55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5107 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5107  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
364 aa  699    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.120649  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1232  glycosyl transferase family protein  70.64 
 
 
362 aa  423  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1394  glycosyl transferase family 2  70.35 
 
 
362 aa  421  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.295637 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1173  glycosyl transferase family 2  66.02 
 
 
372 aa  418  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4727  glycosyl transferase family 2  40.42 
 
 
386 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0134814 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4582  glycosyl transferase family 2  39.27 
 
 
386 aa  164  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.077978 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4212  glycosyl transferase family protein  38.18 
 
 
386 aa  157  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.787376  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0799  glycosyl transferase family 2  41.96 
 
 
369 aa  148  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.958251 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3596  glycosyl transferase family 2  38.99 
 
 
418 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0578  glycosyl transferase family protein  39.61 
 
 
419 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2977  glycosyl transferase family protein  41.31 
 
 
390 aa  130  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.707645  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2919  glycosyl transferase family 2  34.52 
 
 
384 aa  129  9.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.60146  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4101  glycosyl transferase family protein  35.8 
 
 
390 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0116147  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2029  glycosyl transferase family protein  36.03 
 
 
217 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.80207  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2505  glycosyl transferase family protein  29.76 
 
 
219 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0557  glycosyl transferase family 2  31.99 
 
 
250 aa  71.2  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20090  glycosyl transferase  30.55 
 
 
255 aa  70.1  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.308185  normal  0.813225 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5874  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.191955 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3256  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.97 
 
 
219 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0789044  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1798  glycosyl transferase family protein  27.2 
 
 
224 aa  65.5  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.521662  normal  0.0312048 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2639  glycosyl transferase family protein  29.07 
 
 
232 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.613658 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10920  acylphosphatase  32.21 
 
 
393 aa  61.2  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.551581  normal  0.319268 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5418  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 
218 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39706  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2238  glycosyl transferase family 2  33.94 
 
 
218 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1343  glycosyl transferase family protein  30.89 
 
 
522 aa  59.3  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725214  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3001  glycosyl transferase family protein  29.15 
 
 
217 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0203  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 
225 aa  57.4  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.856102  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1040  glycosyl transferase family 2  30.71 
 
 
380 aa  55.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2655  glycosyl transferase family protein  28.46 
 
 
223 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.584909  normal  0.786422 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2540  glycosyl transferase family protein  26.1 
 
 
219 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.409391 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4939  glycosyl transferase family protein  30.2 
 
 
227 aa  53.9  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2088  AMP-dependent synthetase and ligase  31.56 
 
 
807 aa  53.1  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3134  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.67 
 
 
217 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0455635  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9270  glycosyltransferase-like protein  31.56 
 
 
243 aa  52.8  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2569  glycosyl transferase family 2  33.57 
 
 
227 aa  47.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392565  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0377  glycosyl transferase family 2  45.9 
 
 
523 aa  48.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0022  glycosyl transferase family protein  29.02 
 
 
234 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.647116  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3270  glycosyl transferase family 2  28.52 
 
 
247 aa  47.8  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141739  hitchhiker  0.0000443809 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5890  glycosyl transferase family 2  29.45 
 
 
301 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0510  glycosyl transferase family 2  32.03 
 
 
270 aa  46.6  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.319403  decreased coverage  0.000000276564 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0340  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
270 aa  45.4  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167181  normal  0.387021 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01090  uncharacterized LmbE-like protein  32.26 
 
 
708 aa  45.8  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0161  glycosyl transferase family 2  33.57 
 
 
475 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1562  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  41.54 
 
 
258 aa  44.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3652  glycosyl transferase family 2  30.48 
 
 
246 aa  44.3  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0575879  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3863  methyltransferase FkbM family  30 
 
 
792 aa  43.9  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0912765  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2627  hypothetical protein  23.3 
 
 
442 aa  43.9  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.855626 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3413  glycosyl transferase family 2  30.25 
 
 
263 aa  43.9  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3292  glycosyl transferase family 2  36.64 
 
 
379 aa  43.5  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3678  glycosyl transferase family 2  34.59 
 
 
289 aa  43.9  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  30.29 
 
 
836 aa  43.5  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0560  glycosyl transferase family protein  28.79 
 
 
225 aa  43.5  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4949  glycosyl transferase family 2  45.61 
 
 
385 aa  43.5  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000550956  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5883  glycosyl transferase family protein  29.34 
 
 
314 aa  43.5  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.692507 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0337  glycosyl transferase family protein  26.85 
 
 
273 aa  43.1  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>