More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0902 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0902  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 
473 aa  960    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.864544  normal  0.582224 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0711  secretion protein HlyD  45.66 
 
 
382 aa  294  3e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.577453  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5071  RND family efflux transporter MFP subunit  40.16 
 
 
377 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212583  normal  0.0344609 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2359  RND family efflux transporter MFP subunit  41.06 
 
 
392 aa  251  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1596  HlyD family multidrug efflux protein  39.94 
 
 
371 aa  251  3e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.616153  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5362  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.58 
 
 
377 aa  248  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2436  RND family efflux transporter MFP subunit  39.43 
 
 
384 aa  247  4e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.66626  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6556  RND family efflux transporter MFP subunit  39.84 
 
 
399 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254371  normal  0.769115 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1828  secretion protein HlyD  42.05 
 
 
406 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5024  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.5 
 
 
381 aa  239  9e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.815107  normal  0.264656 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3107  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.33 
 
 
392 aa  239  9e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.32243 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3365  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.67 
 
 
391 aa  239  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.496799  normal  0.0176512 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6072  RND family efflux transporter MFP subunit  39.39 
 
 
399 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4972  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.92 
 
 
381 aa  238  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.956167  normal  0.110468 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4509  RND family efflux transporter MFP subunit  37.92 
 
 
381 aa  238  2e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5708  secretion protein HlyD  39.39 
 
 
429 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4669  RND family efflux transporter MFP subunit  38.46 
 
 
399 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.287204  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4867  cation/multidrug efflux system membrane protein  37.05 
 
 
411 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00045993  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2464  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.44 
 
 
390 aa  230  4e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1152  RND family efflux transporter MFP subunit  41.88 
 
 
426 aa  228  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.657671 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2644  RND family efflux transporter MFP subunit  37.6 
 
 
385 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4335  secretion protein HlyD  35.75 
 
 
410 aa  224  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.387273  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0739  RND family efflux transporter MFP subunit  36.34 
 
 
371 aa  224  3e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.580961  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2106  RND family efflux transporter MFP subunit  37.57 
 
 
408 aa  221  3e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.553946  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5137  RND family efflux transporter MFP subunit  38.07 
 
 
427 aa  220  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.259338 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3829  secretion protein HlyD  38.19 
 
 
387 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.192626  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4534  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.18 
 
 
424 aa  218  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.452412  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0849  RND efflux system membrane fusion protein  37.88 
 
 
418 aa  218  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.8894  decreased coverage  0.000437743 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3094  putative efflux transporter  38.55 
 
 
393 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000031387  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2103  hypothetical protein  36.57 
 
 
365 aa  216  9e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0385  putative auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  39.34 
 
 
408 aa  214  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0405  putative auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  39.34 
 
 
408 aa  214  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.738714  hitchhiker  0.0000278759 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0445  putative auxiliary transport protein membrane fusion protein (MFP) family  39.34 
 
 
408 aa  214  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000283487 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4918  RND family efflux transporter MFP subunit  36.65 
 
 
405 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.890764  normal  0.731397 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0383  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.34 
 
 
408 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000626257 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3014  secretion protein HlyD  36.65 
 
 
405 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5230  RND family efflux transporter MFP subunit  36.39 
 
 
405 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0639393  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4699  RND family efflux transporter MFP subunit  36.39 
 
 
405 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5352  RND family efflux transporter MFP subunit  36.65 
 
 
405 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730017  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0391  putative auxiliary transport protein membrane fusion protein (MFP) family  39.04 
 
 
408 aa  212  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000301381 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2878  RND family efflux transporter MFP subunit  35.84 
 
 
396 aa  212  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.247459  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1466  RND family efflux transporter MFP subunit  37.01 
 
 
409 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511584  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1840  RND family efflux transporter MFP subunit  37.01 
 
 
409 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4634  RND family efflux transporter MFP subunit  37.28 
 
 
429 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.562661  normal  0.24851 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0827  multidrug efflux pump BpeE  37.01 
 
 
406 aa  211  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.747872  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0295  HlyD family secretion protein  35.86 
 
 
405 aa  211  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2144  multidrug efflux pump BpeE  37.01 
 
 
406 aa  211  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0416  multidrug efflux pump BpeE  37.01 
 
 
406 aa  211  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4225  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.75 
 
 
436 aa  210  4e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3429  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.03 
 
