30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5356 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5356  protein of unknown function DUF1469  100 
 
 
171 aa  340  5e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.586134  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6022  hypothetical protein  37.4 
 
 
156 aa  76.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25370  Protein of unknown function (DUF1469)  30.14 
 
 
155 aa  59.3  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2340  protein of unknown function DUF1469  37.6 
 
 
157 aa  60.1  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0178  hypothetical protein  31.79 
 
 
149 aa  57.8  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2992  hypothetical protein  29.37 
 
 
146 aa  57  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1591  hypothetical protein  35.71 
 
 
151 aa  55.8  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27570  Protein of unknown function (DUF1469)  34.29 
 
 
138 aa  56.2  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0724  protein of unknown function DUF1469  34.31 
 
 
158 aa  53.9  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0221  hypothetical protein  31.71 
 
 
202 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.253727 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4481  protein of unknown function DUF1469  30.19 
 
 
157 aa  51.6  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.105215 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1321  protein of unknown function DUF1469  30.3 
 
 
175 aa  50.8  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0347  hypothetical protein  32.39 
 
 
140 aa  50.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0555  protein of unknown function DUF1469  33.61 
 
 
180 aa  50.4  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000647144 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1006  hypothetical protein  31.54 
 
 
149 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0515851  hitchhiker  0.00247908 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1384  protein of unknown function DUF1469  32.8 
 
 
148 aa  48.9  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000799445  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0051  protein of unknown function DUF1469  34.43 
 
 
142 aa  48.9  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0561  protein of unknown function DUF1469  34.43 
 
 
142 aa  48.5  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6549  protein of unknown function DUF1469  34.45 
 
 
140 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0142295  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1759  hypothetical protein  29.58 
 
 
151 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0234108 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3925  protein of unknown function DUF1469  28.24 
 
 
171 aa  45.8  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.962598  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1772  hypothetical protein  29.41 
 
 
151 aa  44.7  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5428  hypothetical protein  31.54 
 
 
175 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34600  hypothetical protein  30.83 
 
 
120 aa  42.4  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3084  protein of unknown function DUF1469  29.75 
 
 
138 aa  42.4  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0809  protein of unknown function DUF1469  30 
 
 
142 aa  42  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34040  Protein of unknown function (DUF1469)  32.81 
 
 
140 aa  42.4  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4774  protein of unknown function DUF1469  29.71 
 
 
151 aa  41.6  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.487422  normal  0.301166 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0321  hypothetical protein  31.01 
 
 
163 aa  41.2  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.202745  normal  0.194337 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4294  hypothetical protein  28.57 
 
 
248 aa  40.8  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.121888  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>