl transferase  27.5 
 
 		 344 aa  47.8  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.24261  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1256  glycosyl transferase family protein  29.92 
 
 		 240 aa  47.8  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000223583  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3205  glycosyltransferase  24 
 
 		 253 aa  47.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150696  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1411  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 		 424 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.584249 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3138  glycosyltransferase  23.33 
 
 		 253 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259725  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3434  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.5 
 
 		 253 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3459  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.33 
 
 		 253 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0198533  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1913  glycosyl transferase family 2  33.04 
 
 		 286 aa  46.6  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3232  glycosyl transferase, group 2 family protein  23.33 
 
 		 193 aa  46.6  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0263281  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01090  uncharacterized LmbE-like protein  26.32 
 
 		 708 aa  46.2  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2238  glycosyl transferase family 2  28.81 
 
 		 374 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03424  hypothetical protein  26.67 
 
 		 344 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.245637  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03473  predicted glycosyl transferase  26.67 
 
 		 344 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.320225  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  25.73 
 
 		 235 aa  45.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0090  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 		 344 aa  45.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0010  glycosyl transferase family protein  28.23 
 
 		 275 aa  45.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.591764  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0093  putative glycosyl transferase  26.67 
 
 		 344 aa  45.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.516407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1158  glycosyl transferase family protein  39.44 
 
 		 403 aa  44.3  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3827  putative glycosyl transferase  26.67 
 
 		 344 aa  44.3  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0526095  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0674  glycosyl transferase family 2  26.25 
 
 		 382 aa  44.3  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3951  putative glycosyl transferase  26.67 
 
 		 344 aa  44.3  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.174357  normal  0.660654 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0011  glycosyl transferase family 2  29.75 
 
 		 291 aa  43.9  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000912491 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0386  glycosyl transferase family protein  33.8 
 
 		 393 aa  43.9  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.737923  normal  0.151625 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4384  glycosyl transferase family protein  28.68 
 
 		 328 aa  43.9  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2029  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 		 217 aa  43.5  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.80207  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1675  glycosyl transferase family 2  24.09 
 
 		 415 aa  43.1  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0448  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 282 aa  43.1  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0726747  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3906  putative glycosyl transferase  25.74 
 
 		 344 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.66206  normal  0.305957 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0161  glycosyl transferase family 2  43.86 
 
 		 475 aa  43.1  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6545  glycosyl transferase family protein  47.27 
 
 		 293 aa  43.1  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.125421 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1447  glycosyl transferase family protein  23.39 
 
 		 233 aa  43.1  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0726839  normal  0.0201369 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>