73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4481 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_4481  protein of unknown function DUF1469  100 
 
 
157 aa  306  5.9999999999999995e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.105215 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1772  hypothetical protein  56.39 
 
 
151 aa  139  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1759  hypothetical protein  56.06 
 
 
151 aa  137  6e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0234108 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3353  protein of unknown function DUF1469  52.23 
 
 
145 aa  123  9e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2340  protein of unknown function DUF1469  40.4 
 
 
157 aa  109  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0932  hypothetical protein  49.21 
 
 
133 aa  107  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4774  protein of unknown function DUF1469  58.47 
 
 
151 aa  100  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.487422  normal  0.301166 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27570  Protein of unknown function (DUF1469)  44.09 
 
 
138 aa  95.9  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2275  hypothetical protein  45.53 
 
 
134 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2073  protein of unknown function DUF1469  48.36 
 
 
137 aa  94.4  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2903  protein of unknown function DUF1469  42.86 
 
 
144 aa  93.2  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.708128  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2236  hypothetical protein  44.72 
 
 
134 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.861722  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2283  hypothetical protein  44.72 
 
 
134 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.122746  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34040  Protein of unknown function (DUF1469)  39.02 
 
 
140 aa  91.7  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3084  protein of unknown function DUF1469  37.4 
 
 
138 aa  92  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2137  hypothetical protein  42.06 
 
 
133 aa  90.9  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.375802  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1993  protein of unknown function DUF1469  48.44 
 
 
137 aa  86.3  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.122307  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6344  hypothetical protein  48.39 
 
 
133 aa  83.6  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.443827  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3512  protein of unknown function DUF1469  50.82 
 
 
132 aa  82.8  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.377984 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6022  hypothetical protein  36.05 
 
 
156 aa  80.5  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.569189  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2992  hypothetical protein  37.5 
 
 
146 aa  80.5  0.000000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0334  hypothetical protein  48.76 
 
 
134 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01420  Protein of unknown function (DUF1469)  37.58 
 
 
155 aa  77  0.00000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0809  protein of unknown function DUF1469  36.88 
 
 
142 aa  74.7  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4218  protein of unknown function DUF1469  39.53 
 
 
132 aa  73.2  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1321  protein of unknown function DUF1469  40.34 
 
 
175 aa  72.4  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1378  hypothetical protein  34.53 
 
 
169 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0194818  normal  0.100632 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6549  protein of unknown function DUF1469  37.7 
 
 
140 aa  70.9  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0142295  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5428  hypothetical protein  33.81 
 
 
175 aa  70.9  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0555  protein of unknown function DUF1469  35.97 
 
 
180 aa  69.7  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000647144 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0178  hypothetical protein  33.07 
 
 
149 aa  63.5  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0051  protein of unknown function DUF1469  36.09 
 
 
142 aa  60.5  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0561  protein of unknown function DUF1469  36.09 
 
 
142 aa  60.5  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0347  hypothetical protein  32.35 
 
 
140 aa  60.8  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13700  transmembrane protein  29.6 
 
 
172 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0470389 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0724  protein of unknown function DUF1469  31.73 
 
 
158 aa  60.5  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5198  hypothetical protein  31.76 
 
 
170 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0142568  hitchhiker  0.000165751 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0221  hypothetical protein  38.98 
 
 
202 aa  59.7  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.253727 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4811  hypothetical protein  31.76 
 
 
170 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.674359  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4897  hypothetical protein  31.76 
 
 
170 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.912667  normal  0.0700179 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4843  protein of unknown function DUF1469  44 
 
 
135 aa  58.9  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0258139  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1342  hypothetical protein  33.9 
 
 
308 aa  57.8  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.255297  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0344  hypothetical protein  32.14 
 
 
139 aa  57  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25370  Protein of unknown function (DUF1469)  35.59 
 
 
155 aa  55.8  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36060  Protein of unknown function (DUF1469)  30.33 
 
 
169 aa  55.5  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328772  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1045  hypothetical protein  33.08 
 
 
133 aa  54.7  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0593921  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0321  hypothetical protein  30.28 
 
 
163 aa  54.7  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.202745  normal  0.194337 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2383  putative integral membrane protein  33.08 
 
 
133 aa  54.7  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0168516  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3925  protein of unknown function DUF1469  29.61 
 
 
171 aa  54.3  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.962598  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1814  protein of unknown function DUF1469  43.65 
 
 
142 aa  53.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000011426  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1006  hypothetical protein  32.61 
 
 
149 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0515851  hitchhiker  0.00247908 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0131  hypothetical protein  30.53 
 
 
153 aa  51.2  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.241414  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4179  hypothetical protein  34.31 
 
 
136 aa  50.4  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.865834  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1891  hypothetical protein  30.95 
 
 
133 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.373064  normal  0.485358 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06670  Protein of unknown function (DUF1469)  36.07 
 
 
307 aa  49.7  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11370  Protein of unknown function (DUF1469)  42.28 
 
 
137 aa  48.9  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4294  hypothetical protein  28.57 
 
 
248 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.121888  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0417  protein of unknown function DUF1469  32.26 
 
 
165 aa  48.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0343446  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1384  protein of unknown function DUF1469  31.2 
 
 
148 aa  47.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000799445  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2210  hypothetical protein  33.33 
 
 
132 aa  48.1  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.554398  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3560  hypothetical protein  29.2 
 
 
134 aa  47  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.462126  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1378  protein of unknown function DUF1469  31.03 
 
 
284 aa  47  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000017645 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3054  hypothetical protein  30.56 
 
 
145 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0916548  normal  0.287496 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0525  protein of unknown function DUF1469  38.02 
 
 
168 aa  46.6  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.822053  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0475  hypothetical protein  35.58 
 
 
157 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1591  hypothetical protein  29.29 
 
 
151 aa  46.2  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4843  protein of unknown function DUF1469  38.96 
 
 
144 aa  44.7  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4232  protein of unknown function DUF1469  29.75 
 
 
145 aa  44.3  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645637  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34600  hypothetical protein  29.66 
 
 
120 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0210  hypothetical protein  29.69 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6667  hypothetical protein  43.45 
 
 
193 aa  42.4  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.126358  normal  0.676846 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5356  protein of unknown function DUF1469  30.19 
 
 
171 aa  40.8  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.586134  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5332  protein of unknown function DUF1469  36 
 
 
158 aa  40.8  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.113739 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>