43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2919 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2919  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
384 aa  802    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.60146  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0799  glycosyl transferase family 2  31.99 
 
 
369 aa  147  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.958251 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0578  glycosyl transferase family protein  32.36 
 
 
419 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4101  glycosyl transferase family protein  34.08 
 
 
390 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0116147  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4582  glycosyl transferase family 2  34.46 
 
 
386 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.077978 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1232  glycosyl transferase family protein  31.14 
 
 
362 aa  130  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1394  glycosyl transferase family 2  31.5 
 
 
362 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.295637 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4727  glycosyl transferase family 2  34.52 
 
 
386 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0134814 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5107  glycosyl transferase family protein  34.52 
 
 
364 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.120649  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4212  glycosyl transferase family protein  34.08 
 
 
386 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.787376  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1173  glycosyl transferase family 2  31.94 
 
 
372 aa  120  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3596  glycosyl transferase family 2  30.59 
 
 
418 aa  113  5e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2977  glycosyl transferase family protein  34.65 
 
 
390 aa  104  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.707645  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1343  glycosyl transferase family protein  31.01 
 
 
522 aa  94.7  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725214  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3001  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 
217 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9270  glycosyltransferase-like protein  25.5 
 
 
243 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0557  glycosyl transferase family 2  25.69 
 
 
250 aa  57  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4939  glycosyl transferase family protein  27.73 
 
 
227 aa  57  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7707  glycosyl transferase family protein  25.37 
 
 
889 aa  54.3  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  26.81 
 
 
260 aa  53.1  0.000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5418  glycosyl transferase family protein  24.29 
 
 
218 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39706  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1781  glycosyl transferase family 2  24.44 
 
 
326 aa  51.2  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.456914  normal  0.601286 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2540  glycosyl transferase family protein  24.8 
 
 
219 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.409391 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2505  glycosyl transferase family protein  24.71 
 
 
219 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2655  glycosyl transferase family protein  26.29 
 
 
223 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.584909  normal  0.786422 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  29.53 
 
 
311 aa  47.4  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10920  acylphosphatase  24.23 
 
 
393 aa  47  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.551581  normal  0.319268 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0337  glycosyl transferase family 2  26.04 
 
 
349 aa  46.6  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  22.62 
 
 
694 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2088  AMP-dependent synthetase and ligase  23.79 
 
 
807 aa  45.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3652  glycosyl transferase family 2  21.76 
 
 
246 aa  45.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0575879  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3134  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.7 
 
 
217 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0455635  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3256  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.5 
 
 
219 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0789044  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1447  glycosyl transferase family protein  26.15 
 
 
233 aa  43.9  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0726839  normal  0.0201369 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1291  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
351 aa  44.3  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0337  glycosyl transferase family protein  26.95 
 
 
273 aa  43.9  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0219  glycosyl transferase family protein  35.59 
 
 
247 aa  43.5  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0022  glycosyl transferase family protein  24.09 
 
 
234 aa  43.1  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.647116  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1742  glycosyltransferase  26.15 
 
 
281 aa  43.1  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00465779  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2935  family 2 glycosyl transferase  27.05 
 
 
272 aa  43.1  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.231634 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0335  glycosyl transferase family 2  22.81 
 
 
346 aa  42.7  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1536  glycosyl transferase family 2  28.35 
 
 
238 aa  42.7  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2029  glycosyl transferase family protein  28 
 
 
217 aa  42.7  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.80207  normal  0.710453 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>