59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4727 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_4727  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
386 aa  741    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0134814 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4212  glycosyl transferase family protein  90.7 
 
 
386 aa  641    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.787376  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4582  glycosyl transferase family 2  90.7 
 
 
386 aa  638    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.077978 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2977  glycosyl transferase family protein  71.99 
 
 
390 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.707645  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3596  glycosyl transferase family 2  45.96 
 
 
418 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0578  glycosyl transferase family protein  44.26 
 
 
419 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4101  glycosyl transferase family protein  43.36 
 
 
390 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0116147  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0799  glycosyl transferase family 2  43.59 
 
 
369 aa  183  4.0000000000000006e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.958251 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1232  glycosyl transferase family protein  46.54 
 
 
362 aa  169  6e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5107  glycosyl transferase family protein  40.42 
 
 
364 aa  167  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.120649  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1173  glycosyl transferase family 2  46.72 
 
 
372 aa  166  5e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1394  glycosyl transferase family 2  46.54 
 
 
362 aa  166  5e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.295637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2919  glycosyl transferase family 2  34.52 
 
 
384 aa  130  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.60146  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2569  glycosyl transferase family 2  34.16 
 
 
227 aa  75.5  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392565  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5418  glycosyl transferase family protein  32.79 
 
 
218 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39706  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10920  acylphosphatase  34.72 
 
 
393 aa  70.1  0.00000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.551581  normal  0.319268 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4939  glycosyl transferase family protein  30.95 
 
 
227 aa  69.7  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2540  glycosyl transferase family protein  29.2 
 
 
219 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.409391 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1798  glycosyl transferase family protein  27.46 
 
 
224 aa  67  0.0000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.521662  normal  0.0312048 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0557  glycosyl transferase family 2  28.68 
 
 
250 aa  65.5  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3270  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 
247 aa  63.9  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141739  hitchhiker  0.0000443809 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3134  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.12 
 
 
217 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0455635  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20090  glycosyl transferase  31.13 
 
 
255 aa  61.6  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.308185  normal  0.813225 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1343  glycosyl transferase family protein  34.85 
 
 
522 aa  61.2  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725214  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5874  glycosyl transferase family protein  28.23 
 
 
270 aa  60.5  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.191955 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0203  glycosyl transferase family 2  32.94 
 
 
225 aa  59.3  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.856102  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3001  glycosyl transferase family protein  28.8 
 
 
217 aa  57  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0337  glycosyl transferase family protein  31.34 
 
 
273 aa  56.6  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2029  glycosyl transferase family protein  31.92 
 
 
217 aa  55.8  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.80207  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2639  glycosyl transferase family protein  28.46 
 
 
232 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.613658 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  29.41 
 
 
236 aa  53.9  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0022  glycosyl transferase family protein  27.45 
 
 
234 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.647116  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2505  glycosyl transferase family protein  30.92 
 
 
219 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3256  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.08 
 
 
219 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0789044  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 
235 aa  52  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0510  glycosyl transferase family 2  30.83 
 
 
270 aa  50.4  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.319403  decreased coverage  0.000000276564 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1497  hypothetical protein  29.8 
 
 
435 aa  50.1  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2088  AMP-dependent synthetase and ligase  32.81 
 
 
807 aa  49.7  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3738  glycosyl transferase family 2  32.06 
 
 
279 aa  48.9  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 
304 aa  48.1  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2236  glycosyl transferase family 2  25.55 
 
 
343 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.92469 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3111  glycosyl transferase family protein  30.06 
 
 
297 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2354  glycosyl transferase family protein  31.18 
 
 
297 aa  47  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.358669  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3171  glycosyl transferase family protein  30.06 
 
 
297 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.675731  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0560  glycosyl transferase family protein  31.1 
 
 
225 aa  47  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2238  glycosyl transferase family 2  34.67 
 
 
218 aa  45.8  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0340  glycosyl transferase family 2  28.86 
 
 
270 aa  46.2  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167181  normal  0.387021 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1301  glycosyl transferase family 2  28.7 
 
 
637 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0504  hypothetical protein  30 
 
 
427 aa  44.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0119  glycosyl transferase family protein  29.46 
 
 
232 aa  45.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2935  family 2 glycosyl transferase  27.27 
 
 
272 aa  45.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.231634 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4125  glycosyl transferase family protein  24.14 
 
 
322 aa  44.3  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0619  glycosyl transferase family protein  29.55 
 
 
370 aa  44.7  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0964  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 
488 aa  44.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.824604  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02465  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  26.21 
 
 
309 aa  44.3  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.248238  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2174  polysaccharide-forming b-glycosyltransferase-like protein  26.99 
 
 
376 aa  43.9  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.486335 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1256  glycosyl transferase family protein  30.91 
 
 
240 aa  43.5  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000223583  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2655  glycosyl transferase family protein  28.74 
 
 
223 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.584909  normal  0.786422 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  25.31 
 
 
752 aa  43.1  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>