 
399 aa  210  4e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4335  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.75 
 
 
436 aa  210  4e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.514202  normal  0.256174 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3579  putative transmembrane multidrug efflux system transmembrane protein  36.17 
 
 
414 aa  210  5e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1362  RND family efflux transporter MFP subunit  38.92 
 
 
418 aa  209  6e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.168892  decreased coverage  0.00389749 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2129  hypothetical protein  36.42 
 
 
368 aa  209  8e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0513  multidrug efflux pump BpeE  36.72 
 
 
409 aa  209  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2659  secretion protein HlyD  34.58 
 
 
417 aa  208  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2562  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.79 
 
 
416 aa  209  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0757424  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3304  secretion protein HlyD  40.6 
 
 
396 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0513  RND family efflux transporter MFP subunit  38.12 
 
 
435 aa  207  3e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.497794  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0142  RND family efflux transporter MFP subunit  35.88 
 
 
389 aa  206  5e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.285006 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5483  HlyD family secretion protein  35.99 
 
 
396 aa  207  5e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0155996  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4053  RND family efflux transporter MFP subunit  35.67 
 
 
414 aa  206  6e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1099  HlyD family secretion protein  33.99 
 
 
401 aa  206  7e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3238  secretion protein HlyD  36.64 
 
 
393 aa  206  9e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32400  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexE precursor  35.94 
 
 
414 aa  206  9e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2745  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexE precursor  35.68 
 
 
414 aa  205  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1619  AcrB/AcrD/AcrF family mulitdrug efflux protein  37.07 
 
 
386 aa  204  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2181  RND family efflux transporter MFP subunit  36.6 
 
 
412 aa  204  3e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.179253  normal  0.0467643 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3099  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  33.33 
 
 
414 aa  204  4e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.165228  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0715  RND family efflux transporter MFP subunit  34.44 
 
 
404 aa  204  4e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2891  RND efflux system membrane fusion protein  37.09 
 
 
391 aa  203  6e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.81851  normal  0.755183 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1152  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.01 
 
 
435 aa  202  7e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00127856  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0941  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.32 
 
 
419 aa  202  7e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.35175  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1112  transmembrane multidrug efflux system transmembrane protein  37.16 
 
 
438 aa  202  9e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.794261  normal  0.680549 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2967  secretion protein HlyD  33.7 
 
 
413 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400142  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4358  RND family efflux transporter MFP subunit  37.38 
 
 
421 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3353  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.58 
 
 
396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.462389  normal  0.0123154 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1349  RND family efflux transporter MFP subunit  37.35 
 
 
423 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2293  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.65 
 
 
430 aa  201  1.9999999999999998e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3096  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.78 
 
 
396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.219805 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4179  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.57 
 
 
420 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0646106  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0887  secretion protein HlyD  35.71 
 
 
398 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3425  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.61 
 
 
413 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1567  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.2 
 
 
408 aa  199  1.0000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.351926 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2337  RND family efflux transporter MFP subunit  33.61 
 
 
413 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1624  RND efflux membrane fusion protein precursor  37.39 
 
 
385 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000143743  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0320  RND family efflux transporter MFP subunit  36.8 
 
 
407 aa  198  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2639  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.56 
 
 
436 aa  198  2.0000000000000003e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3493  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexE  34.87 
 
 
476 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3045  RND family efflux transporter MFP subunit  36.39 
 
 
414 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.561818 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1792  secretion protein HlyD  34.67 
 
 
412 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.567297  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2448  RND family efflux transporter MFP subunit  34.44 
 
 
413 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773044  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2511  RND family efflux transporter MFP subunit  33.88 
 
 
413 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.504694  normal  0.653168 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2311  secretion protein HlyD  36.28 
 
 
413 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.592416  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1088  RND family efflux transporter MFP subunit  36.75 
 
 
392 aa  195  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0869  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexE precursor  35.88 
 
 
409 aa  195  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1902  secretion protein HlyD  35.93 
 
 
409 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.555792  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3921  RND family efflux transporter MFP subunit  35.47 
 
 
430 aa  194  3e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.439492 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3814  RND family efflux transporter MFP subunit  39.18 
 
 
414 aa  194  4e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.14573  normal  0.243008 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33860  multidrug efflux RND membrane protein, HlyD family  34.73 
 
 
412 aa  193  5e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>