72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_27570 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_27570  Protein of unknown function (DUF1469)  100 
 
 
138 aa  263  4e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1772  hypothetical protein  52.31 
 
 
151 aa  119  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1759  hypothetical protein  50 
 
 
151 aa  117  6e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0234108 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4481  protein of unknown function DUF1469  43.94 
 
 
157 aa  109  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.105215 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2275  hypothetical protein  50 
 
 
134 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2283  hypothetical protein  50 
 
 
134 aa  101  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.122746  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2236  hypothetical protein  50 
 
 
134 aa  101  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861722  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2137  hypothetical protein  44.96 
 
 
133 aa  91.3  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.375802  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2340  protein of unknown function DUF1469  40 
 
 
157 aa  87.8  5e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3353  protein of unknown function DUF1469  46.21 
 
 
145 aa  86.7  9e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34040  Protein of unknown function (DUF1469)  37.96 
 
 
140 aa  79.3  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0932  hypothetical protein  40.77 
 
 
133 aa  77  0.00000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6344  hypothetical protein  49.61 
 
 
133 aa  76.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.443827  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0334  hypothetical protein  48.78 
 
 
134 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4774  protein of unknown function DUF1469  50.83 
 
 
151 aa  74.3  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.487422  normal  0.301166 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1993  protein of unknown function DUF1469  47.97 
 
 
137 aa  71.6  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.122307  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2903  protein of unknown function DUF1469  45 
 
 
144 aa  70.1  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708128  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3512  protein of unknown function DUF1469  40.48 
 
 
132 aa  68.6  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.377984 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2992  hypothetical protein  34.11 
 
 
146 aa  67.4  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2073  protein of unknown function DUF1469  45.16 
 
 
137 aa  67.8  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6022  hypothetical protein  34.09 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3084  protein of unknown function DUF1469  33.06 
 
 
138 aa  63.5  0.0000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01420  Protein of unknown function (DUF1469)  38.26 
 
 
155 aa  63.5  0.0000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4218  protein of unknown function DUF1469  37.21 
 
 
132 aa  62.8  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0178  hypothetical protein  33.08 
 
 
149 aa  63.2  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6549  protein of unknown function DUF1469  41.94 
 
 
140 aa  62.8  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0142295  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0724  protein of unknown function DUF1469  30.58 
 
 
158 aa  60.1  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5428  hypothetical protein  34.43 
 
 
175 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1378  hypothetical protein  34.43 
 
 
169 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0194818  normal  0.100632 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0809  protein of unknown function DUF1469  33.58 
 
 
142 aa  56.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25370  Protein of unknown function (DUF1469)  30.47 
 
 
155 aa  55.5  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3560  hypothetical protein  31.62 
 
 
134 aa  56.2  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.462126  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1814  protein of unknown function DUF1469  47.97 
 
 
142 aa  54.7  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000011426  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1321  protein of unknown function DUF1469  33.86 
 
 
175 aa  54.7  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1591  hypothetical protein  37.31 
 
 
151 aa  54.7  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2383  putative integral membrane protein  36.51 
 
 
133 aa  54.7  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0168516  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1045  hypothetical protein  36.51 
 
 
133 aa  54.7  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0593921  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1384  protein of unknown function DUF1469  39.67 
 
 
148 aa  53.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000799445  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13700  transmembrane protein  33.33 
 
 
172 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0470389 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0555  protein of unknown function DUF1469  36 
 
 
180 aa  52  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000647144 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5356  protein of unknown function DUF1469  31.25 
 
 
171 aa  51.2  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.586134  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0221  hypothetical protein  35 
 
 
202 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.253727 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4599  hypothetical protein  29.85 
 
 
130 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0525  protein of unknown function DUF1469  41.94 
 
 
168 aa  50.4  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.822053  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4179  hypothetical protein  33.83 
 
 
136 aa  50.4  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.865834  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3925  protein of unknown function DUF1469  27.54 
 
 
171 aa  48.9  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.962598  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36060  Protein of unknown function (DUF1469)  28.46 
 
 
169 aa  48.5  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328772  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1438  protein of unknown function DUF1469  35.43 
 
 
130 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.157465  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1891  hypothetical protein  39.26 
 
 
133 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.373064  normal  0.485358 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0321  hypothetical protein  32.09 
 
 
163 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.202745  normal  0.194337 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4897  hypothetical protein  32.79 
 
 
170 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.912667  normal  0.0700179 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4811  hypothetical protein  32.79 
 
 
170 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.674359  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0051  protein of unknown function DUF1469  28.57 
 
 
142 aa  47.8  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5198  hypothetical protein  32.79 
 
 
170 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0142568  hitchhiker  0.000165751 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0561  protein of unknown function DUF1469  28.57 
 
 
142 aa  47  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1342  hypothetical protein  35.85 
 
 
308 aa  47  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.255297  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0260  protein of unknown function DUF1469  30.33 
 
 
155 aa  47  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.864061  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4294  hypothetical protein  32.28 
 
 
248 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.121888  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4815  protein of unknown function DUF1469  33.59 
 
 
131 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1247  hypothetical protein  32.56 
 
 
129 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.391441  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0475  hypothetical protein  38.1 
 
 
157 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5621  protein of unknown function DUF1469  30.34 
 
 
138 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.182455 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0417  protein of unknown function DUF1469  32.84 
 
 
165 aa  44.3  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0343446  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34600  hypothetical protein  30.51 
 
 
120 aa  44.3  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11370  Protein of unknown function (DUF1469)  63.89 
 
 
137 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4843  protein of unknown function DUF1469  38.02 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0258139  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1006  hypothetical protein  32.85 
 
 
149 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0515851  hitchhiker  0.00247908 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3869  hypothetical protein  37.21 
 
 
130 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.748627  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0344  hypothetical protein  27.41 
 
 
139 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0347  hypothetical protein  29.06 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06670  Protein of unknown function (DUF1469)  29.29 
 
 
307 aa  41.6  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1483  hypothetical protein  31.88 
 
 
145 aa  40.4  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000255218 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>